薬剤耐性菌を含む肺炎のリスク評価スコア（RESPIRE）の導出と検証 (RESPIRE)

研究デザインと設定

これは、初期の遡及フェーズとその後の前向きフェーズという2つの連続したフェーズから成る、単一施設の非営利観察研究です。 患者は、2022年1月1日から2023年12月31日（遡及コホート）および2024年1月1日から2025年12月31日（前向きコホート）の2つの連続した重複しない期間に登録されました。

この研究は病院環境で実施され、単一施設であり、微生物学・ウイルス学ユニットおよび感染症ユニットと協力して、アジエンダ・オスペダリエロ・ウニヴェルシタリア・カレッジの救急科および救急準集中治療室で実施されました。 カレッジは大規模な学術病院であり、約650,000人の住民の地域病院として機能し、約1,600,000人への三次紹介センターとしての役割を果たしています。

遡及フェーズ（導出コホート）

最初の観察的遡及フェーズ（2年間）では、微生物学的に確認された肺炎の病因診断を持つ患者から成る遡及的導出コホートを確立するためにデータが収集されました。 導出コホートには、アジエンダ・オスペダリエロ・ウニヴェルシタリア・カレッジへの入院後48時間以内に肺炎の病因診断を特定することを目的とした微生物学的検査を受けた患者が含まれます。

微生物学・ウイルス学研究所が受信した微生物学的検査依頼の初期スクリーニング（肺炎患者の微生物学的検査と電子医療記録を含む専用ソフトウェアを使用）の後、入院後48時間以内に呼吸器検体（病因評価の診断ゴールドスタンダードと見なされる）で肺炎の病因物質（細菌、ウイルス、または真菌）を決定するための診断検査を受けた患者が特定されました。 その後、最終コホートデータベースを構築するために、研究者によって患者の医療記録がレビューされました。

遡及フェーズでは、微生物学的に確認された細菌性、真菌性、またはウイルス性肺炎の患者が、遡及コホートを作成するために含まれました。 細菌、真菌、またはウイルスの病原体が同定されなかった症例は除外されました。 陽性培養結果と利用可能な抗菌薬感受性試験を持つ患者のみが選択されました。 培養で同定された多剤耐性（MDR）病原体による細菌性肺炎の患者が研究群を構成し、非MDR病原体による細菌性肺炎の患者が対照群を構成しました。 MDR肺炎は、3つ以上の抗菌薬カテゴリーにおいて少なくとも1剤に対する獲得性非感受性を示す細菌性病原体による肺炎と定義されました。

偽陰性症例の包含を避けるために、肺炎の確認された病因診断と陽性培養結果を持つ患者のみが含まれました。 陰性呼吸器培養結果（文献では約40-60％の症例で報告されている）は、潜在的な選択バイアスを導入した可能性があります。なぜなら、培養陰性結果ではMDR病原体による肺炎を除外できないからです。

前向きフェーズ（検証コホート）

2番目の観察的前向きフェーズ（2年間）では、救急科患者の前向きコホートを確立するためにデータが収集され、遡及コホートから導出された臨床スコアの性能が純粋に観察的に評価されました。

検証コホートには、病因物質を評価するために救急科で呼吸器検体の微生物学的検査を受けた肺炎と診断された患者が含まれます。 通常の臨床実践を超える追加の診断検査は実施されませんでした。 臨床医の判断で呼吸器検体の微生物学的検査を受けた肺炎患者のみが含まれました。 初期フェーズの後、上記と同じ理由で、陽性呼吸器培養結果を持つ患者のみが含まれました。

救急医学・外科ユニットおよび統合臨床評価と院内救急経路ユニットが、患者評価、登録、検体収集、およびデータ収集を担当しました。 微生物学・ウイルス学ユニットは、研究期間中に研究所が受信した微生物学的検査依頼の特定と、微生物学的データの抽出を担当しました。

研究目的

本研究の主要目的は、救急科を受診し、および/または地域から入院した肺炎と診断された患者における、MDR病原体関連肺炎の臨床予測スコアを導出することです。

副次目的は以下の通りです：

1. 前向き患者コホートにおける導出された臨床スコアの検証；
2. DRIP、Shorr、Park、Shindo、Aliberti、およびSchreiberなどの検証済みスコア、ならびにATS/IDSA HCAP基準と比較した、開発されたスコアのMDR関連肺炎予測性能の比較；
3. 陽性的中率（PPV）、陰性的中率（NPV）、特異度、感度、陽性および陰性尤度比（LR+およびLR-）、および最適カットオフ値の分析；
4. 導出コホートおよび検証コホートの両方におけるスコア較正の評価；
5. 決定曲線分析を用いた臨床的インパクトの評価。