Odvození a validace skóre hodnocení rizika pro pneumonii zahrnující rezistentní entity (RESPIRE) (RESPIRE)

Studijní design a prostředí

Toto je jednocentrová, nezisková observační studie se dvěma postupnými fázemi: počáteční retrospektivní fází a následnou prospektivní fází. Pacienti byli zařazeni během dvou po sobě jdoucích, nepřekrývajících se období: od 1. ledna 2022 do 31. prosince 2023 (retrospektivní kohorta) a od 1. ledna 2024 do 31. prosince 2025 (prospektivní kohorta).

Studie byla provedena v nemocničním prostředí a je monocentrická, realizována na Oddělení urgentního příjmu a Jednotce urgentní subintenzivní péče Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi ve spolupráci s Jednotkami mikrobiologie a virologie a infekčních nemocí. Careggi je velká akademická nemocnice, která slouží jako místní nemocnice pro populaci přibližně 650 000 obyvatel a působí jako terciární referenční centrum pro asi 1 600 000 lidí.

Retrospektivní fáze (derivační kohorta)

Během první observační retrospektivní fáze (2 roky) byly shromažďovány údaje za účelem vytvoření retrospektivní derivační kohorty složené z pacientů s mikrobiologicky potvrzenými etiologickými diagnózami pneumonie. Derivační kohorta zahrnuje pacienty, kteří podstoupili mikrobiologická vyšetření zaměřená na identifikaci etiologické diagnózy pneumonie během prvních 48 hodin od přijetí do Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi.

Po počátečním screeningu žádostí o mikrobiologické testy přijatých Laboratoří mikrobiologie a virologie – pomocí specializovaného softwaru obsahujícího mikrobiologická vyšetření a elektronické zdravotní záznamy pacientů s pneumonií – byli identifikováni pacienti, kteří podstoupili diagnostické testování k určení etiologického agens pneumonie (bakteriální, virové nebo plísňové) na respiračních vzorcích (považovaných za diagnostický zlatý standard pro etiologické hodnocení) do 48 hodin od přijetí do nemocnice. Následně byly zdravotní záznamy pacientů přezkoumány vyšetřovateli za účelem sestavení finální databáze kohorty.

Během retrospektivní fáze byli do retrospektivní kohorty zařazeni pacienti s mikrobiologicky potvrzenou bakteriální, plísňovou nebo virovou pneumonií. Případy, ve kterých nebyl identifikován žádný bakteriální, plísňový nebo virový patogen, byly vyloučeny. Byli vybráni pouze pacienti s pozitivními výsledky kultivace a dostupným testováním citlivosti na antimikrobiální látky. Pacienti s bakteriální pneumonií způsobenou multirezistentními (MDR) patogeny identifikovanými v kultivaci tvořili studijní skupinu, zatímco pacienti s bakteriální pneumonií způsobenou nemultirezistentními patogeny tvořili kontrolní skupinu. MDR pneumonie byla definována jako pneumonie způsobená bakteriálními patogeny vykazujícími získanou necitlivost na alespoň jednu látku ve třech nebo více kategoriích antimikrobiálních látek.

Byli zařazeni pouze pacienti s potvrzenou etiologickou diagnózou pneumonie a pozitivními výsledky kultivace, aby se zabránilo zařazení falešně negativních případů. Negativní výsledky respiračních kultur (popisované v literatuře přibližně v 40–60 % případů) mohly zavést potenciální selektivní zkreslení, protože kultivačně negativní výsledky nevylučují pneumonii způsobenou MDR patogeny.

Prospektivní fáze (validační kohorta)

Během druhé observační prospektivní fáze (2 roky) byly shromažďovány údaje za účelem vytvoření prospektivní kohorty pacientů na Oddělení urgentního příjmu, na které byl výkon klinického skóre odvozeného z retrospektivní kohorty hodnocen čistě observačním způsobem.

Validační kohorta zahrnuje pacienty s diagnózou pneumonie, kteří podstoupili mikrobiologická vyšetření respiračních vzorků na Oddělení urgentního příjmu za účelem posouzení etiologického agens. Kromě rutinní klinické praxe nebyly prováděny žádné další diagnostické testy. Byli zařazeni pouze pacienti s pneumonií, kteří podstoupili mikrobiologická vyšetření respiračních vzorků dle uvážení klinika. Po počáteční fázi byli z výše popsaných stejných důvodů zařazeni pouze pacienti s pozitivními výsledky respiračních kultur.

Jednotky urgentní medicíny a chirurgie a Integrovaného klinického hodnocení a nemocničních urgentních postupů byly zodpovědné za hodnocení pacientů, zařazení, odběr vzorků a sběr dat. Jednotka mikrobiologie a virologie byla zodpovědná za identifikaci žádostí o mikrobiologické testy přijatých laboratoří během studijního období a za extrakci mikrobiologických dat.

Cíle studie

Primárním cílem studie je odvodit klinické prediktivní skóre pro pneumonii související s MDR patogeny u pacientů s diagnózou pneumonie přicházejících na Oddělení urgentního příjmu a/nebo přijatých do nemocnice z komunity.

Sekundárními cíli jsou:

1. validace odvozeného klinického skóre v prospektivní kohortě pacientů;
2. porovnání výkonnosti vyvinutého skóre v predikci pneumonie související s MDR s validovanými skóre jako DRIP, Shorr, Park, Shindo, Aliberti a Schreiber, stejně jako s kritérii ATS/IDSA HCAP;
3. analýza pozitivní prediktivní hodnoty (PPV), negativní prediktivní hodnoty (NPV), specificity, senzitivity, pozitivního a negativního poměru věrohodnosti (LR+ a LR-) a optimálních hodnot cut-off;
4. hodnocení kalibrace skóre v derivační i validační kohortě;
5. hodnocení klinického dopadu pomocí analýzy rozhodovací křivky.