Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Het ontcijferen van de autismespectrumstoornis voorbij genomics

23 september 2022 bijgewerkt door: National Taiwan University Hospital

De autismespectrumstoornis ontcijferen die verder gaat dan genomics: AI-leren voor hele exome-sequencing, metabolomica en fenotype

De onderzoekers stellen voor om de moleculaire etiologie van autismespectrumstoornis (ASS) te bestuderen vanuit een genomisch, metabolomisch en netwerkbiologisch perspectief door gegevens over genexpressie, sequentievariaties en metabolismecondities van patiënten met ASS te combineren. Als de complexiteit van ASS beschouwen de onderzoekers zowel op wetenschap gebaseerde als klinische metingen om ervoor te zorgen dat geen enkel relevant domein van de complexe relaties wordt gemist. Naast het verzamelen van biologische factoren, zullen de onderzoekers ook de uitgebreide klinische, omgevings-, neurocognitieve, MRI-beelden verzamelen om de meerdere factoren in de matrixkenmerken te integreren. Ten slotte zullen de onderzoekers machine learning toepassen om ons de aspecten van het onderstreepte pad terug te geven naar de andere steekproefverdeling die is gepubliceerd als de open dataset om de functies te verifiëren en aan te passen om een ​​bevredigend niveau van betrouwbaarheid en stabiliteit van de algoritmen te bereiken. Met Next Generation Sequencing (NGS) -technologie zullen de onderzoekers de hele exome-sequencing (WES) (MiSeq-systeem) van ongeveer 120 ASS-probands, 40 niet-getroffen broers en zussen en 40 gezonde controles van de Taiwanese Han-populatie sequensen om ASS-geassocieerde transcriptoomprofielen te identificeren. De resultaten worden geverifieerd met behulp van real-time PCR (qPCR) of conventionele Sanger-sequencing. De onderzoekers zullen zowel vloeistofchromatografie/time-of-flight massaspectrometrie (LC-MS) als gaschromatografie/quadrupool massaspectrometrie (GC-MS) gebruiken voor een volledige beoordeling van een breed scala aan metabolieten met meer dan 820 metabolieten. Daarom bestaat dit driejarige voorstel uit twee hoofddelen: de ASS-transcriptoomsequentieanalyse door NGS-technologie en de metabolomics-studie van ASS via LC-MS- en GC-MS-technologie.

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Primair doel: het tot stand brengen van stabiele en betrouwbare neurogenese-routes op moleculair niveau en potentiële pathogenese-mechanismen voor ASS door gebruik te maken van de machinale leerbenadering van de geïntegreerde gegevens van biologische variabelen (NGS-gegevens en metabolomics) en de uitgebreide klinische, omgevings-, neurocognitieve en MRI-beelden gegevens.

  1. Onderzoeken van de meeste kandidaat-risicofactoren uit de verschillende domeinen die in dit project zijn verzameld;
  2. Netwerkgebaseerde algoritmen (inclusief deep learning) toepassen om het onderliggende pathogenesemechanisme van ASS te benaderen;
  3. Om het machine learning-algoritme verder te verifiëren op basis van de gegevens die in dit project zijn verzameld via andere open access-databases voor stabiliteit en betrouwbaarheid van ons algoritme.

Secundaire doelen:

Doel I: De ASS-biomarkers en het ziektemechanisme identificeren met behulp van NGS-technologie.

  1. De transcriptoomprofielen onderzoeken die voorkomen bij ASS-patiënten;
  2. ASS-geassocieerde exome-sequentievariaties identificeren vanuit een netwerkbiologisch perspectief;
  3. Om ASS-geassocieerde gen-gen interactie subnetwerken te identificeren; En
  4. Om te onderzoeken hoe de sequencing-resultaten, de hersenstructuur en -functie reguleren en ermee omgaan, zelfs gekoppeld aan neuropsychologische functies en gedragsfenotypes.

Doel II: ASS-getroffen metabolieten karakteriseren.

  1. Door gebruik te maken van LC-MS en GC-MS voeren we metabolomics-analyses uit, inclusief gerichte en ongerichte analyse;
  2. Identificatie van de potentiële metabolomics-profielen en -routes die verband houden met gedragsfenotypes, neuropsychologische functies, neuroanatomie en hersenfuncties bij patiënten met ASS; En
  3. Om te identificeren hoe de variantieverdelingen van de metabolieten worden gemanipuleerd door de genetische expressies.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Werkelijk)

200

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • Taiwan
      • Taipei, Taiwan
        • National Taiwan Univeristy Hospital

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

3 jaar tot 20 jaar (Kind, Volwassen)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Deze studie zal rekruteren (1) 120 patiënten met klinische diagnose van ASS volgens de DSM-5 diagnostische criteria voor de transcriptoom NGS en de metabolietenprofielen van het Children's Mental Health Center in het National Taiwan University Hospital (NTUH); (2) 40 onaangetaste broers en zussen (SIB) van ASS-probands; en (3) 40 gezonde TD-controles op leeftijd/geslacht afgestemd op leeftijd en buurtverdeling van de ASS-groep na geïnterviewd te zijn door de Chinese K-SADS-E-DSM-5.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • een klinische diagnose van ASS gedefinieerd door de DSM-5 gemaakt door board-gecertificeerde kinderpsychiaters bij het eerste bezoek en volgende bezoeken
  • leeftijden variëren van 3 tot 20 jaar
  • minstens één biologische ouder
  • ouders die allebei Taiwanees zijn
  • proefpersonen en hun biologische ouders stemmen ermee in om deel te nemen aan dit onderzoek voor volledige fenotypebeoordelingen en bloedafname voor dit onderzoek.

Uitsluitingscriteria:

  • schizofrenie
  • schizo-affectieve stoornis
  • organische psychose.
  • Probands met fragiele X, verstandelijke beperking, epilepsie, ADHD en auto-immuunziekten zullen worden genoteerd.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
ASS groep
120 patiënten met de klinische diagnose ASS volgens de diagnostische criteria van de DSM-5
Ander: Psychiatrische diagnose
Kiddie-schema voor affectieve stoornissen en schizofrenie (K-SADS) voor DSM-5
Onaangetaste broers en zussen van ASS
40 onaangetaste broers en zussen van ASS-probands
Ander: Psychiatrische diagnose
Kiddie-schema voor affectieve stoornissen en schizofrenie (K-SADS) voor DSM-5
TD groep
40 gezonde leeftijds-/geslachtsafhankelijke TD-controles volgens leeftijd en wijkverdeling van de ASS-groep na geïnterviewd door de Chinese K-SADS-E-DSM-5
Ander: Psychiatrische diagnose
Kiddie-schema voor affectieve stoornissen en schizofrenie (K-SADS) voor DSM-5

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
ASD-geassocieerde transcriptoomprofielen
Tijdsspanne: Basislijn
Met Next Generation Sequencing (NGS) -technologie zullen de onderzoekers de hele exome-sequencing (WES) (MiSeq-systeem) van ongeveer 120 ASS-probands, 40 niet-getroffen broers en zussen en 40 gezonde controles van de Taiwanese Han-populatie sequensen om ASS-geassocieerde transcriptoomprofielen te identificeren.
Basislijn

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

National Taiwan University Hospital

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

1 augustus 2018

Primaire voltooiing (Werkelijk)

31 december 2021

Studie voltooiing (Werkelijk)

31 december 2021

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

17 september 2018

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

17 september 2018

Eerst geplaatst (Werkelijk)

19 september 2018

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

26 september 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

23 september 2022

Laatst geverifieerd

1 september 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 201801044RINC

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Klinische onderzoeken op Autisme Spectrum Stoornis

Zoek naar vergelijkbare onderzoeken

Sponsors en medewerkers

Medische omstandigheden

Geneesmiddelinterventies

CROs by country

CROs in Italy

Voorwaarden

Zeldzame ziekten

Geneesmiddelinterventies

Voedingssupplementen

Sponsor / medewerkers

Locaties

3
Abonneren