A neutrofilek által közvetített gyulladásos bőrbetegségek genetikai felépítése (NEUTROSKIN)
2023. augusztus 21. frissítette: University Hospital, Basel, Switzerland
Esettanulmány a neutrofilek által közvetített gyulladásos bőrbetegségek genetikai felépítéséről
Ez a tanulmány számos ritka neutrofil dermatózis ritka, betegséget okozó mutációit kívánja azonosítani.
Az NMID és a genomban lévő variánsok közötti asszociációk azonosításához a következő generációs szekvenálást, főként a teljes exome szekvenálást alkalmazzuk.
Második megközelítésben a már ismert gyulladásos fehérjék expressziós szintjét vizsgáljuk bőrmintákban.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Toborzás
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
A ritka, súlyos gyulladásos bőrbetegségek eredete a bőrgyógyászatban nem kellően ismert.
Közös bennük a fagociták jelenléte és aktiválása, fájdalom, gyulladás és eltorzulás révén befolyásolják az életminőséget, és akár végzetes is lehet.
A tanulmány célja, hogy azokra az eredményekre építsen, amelyek szerint ezen neutrofil-mediált gyulladásos dermatózisok (NMID) közül többnek genetikai háttere van, és számos ritka neutrofil dermatózis ritka, betegséget okozó mutációit azonosítja.
Ez a nem klinikai eset-kontroll vizsgálat egy kutatási projekt biológiai anyagokkal és egészségügyi adatokkal.
Az NMID és a genomban lévő variánsok közötti asszociációk azonosításához a következő generációs szekvenálást, főként a teljes exome szekvenálást alkalmazzuk.
Második megközelítésben a már ismert gyulladásos fehérjék expressziós szintjét vizsgáljuk bőrmintákban.
Az adatok beszerzése és ellenőrzése szabványos módszerekkel történik, mint pl.
Nanosztring, RNS szekvenálás és qRT-polimeráz láncreakció (PCR), proteomikai vizsgálatok és immunhisztokémia, valamint áramlási citometria és képalkotó tömegcitometria, ELISA és Western Blot.
Tanulmány típusa
Megfigyelő
Beiratkozás (Becsült)
3370
Kapcsolatok és helyek
Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonszám: +41 61 265 40 84
- E-mail: alexander.navarini@usb.ch
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonszám: +41 61 328 55 45
- E-mail: emmanuel.contassot@usb.ch
Tanulmányi helyek
-
-
-
Basel, Svájc, 4031
- Toborzás
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Kutatásvezető:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Kapcsolatba lépni:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonszám: +41 61 265 40 84
- E-mail: alexander.navarini@usb.ch
-
Kapcsolatba lépni:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonszám: +41 61 328 55 45
- E-mail: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Részvételi kritériumok
A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
18 év (Felnőtt, Idősebb felnőtt)
Egészséges önkénteseket fogad
Igen
Mintavételi módszer
Valószínűségi minta
Tanulmányi populáció
A vizsgálatban résztvevőket nagyrészt a.) biobankokból prospektíven gyűjtött betegek biopsziáival vagy b.) klinikánk meglévő betegpopulációjának (FFPE szövetek) elemzésével, kapcsolatfelvételével és bevonásával/kizárásával.
Egészséges bőrt kapnak az USB-n plasztikai műtéten átesett betegek. Ezeket a betegeket a műtét előtt tájékoztatják, és beleegyezésüket meg kell szerezni.
Leírás
Bevételi kritériumok:
- a résztvevő írásbeli hozzájárulása
- betegség diagnosztizálása az NMID formacsoportban vagy a kontrollcsoport probandjában
Kizárási kritériumok a betegek számára:
- Hiányzik a tájékozott beleegyezés, ha a mintákat 2014 után gyűjtötték
- nincs NMID diagnózis
Kizárási kritériumok az egészséges kontrollokhoz:
- Hiányzik a tájékozott beleegyezés
Tanulási terv
Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Biobank- minták NMID betegektől
A Biobank Bázeli Bőrgyógyászati Unisztérium (USB) (Biobank USB) és a Zürichi Egyetemi Kórház Bőrgyógyászati Osztályának biobankjából (USZ) 600 NMID-betegek mintája kerül bele.
|
DNS-kinyerés vér- vagy nyálmintákból a génváltozatok azonosítására következő generációs szekvenálás segítségével;
RNS extrakció vér- és bőrmintákból nanosztring elemzésekhez, kvantitatív RT-PCR vagy RNS szekvenáláshoz.
A biobankban tárolt bőrmintákat immunfestéssel és képalkotó technikákkal elemzik, hogy azonosítsák a léziókban lévő sejttípusokat, és összehasonlítsák azokat az egészséges bőrrel.
A biobankban tárolt vér- és bőrmintákból izolált sejteket in vitro tenyésztjük, és a fehérjéket ELISA-val (szekréciós fehérjék) és Western blot-val (sejtfehérjék) elemzik.
|
|
Formalinnal fixált és paraffinba ágyazott (FFPE) minták
A Dermatology USB-ről 2014 előtt RNS- és fehérjeexpressziós elemzésekhez gyűjtött mintegy 50 formalin-fixált és paraffinba ágyazott (FFPE) mintát újra felhasználnak.
A kérdéses betegek tájékoztatást kapnak a vizsgálatról és mintáik kódolt felhasználásáról.
|
DNS-kinyerés vér- vagy nyálmintákból a génváltozatok azonosítására következő generációs szekvenálás segítségével;
RNS extrakció vér- és bőrmintákból nanosztring elemzésekhez, kvantitatív RT-PCR vagy RNS szekvenáláshoz.
A biobankban tárolt bőrmintákat immunfestéssel és képalkotó technikákkal elemzik, hogy azonosítsák a léziókban lévő sejttípusokat, és összehasonlítsák azokat az egészséges bőrrel.
A biobankban tárolt vér- és bőrmintákból izolált sejteket in vitro tenyésztjük, és a fehérjéket ELISA-val (szekréciós fehérjék) és Western blot-val (sejtfehérjék) elemzik.
|
|
Biobank- minták a kontrollokból
A Zürichi Egyetemi Kórház Bőrgyógyászati Osztályának (Biobank Dermatology USZ) biobankjából 2700 anonimizált kontrollgenom, valamint proteomikai megközelítéshez 150 anonimizált kontrollminta használható kontroll mintaként.
|
DNS-kinyerés vér- vagy nyálmintákból a génváltozatok azonosítására következő generációs szekvenálás segítségével;
RNS extrakció vér- és bőrmintákból nanosztring elemzésekhez, kvantitatív RT-PCR vagy RNS szekvenáláshoz.
A biobankban tárolt bőrmintákat immunfestéssel és képalkotó technikákkal elemzik, hogy azonosítsák a léziókban lévő sejttípusokat, és összehasonlítsák azokat az egészséges bőrrel.
A biobankban tárolt vér- és bőrmintákból izolált sejteket in vitro tenyésztjük, és a fehérjéket ELISA-val (szekréciós fehérjék) és Western blot-val (sejtfehérjék) elemzik.
|
|
Friss bőrminták egészséges donoroktól
Bőrhelyenként legfeljebb 20 friss bőrminta szükséges egészséges donoroktól.
Az egészséges önkéntesektől a vizsgálattal kapcsolatos tájékoztatás és a tájékozott beleegyezés megszerzése után kérik ki őket.
|
DNS-kinyerés vér- vagy nyálmintákból a génváltozatok azonosítására következő generációs szekvenálás segítségével;
RNS extrakció vér- és bőrmintákból nanosztring elemzésekhez, kvantitatív RT-PCR vagy RNS szekvenáláshoz.
A biobankban tárolt bőrmintákat immunfestéssel és képalkotó technikákkal elemzik, hogy azonosítsák a léziókban lévő sejttípusokat, és összehasonlítsák azokat az egészséges bőrrel.
A biobankban tárolt vér- és bőrmintákból izolált sejteket in vitro tenyésztjük, és a fehérjéket ELISA-val (szekréciós fehérjék) és Western blot-val (sejtfehérjék) elemzik.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Az NMID formáihoz kapcsolódó fehérjét kódoló ritka változatok száma
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
Az elsődleges végpont az újonnan azonosított vagy korábban bejelentett ritka génváltozatok és az NMID egy vagy több formája közötti összefüggés meghatározása. Az ilyen genetikai variánsok felfedezése a kóros bőr immunreakciókban szerepet játszó hibás molekuláris mechanizmusok azonosításához vezet ezeknél a betegeknél: - Statisztikailag szignifikáns összefüggés a genetikai adatok és az NMID között
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Képalkotó tömegcitometria
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
A másodlagos végpont a génváltozatok és az ezt követően kódolt fehérjék molekuláris és sejtszintű következményeinek meghatározása NMID-betegek bőrelváltozásaiban a fehérjekölcsönhatások és -hálózatok, immunsejtek, citokinek és receptorok NMID formáinak mérésével. A kiválasztott reakciófigyelési eredmények statisztikailag szignifikáns összefüggése, beleértve: - Képalkotó tömegcitometria
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
|
RNS expresszió
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
A másodlagos végpont a génváltozatok és az ezt követően kódolt fehérjék molekuláris és sejtszintű következményeinek meghatározása NMID-betegek bőrelváltozásaiban a fehérjekölcsönhatások és -hálózatok, immunsejtek, citokinek és receptorok NMID formáinak mérésével. A kiválasztott reakció-monitoring eredmények statisztikailag szignifikáns összefüggése, beleértve: - RNS expressziót
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
|
Az immunsejtek száma
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
A másodlagos végpont a génváltozatok és az ezt követően kódolt fehérjék molekuláris és sejtszintű következményeinek meghatározása az NMID-betegek bőrelváltozásaiban a fehérje kölcsönhatások és hálózatok, immunsejtek, citokinek és receptorok NMID formáinak mérésével. A kiválasztott reakció-monitoring eredmények statisztikailag szignifikáns összefüggése, beleértve: - Immunsejtszám
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
|
Fehérje mennyiségi meghatározása (ELISA)
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
A másodlagos végpont a génváltozatok és az ezt követően kódolt fehérjék molekuláris és sejtszintű következményeinek meghatározása az NMID-betegek bőrelváltozásaiban a fehérje kölcsönhatások és hálózatok, immunsejtek, citokinek és receptorok NMID formáinak mérésével. a kiválasztott reakció-megfigyelési eredmények statisztikailag szignifikáns összefüggése, beleértve: - Protein kvantifikáció (ELISA)
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
|
Az immunsejtek átlagos fluoreszcencia intenzitásának sebessége
Időkeret: egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
A másodlagos végpont a génváltozatok és az ezt követően kódolt fehérjék molekuláris és sejtszintű következményeinek meghatározása az NMID-betegek bőrelváltozásaiban a fehérje kölcsönhatások és hálózatok, immunsejtek, citokinek és receptorok NMID formáinak mérésével. a kiválasztott reakciómonitorozási eredmények statisztikailag szignifikáns összefüggése, beleértve: - Az immunsejtek átlagos fluoreszcencia intenzitása
|
egyszeri értékelés az alaphelyzetben
|
Együttműködők és nyomozók
Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.
Nyomozók
- Kutatásvezető: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Tanulmányi rekorddátumok
Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
2023. február 3.
Elsődleges befejezés (Becsült)
2029. szeptember 1.
A tanulmány befejezése (Becsült)
2029. szeptember 1.
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
2023. január 30.
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2023. február 8.
Első közzététel (Tényleges)
2023. február 17.
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
2023. augusztus 22.
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2023. augusztus 21.
Utolsó ellenőrzés
2023. augusztus 1.
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 2020-02645; sp19Navarini3
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Nem
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Nem
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .