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ゲノミクスを超えて自閉症スペクトラム障害を解読する

2022年9月23日 更新者:National Taiwan University Hospital

ゲノミクスを超えて自閉症スペクトラム障害を解読する: 全エクソーム配列決定、メタボロミクス、表現型のための AI 学習

研究者らは、自閉症スペクトラム障害(ASD)患者の遺伝子発現、配列変異、代謝状態のデータを組み合わせることにより、ゲノム、メタボロミクス、ネットワーク生物学の観点から自閉症スペクトラム障害(ASD)の分子病因を研究することを提案している。 ASD の複雑さとして、研究者らは、複雑な関係の関連領域が欠落していないことを確認するために、科学ベースと臨床ベースの両方の測定を考慮しています。 生物学的因子の収集に加えて、研究者は、複数の因子をマトリックス特徴に統合するために、包括的な臨床画像、環境画像、神経認知画像、MRI 画像も収集します。 最後に、研究者は機械学習を適用して、オープン データセットとして公開されている他のサンプル分布に戻る下線経路の側面を提供し、アルゴリズムの信頼性と安定性の満足のいくレベルを達成するために特徴を検証および調整します。 研究者らは、次世代シーケンス(NGS)技術を用いて、台湾漢民族の約120人のASD発端者、40人の影響を受けていない兄弟、および40人の健常対照者の全エクソームシーケンス(WES)(MiSeqシステム)のシーケンスを行い、ASD関連のトランスクリプトームプロファイルを特定する予定である。 結果は、リアルタイム PCR (qPCR) または従来のサンガー シーケンスを使用して検証されます。 研究者らは、液体クロマトグラフィー/飛行時間型質量分析法 (LC-MS) とガスクロマトグラフィー/四重極質量分析法 (GC-MS) の両方を使用して、820 を超える代謝物を含む広範囲の代謝物の完全な評価を行います。 したがって、この 3 年間の提案は、NGS 技術による ASD トランスクリプトーム配列解析と、LC-MS および GC-MS 技術による ASD のメタボロミクス研究という 2 つの主要な部分で構成されています。

調査の概要

詳細な説明

主な目的: 生物学的変数の統合データ (NGS データとメタボロミクス) および包括的な臨床画像、環境画像、神経認知画像、および MRI 画像の機械学習アプローチを使用して、安定かつ信頼性の高い神経新生の分子レベルの経路と ASD の潜在的な発症メカニズムを確立することデータ。

  1. このプロジェクトで収集された複数のドメインから候補となる危険因子の大部分を調査するため。
  2. ネットワークベースのアルゴリズム(ディープラーニングを含む)を適用して、ASDの根本的な発症メカニズムにアプローチする。
  3. アルゴリズムの安定性と信頼性を確保するために、他のオープンアクセス データベースを通じてこのプロジェクトで収集されたデータに基づいて機械学習アルゴリズムをさらに検証します。

二次的な目的:

目的 I: NGS 技術を使用して ASD バイオマーカーと疾患メカニズムを特定すること。

  1. ASD患者に発生するトランスクリプトームプロファイルを調査する。
  2. ネットワーク生物学の観点から ASD 関連のエクソーム配列変異を特定する。
  3. ASD関連の遺伝子間相互作用サブネットワークを特定する。と
  4. 配列決定がどのように結果をもたらし、脳の構造と機能を調節し、相互作用し、さらには神経心理学的機能や行動表現型にも結びつくのかを探ること。

目的 II: ASD の影響を受ける代謝産物を特徴付けること。

  1. LC-MS および GC-MS を使用して、ターゲット分析および非ターゲット分析を含むメタボロミクス分析を実行します。
  2. ASD患者の行動表現型、神経心理学的機能、神経解剖学的構造および脳機能に関連する潜在的なメタボロミクスプロファイルおよび経路を特定する。と
  3. 遺伝子発現を通じて代謝物の分散分布がどのように操作されるかを特定する。

研究の種類

観察的

入学 (実際)

200

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

      • Taipei、台湾
        • National Taiwan Univeristy Hospital

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

3年~20年 (子、大人)

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

受講資格のある性別

全て

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

この研究では、(1) トランスクリプトーム NGS および国立台湾大学病院小児精神保健センター (NTUH) の代謝物プロファイルの DSM-5 診断基準に従って ASD と臨床診断された 120 人の患者を募集します。 (2) ASD 発端者の影響を受けていない兄弟 (SIB) 40 人。 (3) 中国の K-SADS-E-DSM-5 によるインタビュー後の ASD グループの年齢と近隣分布に基づく、健康な年齢と性別が一致した 40 人の TD 対照。

説明

包含基準:

  • DSM-5によって定義されたASDの臨床診断は、初回およびその後の訪問時に認定児童精神科医によって行われます。
  • 年齢は3歳から20歳まで
  • 少なくとも1人の生物学的親
  • 両親とも台湾人
  • 被験者とその生物学的親は、完全な表現型評価とこの研究のための採血のためにこの研究に参加することに同意します。

除外基準:

  • 統合失調症
  • 統合失調感情障害
  • 器質性精神病。
  • 脆弱X、知的障害、てんかん、ADHD、自己免疫疾患を持つ発端者が注目される。

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
ASDグループ
DSM-5 診断基準に従って ASD と臨床診断された 120 人の患者
DSM-5 の情動障害と統合失調症 (K-SADS) のキディ スケジュール
影響を受けていないASDの兄弟
ASD発端者の影響を受けていない兄弟40人
DSM-5 の情動障害と統合失調症 (K-SADS) のキディ スケジュール
TDグループ
中国の K-SADS-E-DSM-5 によるインタビュー後の、ASD グループの年齢と近隣分布に基づく健康な年齢/性別が一致した TD 対照 40 名
DSM-5 の情動障害と統合失調症 (K-SADS) のキディ スケジュール

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
ASD関連のトランスクリプトームプロファイル
時間枠:ベースライン
研究者らは、次世代シーケンス(NGS)技術を用いて、台湾漢民族の約120人のASD発端者、40人の影響を受けていない兄弟、および40人の健常対照者の全エクソームシーケンス(WES)(MiSeqシステム)のシーケンスを行い、ASD関連のトランスクリプトームプロファイルを特定する予定である。
ベースライン

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2018年8月1日

一次修了 (実際)

2021年12月31日

研究の完了 (実際)

2021年12月31日

試験登録日

最初に提出

2018年9月17日

QC基準を満たした最初の提出物

2018年9月17日

最初の投稿 (実際)

2018年9月19日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2022年9月26日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2022年9月23日

最終確認日

2022年9月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • 201801044RINC

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

自閉症スペクトラム障害の臨床試験

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