口腔マイクロバイオームサンプルの長期安定性

ヒトのマイクロバイオーム（つまり、人体の内部および表面に見られる微生物遺伝子の集合体）は、多くの健康状態と関連していることが観察されていますが、現在の方法論的研究では、収集方法、実験室での取り扱い、データのバイオインフォマティクス処理などが示唆されています。要因はマイクロバイオームの研究結果に大きな影響を与える可能性があります。 コホート研究では、通常、サンプルはベースラインで収集されますが、多くの場合、十分な症例が蓄積されるまで処理されません。 このタイプの研究デザインでは、マイクロバイオーム測定のために実験室で取り扱う前に、サンプルをおそらく何年も凍結したままにしておく必要があります。 私たちの知る限り、口腔サンプルの長期保存が口腔マイクロバイオームの特性に及ぼす影響を考慮した研究はありません。 したがって、NCI で働く 30 名の個人からの 2 つの口腔サンプル採取方法 (OMNIgene ORAL および Scope マウスウォッシュ) の長期保存が口腔マイクロバイオームの特性に及ぼす影響を評価します。 各参加者には、2 週間にわたって 6 日に分けてサンプルを提供していただきます。 参加者は簡単なアンケートにも記入します。 各個人からプールされた OMNIgene ORAL および Scope マウスウォッシュ サンプルからアリコートを作成し、直ちに DNA 1 アリコートを抽出します。 残りのアリコートは-80℃で凍結され、収集後1か月、3か月、6か月、1年後にDNAが抽出されます。 残りのアリコートは、さらに長期間のテストや将来の研究のために、-80℃の冷凍庫に保管されます。 保存したサンプルの微生物プロファイルをすぐに抽出したサンプルと比較して、口腔サンプルに対する保存の影響を判断します。