Genetisk arkitektur för neutrofilmedierade inflammatoriska hudsjukdomar (NEUTROSKIN)
21 augusti 2023 uppdaterad av: University Hospital, Basel, Switzerland
Fallkontrollstudie av den genetiska arkitekturen hos neutrofilmedierade inflammatoriska hudsjukdomar
Denna studie är att identifiera sällsynta, sjukdomsframkallande mutationer av flera sällsynta neutrofila dermatoser.
För att identifiera samband mellan NMID och varianter i genomet kommer nästa generations sekvensering, huvudsakligen hela exomsekvensering, att användas.
I ett andra tillvägagångssätt kommer expressionsnivån av redan kända inflammatoriska proteiner i hudprover att undersökas.
Studieöversikt
Status
Rekrytering
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Ursprunget till sällsynta allvarliga inflammatoriska hudsjukdomar inom dermatologi är otillräckligt känt.
De har gemensamt närvaron och aktiveringen av fagocyter, påverkar livskvaliteten genom smärta och inflammation och vanställning, och kan till och med vara dödlig.
Denna studie är avsedd att bygga vidare på fynden att flera av dessa neutrofilmedierade inflammatoriska dermatoser (NMID) har en genetisk bakgrund och att identifiera sällsynta, sjukdomsframkallande mutationer av flera sällsynta neutrofila dermatoser.
Denna icke-kliniska fall-kontrollstudie är ett forskningsprojekt med biologiskt material och hälsorelaterade data.
För att identifiera samband mellan NMID och varianter i genomet kommer nästa generations sekvensering, huvudsakligen hela exomsekvensering, att användas.
I ett andra tillvägagångssätt kommer expressionsnivån av redan kända inflammatoriska proteiner i hudprover att undersökas.
Uppgifterna inhämtas och verifieras med hjälp av standardiserade metoder som t.ex.
Nanostring, RNA-sekvensering och qRT-polymeraskedjereaktion (PCR), proteomikanalyser och immunhistokemi samt flödescytometri och avbildning av masscytometri, ELISA och Western Blot.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Beräknad)
3370
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studiekontakt
- Namn: Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 265 40 84
- E-post: alexander.navarini@usb.ch
Studera Kontakt Backup
- Namn: Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonnummer: +41 61 328 55 45
- E-post: emmanuel.contassot@usb.ch
Studieorter
-
-
-
Basel, Schweiz, 4031
- Rekrytering
- University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
-
Huvudutredare:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
-
Kontakt:
- Alexander Navarini, Prof. Dr. med.
- Telefonnummer: +41 61 265 40 84
- E-post: alexander.navarini@usb.ch
-
Kontakt:
- Emmanuel Contassot, Dr.
- Telefonnummer: +41 61 328 55 45
- E-post: emmanuel.contassot@usb.ch
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
18 år till 100 år (Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
Ja
Testmetod
Sannolikhetsprov
Studera befolkning
Studiedeltagarna kommer till stor del att rekryteras genom att a.) prospektivt insamlade biopsier av patienter från biobanker eller b.) analysera, kontakta och inkludera/exkludera den befintliga patientpopulationen på vår klinik (FFPE-vävnader).
Frisk hud erhålls från patienter som genomgår plastikkirurgi vid USB. Dessa patienter kommer att informeras och deras informerade samtycke erhållas före operationen.
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- skriftligt samtycke från den deltagande personen
- diagnos av en sjukdom i NMID-formgruppen eller proband i kontrollgruppen
Uteslutningskriterier för patienter:
- Informerat samtycke saknas om prover samlats in efter 2014
- ingen diagnos av NMID
Uteslutningskriterier för friska kontroller:
- Saknar informerat samtycke
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Biobank- prover från NMID-patienter
600 prover från NMID-patienter från Biobank Dermatology Unispital Basel (USB) (Biobank USB) och från biobanken vid dermatologiska avdelningen vid universitetssjukhuset Zürich (USZ) (Biobank USZ) kommer att inkluderas.
|
DNA-extraktion från blod- eller salivprover för identifiering av genvarianter genom nästa generations sekvensering;
RNA-extraktion från blod- och hudprover för Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankade hudprover kommer att analyseras med immunfärgnings- och bildbehandlingstekniker för att identifiera celltyper i lesioner och jämföra dem med frisk hud.
Celler isolerade från biobankade blod- och hudprover kommer att odlas in vitro och proteiner kommer att analyseras med ELISA (utsöndrade proteiner) och western blot (cellproteiner).
|
|
Formalinfixerade och paraffininbäddade (FFPE) prover
Cirka 50 av formalinfixerade och paraffininbäddade (FFPE) prover från Dermatology USB som samlats in före 2014 för RNA- och proteinexpressionsanalyser kommer att återanvändas.
Patienterna i frågorna informeras om studien och den kodade användningen av deras prover.
|
DNA-extraktion från blod- eller salivprover för identifiering av genvarianter genom nästa generations sekvensering;
RNA-extraktion från blod- och hudprover för Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankade hudprover kommer att analyseras med immunfärgnings- och bildbehandlingstekniker för att identifiera celltyper i lesioner och jämföra dem med frisk hud.
Celler isolerade från biobankade blod- och hudprover kommer att odlas in vitro och proteiner kommer att analyseras med ELISA (utsöndrade proteiner) och western blot (cellproteiner).
|
|
Biobank- prover från kontroller
2 700 anonymiserade kontrollgenom samt 150 anonymiserade kontrollprover för proteomikmetoden kan användas som kontrollprov från biobanken vid dermatologiska avdelningen vid universitetssjukhuset Zürich (Biobank Dermatology USZ).
|
DNA-extraktion från blod- eller salivprover för identifiering av genvarianter genom nästa generations sekvensering;
RNA-extraktion från blod- och hudprover för Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankade hudprover kommer att analyseras med immunfärgnings- och bildbehandlingstekniker för att identifiera celltyper i lesioner och jämföra dem med frisk hud.
Celler isolerade från biobankade blod- och hudprover kommer att odlas in vitro och proteiner kommer att analyseras med ELISA (utsöndrade proteiner) och western blot (cellproteiner).
|
|
Färska hudprover från friska donatorer
Maximalt 20 färska hudprover från friska donatorer krävs per hudplats.
De kommer att begäras av friska frivilliga efter information om studien och efter att ha fått det informerade samtycket.
|
DNA-extraktion från blod- eller salivprover för identifiering av genvarianter genom nästa generations sekvensering;
RNA-extraktion från blod- och hudprover för Nanostring-analyser, kvantitativ RT-PCR eller RNA-sekvensering.
Biobankade hudprover kommer att analyseras med immunfärgnings- och bildbehandlingstekniker för att identifiera celltyper i lesioner och jämföra dem med frisk hud.
Celler isolerade från biobankade blod- och hudprover kommer att odlas in vitro och proteiner kommer att analyseras med ELISA (utsöndrade proteiner) och western blot (cellproteiner).
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Antal proteinkodande sällsynta varianter associerade med former av NMID
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det primära effektmåttet består i bestämning av samband mellan nyligen identifierade eller tidigare rapporterade sällsynta genvarianter och en eller flera former av NMID. Upptäckten av sådana genetiska varianter kommer att leda till identifieringen av defekta molekylära mekanismer involverade i onormala kutana immunreaktioner hos dessa patienter: - Statistiskt signifikant samband mellan genetiska data och NMID
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Imaging masscytometri
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det sekundära effektmåttet kommer att bestå i bestämning av konsekvenser på molekylära och cellulära nivåer av genvarianter och därefter kodade proteiner i de kutana lesionerna från NMID-patienter genom mätning av proteininteraktioner och nätverk, immunceller, cytokiner och receptorer i form av NMID genom att statistiskt signifikant samband mellan utvalda reaktionsövervakningsresultat inklusive: - Bildmassacytometri
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
|
RNA-uttryck
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det sekundära effektmåttet kommer att bestå i bestämning av konsekvenser på molekylära och cellulära nivåer av genvarianter och därefter kodade proteiner i de kutana lesionerna från NMID-patienter genom mätning av proteininteraktioner och nätverk, immunceller, cytokiner och receptorer i form av NMID genom att statistiskt signifikant association av utvalda reaktionsövervakningsresultat inklusive: - RNA-uttryck
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
|
Antal immunceller
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det sekundära effektmåttet kommer att bestå i bestämning av konsekvenser på molekylära och cellulära nivåer av genvarianter och därefter kodade proteiner i de kutana lesionerna från NMID-patienter genom mätning av proteininteraktioner och nätverk, immunceller, cytokiner och receptorer i form av NMID genom att statistiskt signifikant samband mellan utvalda reaktionsövervakningsresultat inklusive: - Antal immunceller
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
|
Proteinkvantifiering (ELISA)
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det sekundära effektmåttet kommer att bestå i bestämning av konsekvenser på molekylära och cellulära nivåer av genvarianter och därefter kodade proteiner i de kutana lesionerna från NMID-patienter genom mätning av proteininteraktioner och nätverk, immunceller, cytokiner och receptorer i form av NMID genom att statistiskt signifikant samband mellan utvalda reaktionsövervakningsresultat inklusive: - Proteinkvantifiering (ELISA)
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
|
Hastighet för medelfluorescensintensitet hos immunceller
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
|
Det sekundära effektmåttet kommer att bestå i bestämning av konsekvenser på molekylära och cellulära nivåer av genvarianter och därefter kodade proteiner i de kutana lesionerna från NMID-patienter genom mätning av proteininteraktioner och nätverk, immunceller, cytokiner och receptorer i form av NMID genom att statistiskt signifikant samband mellan utvalda reaktionsövervakningsresultat inklusive: - Genomsnittlig fluorescensintensitet hos immunceller
|
engångsbedömning vid baslinjen
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Utredare
- Huvudutredare: Alexander Navarini, Prof. Dr. med., University Hospital Basel, Clinic of Dermatology
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
3 februari 2023
Primärt slutförande (Beräknad)
1 september 2029
Avslutad studie (Beräknad)
1 september 2029
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
30 januari 2023
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
8 februari 2023
Första postat (Faktisk)
17 februari 2023
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
22 augusti 2023
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
21 augusti 2023
Senast verifierad
1 augusti 2023
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 2020-02645; sp19Navarini3
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .