Генетическая архитектура нейтрофильных воспалительных заболеваний кожи (NEUTROSKIN)
21 августа 2023 г. обновлено: University Hospital, Basel, Switzerland
Исследование случай-контроль генетической архитектуры нейтрофильных воспалительных заболеваний кожи
Это исследование направлено на выявление редких болезнетворных мутаций нескольких редких нейтрофильных дерматозов.
Для выявления ассоциаций между NMID и вариантами в геноме будет использоваться секвенирование следующего поколения, в основном секвенирование всего экзома.
Во втором подходе будет исследован уровень экспрессии уже известных воспалительных белков в образцах кожи.
Обзор исследования
Статус
Рекрутинг
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Происхождение редких тяжелых воспалительных заболеваний кожи в дерматологии изучено недостаточно.
Общим для них является наличие и активация фагоцитов, они влияют на качество жизни через боль, воспаление и деформацию и даже могут быть фатальными.
Это исследование предназначено для того, чтобы основываться на выводах о том, что некоторые из этих нейтрофильных воспалительных дерматозов (NMID) имеют генетическую основу, и для выявления редких болезнетворных мутаций нескольких редких нейтрофильных дерматозов.
Это неклиническое исследование случай-контроль представляет собой исследовательский проект с биологическим материалом и данными, связанными со здоровьем.
Для выявления ассоциаций между NMID и вариантами в геноме будет использоваться секвенирование следующего поколения, в основном секвенирование всего экзома.
Во втором подходе будет исследован уровень экспрессии уже известных воспалительных белков в образцах кожи.
Данные получают и проверяют с использованием стандартизированных методов, таких как, например,
Нанонити, секвенирование РНК и полимеразная цепная реакция (ПЦР) в реальном времени, протеомные анализы и иммуногистохимия, а также проточная цитометрия и визуализирующая масс-цитометрия, ИФА и Вестерн-блоттинг.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
3370
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Номер телефона: +41 61 265 40 84
- Электронная почта: alexander.navarini@usb.ch
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Emmanuel Contassot, Dr.
- Номер телефона: +41 61 328 55 45
- Электронная почта: emmanuel.contassot@usb.ch
Места учебы
-
-
-
Basel, Швейцария, 4031
- Рекрутинг
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Главный следователь:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Контакт:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Номер телефона: +41 61 265 40 84
- Электронная почта: alexander.navarini@usb.ch
-
Контакт:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Номер телефона: +41 61 328 55 45
- Электронная почта: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 18 лет до 100 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Да
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Участники исследования будут в основном набираться за счет а) проспективно собранных биопсий пациентов из биобанков или б) анализа, установления контактов и включения / исключения существующей популяции пациентов нашей клиники (ткани FFPE).
Здоровая кожа получается у пациентов, перенесших пластическую операцию в УСБ. Эти пациенты будут проинформированы, и их информированное согласие будет получено до операции.
Описание
Критерии включения:
- письменное согласие участника
- диагностика заболевания в группе НМИД или пробанда контрольной группы
Критерии исключения для пациентов:
- Отсутствие информированного согласия, если образцы были собраны после 2014 г.
- нет диагноза NMID
Критерии исключения для здоровых контролей:
- Отсутствие информированного согласия
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Биобанк – образцы пациентов с NMID
Будут включены 600 образцов от пациентов с NMID из биобанка дерматологии Unispital Basel (USB) (Biobank USB) и из биобанка отделения дерматологии университетской больницы Цюриха (USZ) (Biobank USZ).
|
Извлечение ДНК из образцов крови или слюны для идентификации вариантов генов путем секвенирования следующего поколения;
Извлечение РНК из образцов крови и кожи для анализа нанонити, количественной ОТ-ПЦР или секвенирования РНК.
Образцы кожи из биобанков будут проанализированы с помощью методов иммунного окрашивания и визуализации, чтобы определить типы клеток в очагах поражения и сравнить их со здоровой кожей.
Клетки, выделенные из биобанков крови и образцов кожи, будут культивироваться in vitro, а белки будут проанализированы с помощью ELISA (секретируемые белки) и вестерн-блоттинга (клеточные белки).
|
|
Образцы, фиксированные формалином и залитые парафином (FFPE)
Около 50 фиксированных формалином и залитых парафином (FFPE) образцов из Дерматологического USB, собранных до 2014 года для анализа экспрессии РНК и белка, будут повторно использованы.
Задаваемые пациенты информируются об исследовании и закодированном использовании их образцов.
|
Извлечение ДНК из образцов крови или слюны для идентификации вариантов генов путем секвенирования следующего поколения;
Извлечение РНК из образцов крови и кожи для анализа нанонити, количественной ОТ-ПЦР или секвенирования РНК.
Образцы кожи из биобанков будут проанализированы с помощью методов иммунного окрашивания и визуализации, чтобы определить типы клеток в очагах поражения и сравнить их со здоровой кожей.
Клетки, выделенные из биобанков крови и образцов кожи, будут культивироваться in vitro, а белки будут проанализированы с помощью ELISA (секретируемые белки) и вестерн-блоттинга (клеточные белки).
|
|
Биобанк – образцы контрольной группы
2700 анонимных контрольных геномов, а также 150 анонимных контрольных образцов для протеомного подхода могут быть использованы в качестве контрольных образцов из биобанка отделения дерматологии Университетской клиники Цюриха (Biobank Dermatology USZ).
|
Извлечение ДНК из образцов крови или слюны для идентификации вариантов генов путем секвенирования следующего поколения;
Извлечение РНК из образцов крови и кожи для анализа нанонити, количественной ОТ-ПЦР или секвенирования РНК.
Образцы кожи из биобанков будут проанализированы с помощью методов иммунного окрашивания и визуализации, чтобы определить типы клеток в очагах поражения и сравнить их со здоровой кожей.
Клетки, выделенные из биобанков крови и образцов кожи, будут культивироваться in vitro, а белки будут проанализированы с помощью ELISA (секретируемые белки) и вестерн-блоттинга (клеточные белки).
|
|
Образцы свежей кожи здоровых доноров
Для каждого участка кожи требуется не более 20 образцов свежей кожи от здоровых доноров.
Они будут запрошены у здоровых добровольцев после получения информации об исследовании и получения информированного согласия.
|
Извлечение ДНК из образцов крови или слюны для идентификации вариантов генов путем секвенирования следующего поколения;
Извлечение РНК из образцов крови и кожи для анализа нанонити, количественной ОТ-ПЦР или секвенирования РНК.
Образцы кожи из биобанков будут проанализированы с помощью методов иммунного окрашивания и визуализации, чтобы определить типы клеток в очагах поражения и сравнить их со здоровой кожей.
Клетки, выделенные из биобанков крови и образцов кожи, будут культивироваться in vitro, а белки будут проанализированы с помощью ELISA (секретируемые белки) и вестерн-блоттинга (клеточные белки).
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Количество редких вариантов, кодирующих белок, связанных с формами NMID
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Первичная конечная точка состоит в определении связи между недавно идентифицированными или ранее зарегистрированными вариантами редких генов и одной или несколькими формами NMID. Открытие таких генетических вариантов приведет к выявлению дефектных молекулярных механизмов, участвующих в аномальных кожных иммунных реакциях у этих пациентов: - Статистически значимая связь между генетическими данными и NMID
|
однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Масс-цитометрия изображений
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичная конечная точка будет заключаться в определении последствий на молекулярном и клеточном уровнях генных вариантов и впоследствии кодируемых белков в кожных поражениях у пациентов с NMID путем измерения белковых взаимодействий и сетей, иммунных клеток, цитокинов и рецепторов в формах NMID с помощью статистически значимая ассоциация результатов мониторинга выбранных реакций, включая: масс-цитометрию с визуализацией
|
однократная оценка на исходном уровне
|
|
Экспрессия РНК
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичная конечная точка будет заключаться в определении последствий на молекулярном и клеточном уровнях генных вариантов и впоследствии кодируемых белков в кожных поражениях у пациентов с NMID путем измерения белковых взаимодействий и сетей, иммунных клеток, цитокинов и рецепторов в формах NMID с помощью статистически значимая ассоциация результатов мониторинга выбранных реакций, включая: - экспрессию РНК
|
однократная оценка на исходном уровне
|
|
Количество иммунных клеток
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичная конечная точка будет заключаться в определении последствий на молекулярном и клеточном уровнях генных вариантов и впоследствии кодируемых белков в кожных поражениях у пациентов с NMID путем измерения белковых взаимодействий и сетей, иммунных клеток, цитокинов и рецепторов в формах NMID с помощью статистически значимая связь результатов мониторинга выбранных реакций, включая: - количество иммунных клеток;
|
однократная оценка на исходном уровне
|
|
Количественное определение белка (ИФА)
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичная конечная точка будет заключаться в определении последствий на молекулярном и клеточном уровнях генных вариантов и впоследствии кодируемых белков в кожных поражениях у пациентов с NMID путем измерения белковых взаимодействий и сетей, иммунных клеток, цитокинов и рецепторов в формах NMID с помощью статистически значимая ассоциация результатов мониторинга выбранных реакций, включая: - Количественное определение белка (ELISA)
|
однократная оценка на исходном уровне
|
|
Скорость средней интенсивности флуоресценции иммунных клеток
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
|
Вторичная конечная точка будет заключаться в определении последствий на молекулярном и клеточном уровнях генных вариантов и впоследствии кодируемых белков в кожных поражениях у пациентов с NMID путем измерения белковых взаимодействий и сетей, иммунных клеток, цитокинов и рецепторов в формах NMID с помощью статистически значимая связь результатов мониторинга выбранных реакций, включая: - среднюю интенсивность флуоресценции иммунных клеток;
|
однократная оценка на исходном уровне
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Следователи
- Главный следователь: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
3 февраля 2023 г.
Первичное завершение (Оцененный)
1 сентября 2029 г.
Завершение исследования (Оцененный)
1 сентября 2029 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
30 января 2023 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
8 февраля 2023 г.
Первый опубликованный (Действительный)
17 февраля 2023 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
22 августа 2023 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
21 августа 2023 г.
Последняя проверка
1 августа 2023 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2020-02645; sp19Navarini3
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .