Validação clínica prospectiva de sequenciamento de próxima geração (NGS) e terapia guiada por organoides tumorais derivados do paciente (PDO) em pacientes com tumores sólidos avançados/inoperáveis (PDO)

Sob consentimento informado, os pacientes são submetidos a amostragem de tecido (excisão radiológica, endoscópica ou cirúrgica). O DNA é extraído do tecido e enviado para sequenciamento do exoma completo (WES), cultura organoide e teste de drogas. Mutações de DNA em modelos PDO serão determinadas usando sequenciamento de exoma completo (WES). A carga mutacional e o perfil dos genes condutores serão avaliados quanto a semelhanças com aqueles identificados em cânceres primários. Os dados genéticos gerados serão interpretados para resposta a medicamentos de direcionamento molecular aprovados pela FDA. Os investigadores estudariam culturas DOP resistentes às opções quimioterápicas disponíveis. Seriam de valor excepcional para estudar a sensibilidade aos agentes alvo, fornecendo opções alternativas de tratamento para doenças quimio-refratárias. Com base na experiência anterior, a equipe do projeto desenvolveu um Protocolo Operacional Padrão (SOP) na área e estabeleceu um pipeline de análise integrativa com dados do genoma. Triagem de medicamentos guiada por cultura e genoma de PDO [12] Para garantir a utilidade clínica de nossa plataforma, os investigadores pretendem fornecer opções de medicamentos de cada PDO dentro de um prazo significativo. Neste quadro de normalmente 4-6 semanas, os investigadores devem gerar organóides, estudar seu perfil molecular e realizar triagem de medicamentos ex vivo que nos permitiria individualizar a terapia para cada paciente. Os pacientes elegíveis são atendidos em um conselho de MDT, onde o histórico do caso, os resultados laboratoriais e radiológicos dos pacientes são revisados. Com consentimento informado para participação no estudo, o paciente é submetido a amostragem de tecido de seu tumor (por métodos radiológicos, endoscópicos ou cirúrgicos). Os tumores amostrados são então submetidos à extração de DNA para sequenciamento completo do exoma, cultura organoide e triagem de drogas. Isso leva de 2 a 4 semanas. Nesse período intermediário, o paciente pode receber um agente quimioterápico, um agente alvo ou terapia hormonal entre o momento da biópsia e a disponibilidade dos resultados do exame de drogas. Um MDT analisará os resultados do exame de drogas e recomendará o uso de um medicamento com resposta em um DOP. Quando vários medicamentos se mostram eficazes, o oncologista responsável tem o critério final na escolha do agente quimioterápico ou alvo.

As avaliações do tumor serão realizadas no início do estudo, a cada 8 semanas. Os investigadores relatam todos os eventos adversos e eventos adversos graves com base nas definições do NCI CTCAE. Os investigadores relatam todos os SAEs ao CREC conjunto NTEC-CUHK dentro de 24 horas após sua ocorrência. Médicos seniores do CREC julgaram todos os SAEs.

Os investigadores pretendem determinar a eficácia clínica do tratamento guiado por triagem de drogas NGS/PDO em pacientes com tumores sólidos inoperáveis/avançados refratários à quimioterapia convencional. Os investigadores correlacionam a resposta do medicamento PDO ex vivo à resposta clínica nesses pacientes. Nossa hipótese é que a triagem de medicamentos WES e PDO pode identificar com precisão os medicamentos candidatos que reduzirão o tamanho do tumor e conferirão benefícios nesses pacientes.

Os investigadores presumem que uma resposta ao tratamento com o tratamento padrão será em torno de 10%. Um tratamento guiado por PDO e NGS provavelmente melhorará a taxa de resposta para cerca de 30% ou mais. Na primeira etapa serão contabilizados 10 pacientes, caso haja uma ou menos resposta, nesses 10 pacientes o estudo será interrompido. Caso contrário, serão contabilizados mais 19 pacientes, totalizando 29. A hipótese nula será rejeitada se forem observadas 6 ou mais respostas em 29 pacientes. Este projeto produz uma taxa de erro tipo 1 de 0,05 e um poder de 80%. Os investigadores planejam inscrever 40 ou mais pacientes durante um período de 2 anos, com a suposição de que em cerca de 20% dos pacientes, a cultura PDO não teve sucesso.