Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Dechifrering af autismespektrumforstyrrelsen ud over genomik

23. september 2022 opdateret af: National Taiwan University Hospital

Dechifrering af autismespektrumforstyrrelsen ud over genomik: AI-læring til hele eksomesekvensering, metabolomik og fænotype

Forskerne foreslår at studere den molekylære ætiologi af autismespektrumforstyrrelse (ASD) fra et genomisk, metabolomisk og netværksbiologisk perspektiv ved at kombinere data om genekspression, sekvensvariationer og metabolismeforhold hos patienter med ASD. Som kompleksiteten af ​​ASD betragter efterforskerne både videnskabsbaserede og klinikbaserede målinger for at sikre, at der ikke mangler noget relevant domæne af de komplekse relationer. Ud over indsamlingen af ​​biologiske faktorer vil efterforskerne også indsamle de omfattende kliniske, miljømæssige, neurokognitive MR-billeder for at integrere de mange faktorer i matrixfunktionerne. Endelig vil efterforskerne anvende maskinlæring for at give os aspekterne af understregningsstien tilbage til den anden prøvedistribution, der er offentliggjort som det åbne datasæt, for at verificere og justere funktionerne for at opnå et tilfredsstillende niveau af pålideligheden og stabiliteten af ​​algoritmerne. Med Next Generation Sequencing (NGS)-teknologi vil efterforskerne sekventere hele exome-sekventeringen (WES) (MiSeq System) af cirka 120 ASD-probander, 40 upåvirkende søskende og 40 sunde kontroller af taiwansk Han-population for at identificere ASD-associerede transkriptomprofiler. Resultaterne vil være at bruge real-time PCR (qPCR) eller konventionel Sanger-sekventering til at verificere. Efterforskerne vil bruge både væskekromatografi/time-of-flight massespektrometri (LC-MS) og gaskromatografi/quadrupol massespektrometri (GC-MS) til en fuldstændig vurdering af en bred vifte af metabolitter med over 820 metabolitter. Derfor består dette 3-årige forslag af to hoveddele - ASD-transkriptomsekvensanalysen ved NGS-teknologi og metabolomics-undersøgelsen af ​​ASD via LC-MS- og GC-MS-teknologi.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Primært mål: At etablere et stabilt og pålideligt neurogenesemolekylært niveau og potentielle patogenesemekanismer for ASD ved at bruge maskinlæringstilgangen af ​​de integrerede data af biologiske variable (NGS-data og metabolomics) og de omfattende kliniske, miljømæssige, neurokognitive og MRI-billeder data.

  1. At undersøge størstedelen af ​​kandidatrisikofaktorer fra de mange domæner indsamlet i dette projekt;
  2. At anvende netværksbaserede algoritmer (inklusive deep learning) for at nærme sig den understregende patogenesemekanisme af ASD;
  3. For yderligere at verificere maskinlæringsalgoritmen baseret på data indsamlet i dette projekt gennem en anden open access-database for stabilitet og pålidelighed af vores algoritme.

Sekundære mål:

Mål I: At identificere ASD-biomarkører og sygdomsmekanisme ved hjælp af NGS-teknologi.

  1. At undersøge transkriptomprofilerne, der forekommer hos ASD-patienter;
  2. At identificere ASD-associerede exomsekvensvariationer fra et netværksbiologisk perspektiv;
  3. At identificere ASD-associerede gen-gen-interaktionsundernetværk; og
  4. At udforske, hvordan sekventeringsresultaterne regulerer og interagerer med hjernens struktur og funktion, selv ved at forbinde til neuropsykologiske funktioner og adfærdsfænotyper.

Mål II: At karakterisere ASD-påvirkede metabolitter.

  1. Ved at bruge LC-MS og GC-MS vil vi udføre metabolomiske analyser, herunder målrettede og ikke-målrettede analyser;
  2. At identificere de potentielle metabolomiske profiler og veje relateret til adfærdsfænotyper, neuropsykologiske funktioner, neuroanatomi og hjernefunktioner hos patienter med ASD; og
  3. At identificere, hvordan metabolitternes variansfordelinger manipuleres gennem de genetiske udtryk.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

200

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Taiwan
      • Taipei, Taiwan
        • National Taiwan Univeristy Hospital

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

3 år til 20 år (Barn, Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Denne undersøgelse vil rekruttere (1) 120 patienter med klinisk diagnose af ASD i henhold til DSM-5 diagnostiske kriterier for transkriptomet NGS og metabolitternes profiler fra Children's Mental Health Center på National Taiwan University Hospital (NTUH); (2) 40 upåvirkede søskende (SIB) af ASD probands; og (3) 40 raske alders-/kønsmatchede TD-kontroller i henhold til alders- og nabolagsfordeling af ASD-gruppen efter interview af den kinesiske K-SADS-E-DSM-5.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • en klinisk diagnose af ASD defineret af DSM-5 stillet af bestyrelsescertificerede børnepsykiatere ved det første besøg og efterfølgende besøg
  • alderen spænder fra 3 til 20
  • mindst én biologisk forælder
  • forældre, der begge er taiwanske
  • forsøgspersoner og deres biologiske forældre giver samtykke til at deltage i denne undersøgelse for fuldstændig fænotypevurdering og blodudtagning til denne undersøgelse.

Ekskluderingskriterier:

  • skizofreni
  • skizoaffektiv lidelse
  • organisk psykose.
  • Probander med skrøbelig X, intellektuelle handicap, epilepsi, ADHD og autoimmune sygdomme vil blive noteret.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
ASD gruppe
120 patienter med klinisk diagnose ASD i henhold til DSM-5 diagnostiske kriterier
Andet: Psykiatrisk diagnose
Kiddie-skema for affektive lidelser og skizofreni (K-SADS) til DSM-5
Upåvirkede søskende til ASD
40 upåvirkede søskende af ASD probands
Andet: Psykiatrisk diagnose
Kiddie-skema for affektive lidelser og skizofreni (K-SADS) til DSM-5
TD gruppe
40 raske alders-/kønsmatchede TD-kontroller i henhold til alders- og nabolagsfordeling af ASD-gruppen efter interview af den kinesiske K-SADS-E-DSM-5
Andet: Psykiatrisk diagnose
Kiddie-skema for affektive lidelser og skizofreni (K-SADS) til DSM-5

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
ASD-associerede transkriptomprofiler
Tidsramme: Baseline
Med Next Generation Sequencing (NGS)-teknologi vil efterforskerne sekventere hele exome-sekventeringen (WES) (MiSeq System) af cirka 120 ASD-probander, 40 upåvirkende søskende og 40 sunde kontroller af taiwansk Han-population for at identificere ASD-associerede transkriptomprofiler.
Baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

National Taiwan University Hospital

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. august 2018

Primær færdiggørelse (Faktiske)

31. december 2021

Studieafslutning (Faktiske)

31. december 2021

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

17. september 2018

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

17. september 2018

Først opslået (Faktiske)

19. september 2018

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

26. september 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

23. september 2022

Sidst verificeret

1. september 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 201801044RINC

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Autismespektrumforstyrrelse

Kliniske forsøg med Psykiatrisk diagnose

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Malawi

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

3
Abonner