Afledning og Validering af Risikovurderingsscoren for Lungebetændelse med Resistent Indhold (RESPIRE) (RESPIRE)

Studiedesign og ramme

Dette er en enkeltcenter, non-profit observationsstudie med to sekventielle faser: en indledende retrospektiv fase og en efterfølgende prospektiv fase. Patienter blev inkluderet i to på hinanden følgende, ikke-overlappende perioder: fra 1. januar 2022 til 31. december 2023 (retrospektiv kohorte) og fra 1. januar 2024 til 31. december 2025 (prospektiv kohorte).

Studiet blev udført i et hospitalsmiljø og er monocentrisk, gennemført på Akutafdelingen og Akut Sub-Intensiv Enhed på Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi, i samarbejde med Enhederne for Mikrobiologi og Virologi og Infektionssygdomme. Careggi er et stort akademisk hospital, der fungerer som lokalt hospital for en befolkning på cirka 650.000 indbyggere og fungerer som et tertiært henvisningscenter for omkring 1.600.000 mennesker.

Retrospektiv fase (Afledningskohorte)

I den første observationsretrospektive fase (2 år) blev data indsamlet for at etablere en retrospektiv afledningskohorte bestående af patienter med mikrobiologisk bekræftede etiologiske diagnoser af lungebetændelse. Afledningskohorten inkluderer patienter, der blev undersøgt mikrobiologisk med henblik på at identificere den etiologiske diagnose af lungebetændelse inden for de første 48 timer efter indlæggelse på Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi.

Efter et indledende screening af mikrobiologiske testanmodninger modtaget af Mikrobiologi- og Virologilaboratoriet - ved hjælp af dedikeret software indeholdende mikrobiologiske undersøgelser og elektroniske patientjournaler for patienter med lungebetændelse - blev patienter, der blev diagnostisk testet for at bestemme den etiologiske årsag til lungebetændelse (bakteriel, viral eller svampe) på respiratoriske prøver (betragtet som den diagnostiske guldstandard for etiologisk vurdering) inden for 48 timer efter hospitalsindlæggelse, identificeret. Derefter blev patienternes journaler gennemgået af forskerne for at konstruere den endelige kohortedatabase.

I den retrospektive fase blev patienter med mikrobiologisk bekræftet bakteriel, svampe- eller viruslungebetændelse inkluderet for at skabe den retrospektive kohorte. Tilfælde, hvor ingen bakteriel, svampe- eller viruspatogen blev identificeret, blev ekskluderet. Kun patienter med positive dyrkningsresultater og tilgængelig antimikrobiel følsomhedstest blev udvalgt. Patienter med bakteriel lungebetændelse forårsaget af multiresistente (MDR) patogener identificeret på dyrkning udgjorde undersøgelsesgruppen, mens patienter med bakteriel lungebetændelse forårsaget af ikke-MDR-patogener udgjorde kontrolgruppen. MDR-lungebetændelse blev defineret som lungebetændelse forårsaget af bakterielle patogener, der udviste erhvervet ikke-følsomhed over for mindst ét middel i tre eller flere antimikrobielle kategorier.

Kun patienter med en bekræftet etiologisk diagnose af lungebetændelse og positive dyrkningsresultater blev inkluderet for at undgå inklusion af falsk-negative tilfælde. Negative respiratoriske dyrkningsresultater (rapporteret i litteraturen i cirka 40-60% af tilfældene) kunne have introduceret potentiel udvælgelsesbias, da dyrkningsnegative resultater ikke tillader udelukkelse af lungebetændelse forårsaget af MDR-patogener.

Prospektiv fase (Valideringskohorte)

I den anden observationsprospektive fase (2 år) blev data indsamlet for at etablere en prospektiv kohorte af Akutafdelingspatienter, hvorpå ydeevnen af den kliniske score afledt fra den retrospektive kohorte blev evalueret på en rent observationsmæssig måde.

Valideringskohorten inkluderer patienter diagnosticeret med lungebetændelse, der blev undersøgt mikrobiologisk på respiratoriske prøver på Akutafdelingen for at vurdere den etiologiske årsag. Ingen yderligere diagnostiske tests blev udført ud over rutinemæssig klinisk praksis. Kun patienter med lungebetændelse, der blev undersøgt mikrobiologisk på respiratoriske prøver efter lægens skøn, blev inkluderet. Efter en indledende fase blev kun patienter med positive respiratoriske dyrkningsresultater inkluderet af de samme årsager som beskrevet ovenfor.

Enhederne for Akutmedicin og Kirurgi samt Integreret Klinisk Vurdering og Indlagte Akutforløb var ansvarlige for patientvurdering, inklusion, prøveindsamling og dataindsamling. Enheden for Mikrobiologi og Virologi var ansvarlig for at identificere mikrobiologiske testanmodninger modtaget af laboratoriet i undersøgelsesperioden og for at udtrække mikrobiologiske data.

Studiets formål

Studiets primære formål er at udlede en klinisk prædiktiv score for MDR-patogen-relateret lungebetændelse hos patienter diagnosticeret med lungebetændelse, der henvender sig til Akutafdelingen og/eller indlægges på hospitalet fra samfundet.

Sekundære formål er:

1. validering af den udledte kliniske score i en prospektiv patientkohorte;
2. sammenligning af ydeevnen af den udviklede score i at forudsige MDR-relateret lungebetændelse med validerede scores som DRIP, Shorr, Park, Shindo, Aliberti og Schreiber, samt ATS/IDSA HCAP-kriterierne;
3. analyse af positiv prædiktiv værdi (PPV), negativ prædiktiv værdi (NPV), specificitet, sensitivitet, positive og negative sandsynlighedsforhold (LR+ og LR-) og optimale cut-off-værdier;
4. vurdering af scorekalibrering i både aflednings- og valideringskohorterne;
5. evaluering af klinisk indvirkning ved hjælp af beslutningskurveanalyse.