진행성/수술 불가능한 고형 종양 환자에 대한 차세대 시퀀싱(NGS) 및 환자 유래 종양 오가노이드(PDO) 유도 치료의 전향적 임상 검증 (PDO)

사전 동의 하에 환자는 조직 샘플링(방사선, 내시경 또는 외과적 절제)을 받습니다. DNA는 조직에서 추출되어 WES(Whole-Exome Sequencing), 오가노이드 배양 및 약물 테스트를 위해 전송됩니다. PDO 모델의 DNA 돌연변이는 WES(Whole-Exome Sequencing)를 사용하여 결정됩니다. 돌연변이 부담 및 동인 유전자 프로필은 원발성 암에서 확인된 것과 유사성을 평가할 것입니다. 생성된 유전자 데이터는 FDA 승인 분자 표적 약물에 대한 반응을 위해 해석됩니다. 연구자들은 이용 가능한 화학요법 옵션에 내성이 있는 PDO 배양을 연구할 것입니다. 이는 표적 제제에 대한 민감도를 연구하고 화학 불응성 질환에 대한 대체 치료 옵션을 제공하는 데 탁월한 가치가 있습니다. 프로젝트팀은 과거 경험을 바탕으로 해당 분야의 SOP(Standard Operational Protocol)를 개발하고, 게놈 데이터와의 통합 분석 파이프라인을 구축했다. PDO 배양 및 게놈 기반 약물 검사 [ 12 ] 우리 플랫폼의 임상적 유용성을 보장하기 위해 연구자들은 의미 있는 시간 내에 각 PDO의 약물 옵션을 제공하는 것을 목표로 합니다. 일반적으로 4~6주의 이 프레임워크에서 연구자는 오가노이드를 생성하고, 분자 프로필을 연구하고, 각 환자에 대한 치료를 개별화할 수 있는 생체외 약물 스크리닝을 수행해야 합니다. 적격 환자는 환자의 사례 기록, 검사실 및 방사선학적 결과를 검토하는 MDT 보드에서 볼 수 있습니다. 임상시험 참여에 대한 사전 동의를 바탕으로 환자는 자신의 종양에 대한 조직 샘플링(방사선, 내시경 또는 수술 방법)을 받습니다. 샘플링된 종양은 전체 엑솜 시퀀싱, 오르가노이드 배양 및 약물 스크린을 위해 DNA 추출을 거칩니다. 이 과정은 2~4주 정도 소요됩니다. 중간 기간 동안 환자는 생검 시점부터 약물 검사 결과가 나올 때까지 화학요법제, 표적제 또는 호르몬 요법을 받을 수 있습니다. MDT는 약물 선별 결과를 검토하고 PDO에서 반응이 있는 약물의 사용을 권장합니다. 여러 가지 약물이 효능이 있는 것으로 나타나면 의뢰한 종양 전문의가 화학요법제나 표적제제 선택에 대한 최종 재량권을 갖습니다.

종양 평가는 기준선에서 8주마다 수행됩니다. 조사관은 NCI CTCAE의 정의에 따라 모든 부작용과 심각한 부작용을 보고합니다. 조사관은 모든 SAE를 발생 후 24시간 이내에 합동 NTEC-CUHK CREC에 보고합니다. CREC의 수석 의사들이 모든 SAE를 판결했습니다.

연구자들은 기존 화학요법에 반응하지 않는 수술 불가능/진행성 고형 종양 환자를 대상으로 NGS/PDO 약물 선별 치료의 임상적 효능을 확인하는 것을 목표로 합니다. 연구자들은 생체외 PDO 약물 반응을 이들 환자의 임상 반응과 연관시킵니다. 우리의 가설은 WES와 PDO 약물 검사가 종양 크기를 줄이고 이러한 환자에게 이점을 제공할 후보 약물을 정확하게 식별할 수 있다는 것입니다.

연구자들은 표준 치료의 치료 반응이 약 10%라고 가정합니다. PDO 및 NGS 유도 치료는 반응률을 약 30% 이상으로 향상시킬 가능성이 높습니다. 1단계에서는 10명의 환자가 누적되며, 이 10명의 환자 중 1명 이하의 반응이 있을 경우 연구를 중단한다. 그렇지 않으면 추가로 19명의 환자가 발생하여 총 29명이 됩니다. 29명의 환자에서 6개 이상의 반응이 관찰되면 귀무가설이 기각됩니다. 이 설계는 1종 오류율이 0.05이고 검정력이 80%입니다. 연구자들은 약 20%의 환자에서 PDO 배양이 실패한다는 가정 하에 2년에 걸쳐 40명 이상의 환자를 등록할 계획입니다.