Estabilidad a largo plazo de muestras de microbioma oral

Se ha observado que el microbioma humano (es decir, la colección de genes microbianos que se encuentran dentro y sobre el cuerpo humano) está asociado con numerosas condiciones de salud, pero los estudios metodológicos actuales sugieren que el método de recolección, el manejo de laboratorio, el procesamiento bioinformático de los datos y otros factores pueden afectar en gran medida los resultados del estudio del microbioma. En los estudios de cohortes, las muestras generalmente se recolectan al inicio, pero a menudo no se procesan hasta que se acumulan suficientes casos. Este tipo de diseño de estudio requerirá que las muestras permanezcan congeladas probablemente durante muchos años antes de manipularlas en el laboratorio para las mediciones del microbioma. Hasta donde sabemos, ningún estudio ha considerado el impacto del almacenamiento a largo plazo de muestras orales en las características del microbioma oral. Por lo tanto, evaluaremos el efecto del almacenamiento a largo plazo de dos métodos de recolección de muestras orales (OMNIgene ORAL y enjuague bucal Scope) de 30 personas que trabajan en el NCI sobre las características del microbioma oral. Solicitaremos que cada participante proporcione muestras en 6 días separados en el transcurso de dos semanas. Los participantes también completarán un breve cuestionario. Crearemos alícuotas de las muestras agrupadas de enjuague bucal OMNIgene ORAL y Scope de cada individuo, e inmediatamente extraeremos la alícuota de ADN. Las alícuotas restantes se congelarán a -80 grados C y el ADN se extraerá después de un mes, tres meses, seis meses y un año después de la recolección. Las alícuotas restantes permanecerán en el congelador de -80 grados C para pruebas a más largo plazo y otros estudios futuros. Compararemos los perfiles microbianos de las muestras almacenadas con las muestras extraídas inmediatamente para determinar el efecto del almacenamiento en las muestras orales.