Avledning og validering av Risikovurderingsskåren for pneumoni involverende resistente enheter (RESPIRE) (RESPIRE)

Studiedesign og rammeverk

Dette er en enkelt-senter, ikke-kommersiell observasjonsstudie med to sekvensielle faser: en innledende retrospektiv fase og en påfølgende prospektiv fase. Pasienter ble inkludert i to påfølgende, ikke-overlappende perioder: fra 1. januar 2022 til 31. desember 2023 (retrospektiv kohort), og fra 1. januar 2024 til 31. desember 2025 (prospektiv kohort).

Studien ble gjennomført i et sykehusmiljø og er monosentrisk, utført ved Akuttmottaket og Akutt Sub-Intensiv Avdeling ved Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi, i samarbeid med Avdelingene for Mikrobiologi og Virologi og Infeksjonssykdommer. Careggi er et stort universitetssykehus som fungerer som lokalsykehus for en befolkning på omtrent 650 000 innbyggere og fungerer som et tertiært referansesenter for omtrent 1 600 000 mennesker.

Retrospektiv fase (Derivasjonskohort)

Under den første observasjonelle retrospektive fasen (2 år) ble data samlet for å etablere en retrospektiv derivasjonskohort bestående av pasienter med mikrobiologisk bekreftede etiologiske diagnoser av lungebetennelse. Derivasjonskohorten inkluderer pasienter som gjennomgikk mikrobiologiske undersøkelser rettet mot å identifisere den etiologiske diagnosen av lungebetennelse innen de første 48 timene etter innleggelse ved Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi.

Etter en innledende screening av mikrobiologiske testforespørsler mottatt av Mikrobiologi- og Virologilaboratoriet - ved bruk av dedikert programvare som inneholder mikrobiologiske undersøkelser og elektroniske pasientjournaler for pasienter med lungebetennelse - ble pasienter som gjennomgikk diagnostisk testing for å fastslå etiologisk agens for lungebetennelse (bakteriell, viral eller sopp) på respiratoriske prøver (ansett som diagnostisk gullstandard for etiologisk vurdering) innen 48 timer etter sykehusinnleggelse identifisert. Deretter ble pasientenes journaler gjennomgått av forskerne for å konstruere den endelige kohortdatabasen.

Under den retrospektive fasen ble pasienter med mikrobiologisk bekreftet bakteriell, sopp- eller viral lungebetennelse inkludert for å danne den retrospektive kohorten. Tilfeller der ingen bakteriell, sopp- eller viral patogen ble identifisert ble ekskludert. Kun pasienter med positive kultureresultater og tilgjengelig antimikrobiell følsomhetstesting ble valgt. Pasienter med bakteriell lungebetennelse forårsaket av multiresistente (MDR) patogener identifisert på kultur utgjorde studiegruppen, mens pasienter med bakteriell lungebetennelse forårsaket av ikke-MDR patogener utgjorde kontrollgruppen. MDR-lungebetennelse ble definert som lungebetennelse forårsaket av bakterielle patogener som viste ervervet ikke-følsomhet for minst ett middel i tre eller flere antimikrobielle kategorier.

Kun pasienter med en bekreftet etiologisk diagnose av lungebetennelse og positive kultureresultater ble inkludert, for å unngå inkludering av falskt-negative tilfeller. Negative respiratoriske kultureresultater (rapportert i litteraturen i omtrent 40-60% av tilfellene) kunne ha introdusert potensiell seleksjonsbias, ettersom kultur-negative resultater ikke tillater ekskludering av lungebetennelse forårsaket av MDR-patogener.

Prospektiv fase (Valideringskohort)

Under den andre observasjonelle prospektive fasen (2 år) ble data samlet for å etablere en prospektiv kohort av Akuttmottakspasienter, hvor ytelsen til den kliniske skåren avledet fra den retrospektive kohorten ble evaluert på en rent observasjonell måte.

Valideringskohorten inkluderer pasienter diagnostisert med lungebetennelse som gjennomgikk mikrobiologiske undersøkelser på respiratoriske prøver på Akuttmottaket for å vurdere etiologisk agens. Ingen ytterligere diagnostiske tester ble utført utover rutinemessig klinisk praksis. Kun pasienter med lungebetennelse som gjennomgikk mikrobiologiske undersøkelser på respiratoriske prøver etter klinikerens skjønn ble inkludert. Etter en innledende fase ble kun pasienter med positive respiratoriske kultureresultater inkludert, av samme grunner som beskrevet ovenfor.

Avdelingene for Akuttmedisin og Kirurgi og Integrert Klinisk Vurdering og Innleggelsesrutiner var ansvarlige for pasientvurdering, inkludering, prøveinnsamling og datainnsamling. Avdelingen for Mikrobiologi og Virologi var ansvarlig for å identifisere mikrobiologiske testforespørsler mottatt av laboratoriet i studieperioden og for å trekke ut mikrobiologiske data.

Studiemål

Det primære målet med studien er å utlede en klinisk prediktiv skår for MDR-patogen-relatert lungebetennelse hos pasienter diagnostisert med lungebetennelse som presenterer seg på Akuttmottaket og/eller blir innlagt på sykehus fra samfunnet.

Sekundære mål er:

1. validering av den avledede kliniske skåren i en prospektiv pasientkohort;
2. sammenligning av ytelsen til den utviklede skåren i prediksjon av MDR-relatert lungebetennelse med validerte skårer som DRIP, Shorr, Park, Shindo, Aliberti og Schreiber, samt ATS/IDSA HCAP-kriteriene;
3. analyse av positiv prediktiv verdi (PPV), negativ prediktiv verdi (NPV), spesifisitet, sensitivitet, positive og negative sannsynlighetsforhold (LR+ og LR-), og optimale grenseverdier;
4. vurdering av skårkalibrering i både derivasjons- og valideringskohortene;
5. evaluering av klinisk påvirkning ved bruk av beslutningskurveanalyse.