유전체학을 넘어 자폐증 스펙트럼 장애 해독
2022년 9월 23일 업데이트: National Taiwan University Hospital
유전체학을 넘어 자폐증 스펙트럼 장애 해독: 전체 엑솜 시퀀싱, 대사체학 및 표현형을 위한 AI 학습
연구자들은 ASD 환자의 유전자 발현, 염기서열 변이 및 대사 상태 데이터를 결합하여 유전체, 대사체학 및 네트워크 생물학 관점에서 자폐 스펙트럼 장애(ASD)의 분자적 병인을 연구할 것을 제안합니다.
ASD의 복잡성으로 조사관은 복잡한 관계의 관련 영역이 누락되지 않도록 과학 기반 및 임상 기반 측정을 모두 고려합니다.
생물학적 요인 수집 외에도 조사관은 포괄적인 임상, 환경, 신경인지, MRI 이미지를 수집하여 여러 요인을 매트릭스 기능에 통합합니다.
마지막으로 조사관은 알고리즘의 신뢰성과 안정성의 만족스러운 수준을 달성하기 위해 기능을 확인하고 조정하기 위해 개방형 데이터 세트로 게시된 다른 샘플 분포로 다시 밑줄 경로의 측면을 제공하기 위해 머신 러닝을 적용할 것입니다.
차세대 시퀀싱(NGS) 기술을 사용하여 조사관은 ASD 관련 트랜스크립톰 프로파일을 식별하기 위해 약 120명의 ASD 발동자, 40명의 영향을 받지 않는 형제자매 및 40명의 대만 한족의 건강한 대조군의 전체 엑솜 시퀀싱(WES)(MiSeq 시스템)을 시퀀싱합니다.
결과는 실시간 PCR(qPCR) 또는 기존 Sanger 시퀀싱을 사용하여 확인됩니다.
조사관은 820개 이상의 대사 산물이 포함된 광범위한 대사 산물의 전체 평가를 위해 액체 크로마토그래피/비행 시간형 질량 분석법(LC-MS)과 가스 크로마토그래피/사중극자 질량 분석법(GC-MS)을 모두 사용할 것입니다.
따라서 이 3년 제안은 NGS 기술에 의한 ASD 전사체 서열 분석과 LC-MS 및 GC-MS 기술을 통한 ASD의 대사체학 연구의 두 가지 주요 부분으로 구성됩니다.
연구 개요
상세 설명
주요 목표: 생물학적 변수(NGS 데이터 및 대사체학)의 통합 데이터와 포괄적인 임상, 환경, 신경인지 및 MRI 이미지의 기계 학습 접근 방식을 사용하여 ASD에 대한 안정적이고 신뢰할 수 있는 신경 발생 분자 수준 경로 및 잠재적 병인 메커니즘을 확립합니다. 데이터.
- 이 프로젝트에서 수집된 여러 도메인에서 대부분의 후보 위험 요소를 조사합니다.
- 네트워크 기반 알고리즘(심층 학습 포함)을 적용하여 ASD의 근본적인 병인 메커니즘에 접근합니다.
- 알고리즘의 안정성과 신뢰성을 위해 다른 오픈 액세스 데이터베이스를 통해 이 프로젝트에서 수집된 데이터를 기반으로 기계 학습 알고리즘을 추가로 검증합니다.
보조 목표:
목표 I: NGS 기술을 사용하여 ASD 바이오마커 및 질병 메커니즘을 식별합니다.
- ASD 환자에서 발생하는 전사체 프로필을 조사하기 위해;
- 네트워크 생물학 관점에서 ASD 관련 엑솜 서열 변이를 식별하기 위해;
- ASD 관련 유전자-유전자 상호 작용 하위 네트워크를 식별하기 위해; 그리고
- 시퀀싱 결과가 어떻게 조절되고 뇌 구조 및 기능과 상호 작용하는지, 심지어 신경심리학적 기능 및 행동 표현형과 연결되는지 알아보기 위해.
목표 II: ASD에 영향을 받는 대사 산물을 특성화합니다.
- LC-MS 및 GC-MS를 사용하여 표적 및 비표적 분석을 포함한 대사체학 분석을 수행합니다.
- ASD 환자의 행동 표현형, 신경심리학적 기능, 신경해부학 및 뇌 기능과 관련된 잠재적인 대사체학 프로파일 및 경로를 확인하기 위해; 그리고
- 유전자 표현을 통해 대사체 분산 분포가 어떻게 조작되는지 확인합니다.
연구 유형
관찰
등록 (실제)
200
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Taipei, 대만
- National Taiwan Univeristy Hospital
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
3년 (어린이, 성인)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
이 연구는 (1) 전사체 NGS에 대한 DSM-5 진단 기준과 NTUH(National Taiwan University Hospital) 아동 정신 건강 센터의 대사체 프로파일에 따라 ASD의 임상 진단을 받은 120명의 환자를 모집합니다. (2) ASD 프로밴드의 영향을 받지 않은 형제자매(SIB) 40명; 및 (3) 중국 K-SADS-E-DSM-5와 인터뷰한 후 ASD 그룹의 연령 및 이웃 분포에 따른 40명의 건강한 연령/성별 일치 TD 대조군.
설명
포함 기준:
- DSM-5에 의해 정의된 ASD의 임상 진단은 첫 번째 방문 및 다음 방문 시 위원회 인증 아동 정신과 의사가 수행합니다.
- 연령대는 3세부터 20세까지
- 적어도 한 명의 생물학적 부모
- 부모 모두 대만인
- 피험자와 생물학적 부모는 완전한 표현형 평가 및 본 연구를 위한 혈액 회수를 위해 본 연구에 참여하는 데 동의합니다.
제외 기준:
- 정신 분열증
- 분열 정동 장애
- 유기 정신병.
- 허약 X, 지적 장애, 간질, ADHD 및 자가 면역 질환이 있는 프로밴드가 주목됩니다.
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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ASD 그룹
DSM-5 진단 기준에 따라 ASD로 임상 진단을 받은 환자 120명
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DSM-5에 대한 아동 정동 장애 및 정신분열증(K-SADS) 일정
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ASD의 영향을 받지 않는 형제자매
ASD 프로밴드의 영향을 받지 않은 형제자매 40명
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DSM-5에 대한 아동 정동 장애 및 정신분열증(K-SADS) 일정
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TD 그룹
중국 K-SADS-E-DSM-5와의 인터뷰 후 ASD 그룹의 연령 및 이웃 분포에 따른 40명의 건강한 연령/성별 일치 TD 컨트롤
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DSM-5에 대한 아동 정동 장애 및 정신분열증(K-SADS) 일정
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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ASD 관련 transcriptome 프로필
기간: 기준선
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차세대 시퀀싱(NGS) 기술을 사용하여 조사관은 ASD 관련 트랜스크립톰 프로파일을 식별하기 위해 약 120명의 ASD 발동자, 40명의 영향을 받지 않는 형제자매 및 40명의 대만 한족의 건강한 대조군의 전체 엑솜 시퀀싱(WES)(MiSeq 시스템)을 시퀀싱합니다.
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기준선
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2018년 8월 1일
기본 완료 (실제)
2021년 12월 31일
연구 완료 (실제)
2021년 12월 31일
연구 등록 날짜
최초 제출
2018년 9월 17일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2018년 9월 17일
처음 게시됨 (실제)
2018년 9월 19일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2022년 9월 26일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2022년 9월 23일
마지막으로 확인됨
2022년 9월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- 201801044RINC
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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자폐 스펙트럼 장애에 대한 임상 시험
-
University Hospital, Basel, SwitzerlandGebert Rüf-Stiftung모집하지 않고 적극적으로ESBL(Extended Spectrum Beta Lactamases) 대장균스위스
정신과 진단에 대한 임상 시험
-
US Department of Veterans Affairs완전한