구강 마이크로바이옴 샘플의 장기 안정성

인간 마이크로바이옴(즉, 인체 안팎에서 발견되는 미생물 유전자의 수집)은 수많은 건강 상태와 관련이 있는 것으로 관찰되었지만 현재의 방법론 연구는 수집 방법, 실험실 처리, 데이터의 생물정보 처리 및 기타 요인은 마이크로바이옴 연구 결과에 큰 영향을 미칠 수 있습니다. 코호트 연구에서 샘플은 일반적으로 기준선에서 수집되지만 충분한 사례가 누적될 때까지 처리되지 않는 경우가 많습니다. 이러한 유형의 연구 설계에서는 마이크로바이옴 측정을 위해 실험실에서 처리하기 전에 샘플을 수년 동안 동결된 상태로 유지해야 합니다. 우리가 아는 한, 구강 샘플의 장기 보관이 구강 미생물 특성에 미치는 영향을 고려한 연구는 없습니다. 따라서 NCI에서 근무하는 30명의 개인으로부터 두 가지 구강 샘플 수집 방법(OMNIgene ORAL 및 Scope 구강 세척제)의 장기 보관이 구강 미생물 특성에 미치는 영향을 평가할 것입니다. 우리는 각 참가자가 2주 동안 6일에 걸쳐 샘플을 제공하도록 요청할 것입니다. 참가자들은 또한 간단한 설문지를 작성할 것입니다. 각 개인의 풀링된 OMNIgene ORAL 및 Scope 구강청결제 샘플에서 분취량을 생성하고 즉시 DNA 한 분취량을 추출합니다. 나머지 분취액은 -80도에서 냉동 보관하며 채취 후 1개월, 3개월, 6개월, 1년 후에 DNA를 추출합니다. 나머지 부분표본은 장기 테스트 및 기타 향후 연구를 위해 -80°C 냉동고에 보관됩니다. 저장된 샘플의 미생물 프로필을 즉시 추출된 샘플과 비교하여 구강 샘플에 대한 저장 효과를 결정합니다.