Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Az autizmus spektrum zavar megfejtése a genomikán túl

2022. szeptember 23. frissítette: National Taiwan University Hospital

Az autizmus spektrumzavar megfejtése a genomikán túl: AI tanulás a teljes exome szekvenáláshoz, metabolizmushoz és fenotípushoz

A kutatók azt javasolják, hogy tanulmányozzák az autizmus spektrumzavar (ASD) molekuláris etiológiáját genomikus, metabolomikai és hálózatbiológiai szempontból az ASD-ben szenvedő betegek génexpressziójára, szekvenciaváltozataira és anyagcsere körülményeire vonatkozó adatok kombinálásával. Az ASD összetettségeként a kutatók mind a tudományos, mind a klinikai alapú méréseket figyelembe veszik annak biztosítására, hogy a komplex összefüggések egyetlen releváns területe se hiányozzon. A biológiai tényezők gyűjtése mellett a kutatók átfogó klinikai, környezeti, neurokognitív, MRI képeket is gyűjtenek, hogy a több tényezőt a mátrix jellemzőibe integrálják. Végül a kutatók a gépi tanulást alkalmazzák, hogy az aláhúzási útvonal szempontjait visszaadják a nyílt adatkészletként közzétett másik mintaeloszlásba, hogy ellenőrizzék és módosítsák a jellemzőket az algoritmusok megbízhatóságának és stabilitásának kielégítő szintjének elérése érdekében. A Next Generation Sequencing (NGS) technológiával a kutatók szekvenálják a teljes exome szekvenálást (WES) (MiSeq System), amely körülbelül 120 ASD-próbát, 40 nem érintett testvért és 40 egészséges tajvani han-populációt tartalmaz, hogy azonosítsa az ASD-vel kapcsolatos transzkripciós profilokat. Az eredmények valós idejű PCR (qPCR) vagy hagyományos Sanger szekvenálás segítségével ellenőrizhetők. A kutatók folyadékkromatográfiát/repülési idő tömegspektrometriát (LC-MS) és gázkromatográfiát/kvadrupól tömegspektrometriát (GC-MS) is alkalmaznak a metabolitok széles skálájának teljes körű értékeléséhez, több mint 820 metabolittal. Ezért ez a 3 éves javaslat két fő részből áll: az ASD transzkripciós szekvencia elemzéséből NGS technológiával és az ASD metabolomikai vizsgálatából LC-MS és GC-MS technológiával.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Befejezve

Körülmények

Beavatkozás / kezelés

Részletes leírás

Elsődleges cél: Stabil és megbízható neurogenezis molekuláris szintű útvonalak és potenciális patogenezis mechanizmusok létrehozása az ASD számára a biológiai változók integrált adatai (NGS adatok és metabolomika) és az átfogó klinikai, környezeti, neurokognitív és MRI képek gépi tanulási megközelítésével. adat.

  1. Megvizsgálni a kockázati tényezők többségét a projektben összegyűjtött több területről;
  2. Hálózat alapú algoritmusok alkalmazása (beleértve a mély tanulást is) az ASD aláhúzó patogenezis mechanizmusának megközelítésére;
  3. A gépi tanulási algoritmus további ellenőrzése a projektben gyűjtött adatok alapján más nyílt hozzáférésű adatbázisokon keresztül algoritmusunk stabilitása és megbízhatósága érdekében.

Másodlagos célok:

I. cél: Az ASD biomarkerek és a betegség mechanizmusának azonosítása NGS technológia segítségével.

  1. Az ASD-s betegekben előforduló transzkriptomprofilok vizsgálata;
  2. Az ASD-vel összefüggő exome szekvencia variációk azonosítása hálózatbiológiai szempontból;
  3. Az ASD-vel kapcsolatos gén-gén interakciós alhálózatok azonosítása; és
  4. Annak feltárása, hogy a szekvenálás hogyan eredményez, szabályozza és kölcsönhatásba lép az agy szerkezetével és működésével, még a neuropszichológiai funkciókkal és viselkedési fenotípusokkal is összekapcsolva.

II. cél: Az ASD-vel érintett metabolitok jellemzése.

  1. Az LC-MS és GC-MS használatával metabolomikai elemzést végzünk, beleértve a célzott és nem célzott elemzéseket is;
  2. Az ASD-s betegek viselkedési fenotípusaihoz, neuropszichológiai funkcióihoz, neuroanatómiájához és agyi funkcióihoz kapcsolódó potenciális metabolomikai profilok és útvonalak azonosítása; és
  3. Annak azonosítása, hogy a metabolitok varianciaeloszlását hogyan manipulálják a genetikai kifejezések.

Tanulmány típusa

Megfigyelő

Beiratkozás (Tényleges)

200

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi helyek

  • Tajvan
      • Taipei, Tajvan
        • National Taiwan Univeristy Hospital

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

3 év (Gyermek, Felnőtt)

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Tanulmányozható nemek

Összes

Mintavételi módszer

Nem valószínűségi minta

Tanulmányi populáció

Ez a tanulmány (1) 120 olyan beteget vesz fel, akiknél az ASD klinikai diagnózisa a DSM-5 diagnosztikai kritériumai szerint a transzkriptom NGS-re és a metabolitprofilokra vonatkozik, a Tajvani Nemzeti Egyetemi Kórház (NTUH) Gyermekmentális Egészségügyi Központjából; (2) 40 nem érintett testvér (SIB) az ASD-probandokból; és (3) a kínai K-SADS-E-DSM-5 által megkérdezett 40 egészséges életkornak/nemnek megfelelő TD-kontroll az ASD-csoport életkora és szomszédsági megoszlása ​​szerint.

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • az ASD klinikai diagnózisa, amelyet a DSM-5 határoz meg, amelyet a testület által igazolt gyermekpszichiáterek végeztek az első és az azt követő vizitek alkalmával
  • életkoruk 3 és 20 év között van
  • legalább egy biológiai szülő
  • szülők, akik mindketten tajvaniak
  • az alanyok és biológiai szüleik beleegyeznek, hogy részt vegyenek ebben a vizsgálatban a teljes fenotípus-értékelés és a vérvétel céljából.

Kizárási kritériumok:

  • skizofrénia
  • skizoaffektív rendellenesség
  • szerves pszichózis.
  • Figyelembe veszik a törékeny X-szel, értelmi fogyatékossággal, epilepsziával, ADHD-vel és autoimmun betegségekkel küzdő probandákat.

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

Kohorszok és beavatkozások

Csoport / Kohorsz
Beavatkozás / kezelés
ASD csoport
120 beteg ASD klinikai diagnózisa a DSM-5 diagnosztikai kritériumok szerint
Egyéb: Pszichiátriai diagnózis
Affektív rendellenességek és skizofrénia (K-SADS) gyermekprogramja a DSM-5 számára
Az ASD nem érintett testvérei
Az ASD-probandok 40 nem érintett testvére
Egyéb: Pszichiátriai diagnózis
Affektív rendellenességek és skizofrénia (K-SADS) gyermekprogramja a DSM-5 számára
TD csoport
40 egészséges életkornak/nemnek megfelelő TD kontroll az ASD-s csoport életkora és szomszédsági megoszlása ​​szerint, miután megkérdezte a kínai K-SADS-E-DSM-5
Egyéb: Pszichiátriai diagnózis
Affektív rendellenességek és skizofrénia (K-SADS) gyermekprogramja a DSM-5 számára

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
ASD-vel kapcsolatos átírási profilok
Időkeret: Alapvonal
A Next Generation Sequencing (NGS) technológiával a kutatók szekvenálják a teljes exome szekvenálást (WES) (MiSeq System), amely körülbelül 120 ASD-próbát, 40 nem érintett testvért és 40 egészséges tajvani han-populációt tartalmaz, hogy azonosítsa az ASD-vel kapcsolatos transzkripciós profilokat.
Alapvonal

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Szponzor

National Taiwan University Hospital

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2018. augusztus 1.

Elsődleges befejezés (Tényleges)

2021. december 31.

A tanulmány befejezése (Tényleges)

2021. december 31.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2018. szeptember 17.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2018. szeptember 17.

Első közzététel (Tényleges)

2018. szeptember 19.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2022. szeptember 26.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2022. szeptember 23.

Utolsó ellenőrzés

2022. szeptember 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

További vonatkozó MeSH feltételek

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • 201801044RINC

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Iratkozz fel