Härledning och validering av Risk Evaluation Score för pneumoni som involverar resistenta enheter (RESPIRE) (RESPIRE)

Studiedesign och Miljö

Detta är en enskild-centrerad, icke-vinstdrivande observationsstudie med två sekventiella faser: en inledande retrospektiv fas och en efterföljande prospektiv fas. Patienter inkluderades under två på varandra följande, icke-överlappande perioder: från 1 januari 2022 till 31 december 2023 (retrospektiv kohort), och från 1 januari 2024 till 31 december 2025 (prospektiv kohort).

Studien genomfördes i en sjukhusmiljö och är monocentrisk, utförd på Akutmottagningen och den Akuta Subintensivvårdsenheten vid Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi, i samarbete med Enheterna för Mikrobiologi och Virologi samt Infektionssjukdomar. Careggi är ett stort akademiskt sjukhus som fungerar som det lokala sjukhuset för en befolkning på cirka 650 000 invånare och agerar som ett tertiärt referenscentrum för cirka 1 600 000 personer.

Retrospektiv Fas (Deriveringskohort)

Under den första observationsbaserade retrospektiva fasen (2 år) samlades data in för att etablera en retrospektiv deriveringskohort bestående av patienter med mikrobiologiskt bekräftade etiologiska diagnoser av pneumoni. Deriveringskohorten inkluderar patienter som genomgick mikrobiologiska undersökningar avsedda att identifiera den etiologiska diagnosen av pneumoni inom de första 48 timmarna från ankomst till Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi.

Efter en inledande screening av mikrobiologiska testförfrågningar mottagna av Mikrobiologi- och Virologilaboratoriet – med hjälp av specialiserad programvara som innehåller mikrobiologiska undersökningar och elektroniska patientjournaler för patienter med pneumoni – identifierades patienter som genomgick diagnostiska tester för att bestämma den etiologiska agenten för pneumoni (bakteriell, viral eller svamp) på respiratoriska prover (ansedda som den diagnostiska guldstandarden för etiologisk bedömning) inom 48 timmar efter sjukhusinläggning. Därefter granskades patienternas medicinska journaler av forskarna för att konstruera den slutliga kohortdatabasen.

Under den retrospektiva fasen inkluderades patienter med mikrobiologiskt bekräftad bakteriell, svamp- eller viral pneumoni för att skapa den retrospektiva kohorten. Fall där ingen bakteriell, svamp- eller viral patogen identifierades exkluderades. Endast patienter med positiva odlingsresultat och tillgänglig antimikrobiell resistenstestning valdes ut. Patienter med bakteriell pneumoni orsakad av multiresistenta (MDR) patogener identifierade på odling utgjorde studiegruppen, medan patienter med bakteriell pneumoni orsakad av icke-MDR-patogener utgjorde kontrollgruppen. MDR-pneumoni definierades som pneumoni orsakad av bakteriella patogener som uppvisar förvärvad icke-känslighet mot minst ett medel i tre eller fler antimikrobiella kategorier.

Endast patienter med en bekräftad etiologisk diagnos av pneumoni och positiva odlingsresultat inkluderades, för att undvika inkludering av falskt-negativa fall. Negativa respiratoriska odlingsresultat (rapporterade i litteraturen i cirka 40–60 % av fallen) kunde ha introducerat potentiellt urvalsbias, eftersom odlingsnegativa resultat inte tillåter uteslutning av pneumoni orsakad av MDR-patogener.

Prospektiv Fas (Valideringskohort)

Under den andra observationsbaserade prospektiva fasen (2 år) samlades data in för att etablera en prospektiv kohort av Akutmottagningspatienter, på vilka prestandan av det kliniska poängsystemet härlett från den retrospektiva kohorten utvärderades på ett rent observationsbaserat sätt.

Valideringskohorten inkluderar patienter med diagnosen pneumoni som genomgick mikrobiologiska undersökningar på respiratoriska prover på Akutmottagningen för att bedöma den etiologiska agenten. Inga ytterligare diagnostiska tester utfördes utöver den rutinmässiga kliniska praktiken. Endast patienter med pneumoni som genomgick mikrobiologiska undersökningar på respiratoriska prover enligt klinikerns bedömning inkluderades. Efter en inledande fas inkluderades endast patienter med positiva respiratoriska odlingsresultat, av samma skäl som beskrivits ovan.

Enheterna för Akutmedicin och Kirurgi samt Integrerad Klinisk Bedömning och Inomhus Akutvårdsvägar var ansvariga för patientbedömning, inkludering, provinsamling och datainsamling. Enheten för Mikrobiologi och Virologi var ansvarig för att identifiera mikrobiologiska testförfrågningar mottagna av laboratoriet under studieperioden och för att extrahera mikrobiologiska data.

Studieobjektiv

Det primära målet med studien är att härleda ett kliniskt prediktivt poängsystem för MDR-patogenrelaterad pneumoni hos patienter med diagnosen pneumoni som söker på Akutmottagningen och/eller inläggs på sjukhus från samhället.

Sekundära mål är:

1. validering av det härledda kliniska poängsystemet i en prospektiv patientkohort;
2. jämförelse av prestandan för det utvecklade poängsystemet i att förutsäga MDR-relaterad pneumoni med validerade poängsystem som DRIP, Shorr, Park, Shindo, Aliberti och Schreiber, samt ATS/IDSA HCAP-kriterierna;
3. analys av positivt prediktivt värde (PPV), negativt prediktivt värde (NPV), specificitet, sensitivitet, positiva och negativa sannolikhetskvoter (LR+ och LR-), samt optimala tröskelvärden;
4. bedömning av poängsystemets kalibrering i både deriverings- och valideringskohorterna;
5. utvärdering av klinisk påverkan med hjälp av besluts-kurveanalys.