A következő generációs szekvenálás (NGS) és a páciensből származó tumororganoidok (PDO) irányított terápiája előrehaladott/inoperábilis szilárd daganatos betegeknél várható klinikai validálása (PDO)

Tájékozott beleegyezés alapján a betegek szövetmintavételen esnek át (radiológiai, endoszkópos vagy sebészeti kimetszés). A DNS-t kivonják a szövetből, és elküldik teljes exome szekvenálásra (WES), organoid tenyésztésre és gyógyszertesztre. Az OEM-modellek DNS-mutációit a teljes exóma szekvenálás (WES) segítségével határozzuk meg. A mutációs terhelést és a vezető gének profilját megvizsgálják az elsődleges rákos megbetegedésekben azonosítottakkal való hasonlóságok szempontjából. A generált genetikai adatokat az FDA által jóváhagyott molekuláris célzó gyógyszerekre adott válaszként értelmezik. A kutatók a rendelkezésre álló kemoterápiás lehetőségekkel szemben ellenálló OEM-tenyészeteket tanulmányoznák. Kivételes értékűek lennének a célzott szerekkel szembeni érzékenység vizsgálatában, alternatív kezelési lehetőségeket kínálva a kemorefrakter betegségekre. A korábbi tapasztalatok alapján a projektcsapat kifejlesztett egy szabványos működési protokollt (SOP) a területen, és létrehozta a genomadatok integráló elemzését. OEM kultúra és genom által irányított gyógyszerszűrés [12] Platformunk klinikai hasznosságának biztosítása érdekében a kutatók arra törekednek, hogy az egyes OEM-ekhez tartozó gyógyszerlehetőségeket ésszerű időn belül szállítsák. Ebben a jellemzően 4-6 hetes keretben a vizsgálóknak létre kell hozniuk organoidokat, tanulmányozniuk kell azok molekuláris profilját, és ex vivo gyógyszerszűrést kell végezniük, amely lehetővé teszi a terápia személyre szabását az egyes betegek számára. A jogosult betegek egy MDT táblán láthatók, ahol áttekintik a betegek kórtörténetét, laboratóriumi és radiológiai eredményeit. A vizsgálatban való részvételhez való tájékozott beleegyezéssel a páciens szövetmintavételen esik át a daganatából (radiológiai, endoszkópos vagy sebészeti módszerekkel). A mintavételezett daganatokat ezután DNS-extrakciónak vetik alá teljes exome szekvenálás, organoid tenyésztés és gyógyszerszűrés céljából. Ez 2-4 hétig tart. Az átmeneti időszakban a páciens kemoterápiás szert, célszert vagy hormonterápiát kaphat a biopszia időpontja és a gyógyszerszűrési eredmények rendelkezésre állása között. Az MDT felülvizsgálja a gyógyszerszűrési eredményeket, és olyan gyógyszer használatát javasolja, amelyre az OEM-ben adott válasz. Ha több gyógyszer hatásosnak bizonyul, a beutaló onkológus dönti el, hogy melyik kemo- vagy célszert választja.

A daganatfelmérést a kiinduláskor, 8 hetente végezzük el. A vizsgálók minden nemkívánatos eseményt és súlyos nemkívánatos eseményt jelentenek az NCI CTCAE definíciói alapján. A nyomozók minden SAE-t jelentenek a közös NTEC-CUHK CREC-nek az előfordulásuk után 24 órán belül. A CREC vezető orvosai elbírálták az összes súlyos esetet.

A kutatók célja az NGS/PDO gyógyszerszűrés által irányított kezelés klinikai hatékonyságának meghatározása olyan betegeknél, akiknél inoperábilis/előrehaladott, a hagyományos kemoterápiára refrakter szolid tumorok szenvednek. A kutatók ezekben a betegekben korrelálják a PDO gyógyszerre adott választ ex vivo a klinikai válaszra. Hipotézisünk az, hogy a WES és a PDO gyógyszerszűrés pontosan azonosítja a jelölt gyógyszereket, amelyek csökkentik a daganat méretét, és előnyökkel járnak ezekben a betegekben.

A vizsgálók azt feltételezik, hogy a standard kezelés mellett a kezelési válasz 10% körüli. Az OEM és NGS által irányított kezelés valószínűleg körülbelül 30%-ra vagy még többre javítja a válaszarányt. Az első szakaszban 10 beteget halmoznak fel. Ha egy vagy kevesebb válasz jelentkezik, ebben a 10 betegben a vizsgálat leáll. Ellenkező esetben további 19 beteg gyűlik össze, összesen 29 beteg. A nullhipotézist el kell utasítani, ha 29 betegnél 6 vagy több válasz észlelhető. Ez a kialakítás 0,05 1-es típusú hibaarányt és 80%-os teljesítményt eredményez. A kutatók 40 vagy több beteg felvételét tervezik 2 év alatt, azzal a feltételezéssel, hogy a betegek körülbelül 20%-ánál az OEM tenyésztése sikertelen.