進行性/手術不能な固形腫瘍患者における次世代シークエンシング（NGS）および患者由来腫瘍オルガノイド（PDO）誘導療法の前向き臨床検証 (PDO)

インフォームドコンセントの下、患者は組織サンプリング（放射線検査、内視鏡検査、または外科的切除）を受けます。 DNA は組織から抽出され、全エクソーム シーケンス (WES)、オルガノイド培養、および薬物検査に送られます。 PDO モデルの DNA 変異は、全エクソーム シーケンス (WES) を使用して決定されます。 変異負荷およびドライバー遺伝子プロファイルは、原発がんで同定されたものとの類似性について評価されます。 生成された遺伝子データは、FDA 承認の分子標的薬への反応について解釈されます。 研究者は、利用可能な化学療法の選択肢に耐性のある PDO 培養物を研究することになります。 これらは、標的薬剤に対する感受性を研究する上で非常に価値があり、化学療法抵抗性疾患の代替治療選択肢を提供するでしょう。 プロジェクトチームは過去の経験に基づいて、この分野における標準運用プロトコル（SOP）を開発し、ゲノムデータとの統合解析におけるパイプラインを確立しました。 PDO 培養とゲノムに基づく薬物スクリーニング [12] 当社のプラットフォームの臨床的有用性を確保するために、研究者は有意義な期間内に各 PDO の薬物オプションを提供することを目指しています。 通常 4 ～ 6 週間のこの枠組みで、研究者はオルガノイドを生成し、その分子プロファイルを研究し、患者ごとに治療法を個別化できる体外薬物スクリーニングに着手します。 適格な患者は MDT 委員会に参加し、患者の病歴、検査結果、および放射線検査の結果が検討されます。 治験参加に対するインフォームドコンセントを得た上で、患者は腫瘍の組織サンプリングを受けます（放射線法、内視鏡法、または外科的方法による）。 次に、サンプリングされた腫瘍は、全エクソーム配列決定、オルガノイド培養、薬物スクリーニングのための DNA 抽出に供されます。 これには 2 ～ 4 週間かかります。 暫定期間では、患者は生検の時点から薬物スクリーニングの結果が得られるまでの間に、化学療法剤、標的薬剤、またはホルモン療法を受けることが許可されます。 MDT は薬物スクリーニングの結果を検討し、PDO で反応が得られた薬物の使用を推奨します。 いくつかの薬剤が有効であることが示された場合、紹介する腫瘍学者は化学療法剤または標的薬剤の選択に関する最終的な裁量権を有します。

腫瘍評価はベースラインで 8 週間ごとに実行されます。 研究者は、NCI CTCAE の定義に基づいて、すべての有害事象および重篤な有害事象を報告します。 捜査官は、すべての SAE を発生後 24 時間以内に NTEC-CUHK 合同 CREC に報告します。 CREC の上級医師はすべての SAE を裁定しました。

研究者らは、従来の化学療法に抵抗性の手術不能または進行性固形腫瘍患者におけるNGS/PDO薬物スクリーニング誘導治療の臨床効果を判定することを目的としている。 研究者らは、これらの患者における生体外での PDO 薬物反応と臨床反応を相関させます。 私たちの仮説は、WES と PDO 薬剤スクリーニングにより、腫瘍サイズを縮小し、これらの患者に利益をもたらす候補薬剤を正確に特定できるというものです。

研究者らは、標準治療による治療反応は約 10% であると想定しています。 PDO および NGS に基づく治療により、反応率は約 30% 以上に改善される可能性があります。 第 1 段階では、10 人の患者が登録されます。これらの 10 人の患者で反応が 1 人以下の場合、研究は中止されます。 それ以外の場合、さらに 19 人の患者が発生し、合計 29 人になります。 29 人の患者で 6 つ以上の応答が観察された場合、帰無仮説は棄却されます。 この設計では、タイプ 1 のエラー率が 0.05、検出力が 80% になります。 研究者らは、患者の約20％でPDO培養が成功しないと想定して、2年間にわたって40人以上の患者を登録する計画を立てている。