이 페이지는 자동 번역되었으며 번역의 정확성을 보장하지 않습니다. 참조하십시오 영문판 원본 텍스트의 경우.

GENOMED4ALL: AI를 통한 MDS 분류 및 예후 개선

2022년 9월 6일 업데이트: Istituto Clinico Humanitas

모든 사람을 위한 게놈 및 맞춤 의학(GENOMED4ALL): 골수이형성 증후군에서 질병 분류 및 예후를 개선하기 위한 인공 지능의 적용.

골수이형성 증후군(MDS)은 일반적으로 노인에게서 발생합니다. 현재 질병 분류 시스템 및 예후 점수(International Prognostic Scoring System, IPSS)는 한계가 있으며 대부분의 경우 개인 수준에서 신뢰할 수 있는 예후 정보를 캡처하지 못합니다. MDS 연구는 게놈 특성화에 의해 빠르게 변형되었으며 돌연변이 스크리닝이 현재 이용 가능한 예후 점수에 중요한 정보를 추가할 수 있다는 증거가 증가하고 있습니다. 이 프로젝트는 맞춤형 의학 접근 방식의 구현을 통해 MDS 분류 및 예후를 개선하기 위한 인공 지능(AI) 기반 솔루션을 개발하는 것을 목표로 합니다. 희귀 혈액 질환에 대한 유럽 참조 네트워크(ERN-EuroBloodNet, FPA 739541)와의 긴밀한 협력을 통해 GENOMED4ALL은 네트워크의 여러 임상 파트너를 포함하는 동시에 ERN-EuroBloodNet에서 추진하는 상호 운용성 표준을 통합하여 수집될 의료 정보 및 리포지토리를 활용합니다. 중앙 레지스트리, 유럽 희귀 혈액 장애 플랫폼(ENROL, GA 947670).

연구 개요

상태

모집하지 않고 적극적으로

상세 설명

골수이형성 증후군(MDS)은 일반적으로 노인에게서 발생합니다. 환자는 말초혈액감소증을 나타내고, 시간이 지남에 따라 이들 피험자의 일부는 급성 골수성 백혈병(AML)으로 발전합니다. MDS의 자연 경과는 정상 수명에 가까운 조건에서 AML에 가까운 형태에 이르기까지 이질적이므로 위험 적응 치료 전략이 필수적입니다. 현재 예후 점수(Revised International Prognostic Scoring System, IPSS-R)에는 한계가 있으며 대부분의 경우 개인 수준에서 신뢰할 수 있는 예후 정보를 캡처하지 못합니다.

MDS에 대한 연구는 게놈 특성화에 의해 빠르게 변형되었습니다. 체세포 돌연변이는 조혈 줄기 세포의 게놈에서 낮지만 정상적인 DNA 복제 동안 감지 가능한 빈도로 발생합니다. 다른 자가 재생 세포에 비해 선택적인 이점을 유발하는 모든 유전적 변형은 클론 우세(clonal haematopoiesis, CH)로 이어질 것입니다. CH의 결과는 추가적인 돌연변이를 획득하고 MDS, 고형 암 및 기타 질병을 개발할 위험이 증가하는 게놈 불안정성입니다. 질병이 진행되는 동안 개별 돌연변이의 시간과 장소 및 클론 출현은 MDS 병인 및 표현형을 더 잘 이해하고 암 예방 전략을 개발하기 위한 핵심 문제입니다.

MDS의 분자 구조를 정의하는 데 중요한 단계가 진행되었습니다. 5q 결실과 관련된 MDS는 RPS14 유전자의 haploinsufficiency에서 유래합니다. Spliceosome 구성 요소를 인코딩하는 유전자는 MDS를 가진 대상의 높은 비율에서 확인되었습니다. 링 사이드로블라스트와 SF3B1 돌연변이 사이에는 밀접한 관계가 있으며 이는 인과 관계와 일치합니다. 또한 DNA 메틸화(DNMT3A, TET2, IDH1/2), 염색질 변형(EZH2, ASXL1), 전사 조절(RUNX1), 신호 전달(KRAS , CBL).

유전자 돌연변이는 MDS에서 생존과 질병 진행 위험에 영향을 미치는 것으로 보고되었으며 돌연변이 상태의 평가는 현재 사용되는 예후 점수에 중요한 정보를 추가할 수 있습니다. 예를 들어 SF3B1 돌연변이는 유리한 예후의 독립적인 예측 인자인 반면 ASXL1, SRSF2, RUNX1, TP53 및 EZH2 유전자의 드라이버 돌연변이는 생존 확률 감소와 관련이 있음을 발견했습니다. 링 사이드로블라스트가 있는 MDS는 초기 클론을 담당하는 돌연변이 유전자의 식별이 임상 결과와 관련이 있다는 최고의 증거를 제공합니다. 사실, 고리 철적아세포는 SF3B1에 기초 돌연변이가 있는 환자뿐만 아니라 SRSF2에 개시 발암성 병변이 있는 환자에서도 발견될 수 있습니다. 그러나 백혈병 없는 생존 중앙값은 전자의 경우 10년 이상이고 후자의 경우 2년 미만입니다.

또한, 돌연변이 스크리닝은 임상 의사결정에 영향을 미칠 수 있습니다. b) HSCT를 받는 환자에서 TP53 돌연변이는 높은 재발 가능성을 예측합니다. c) SF3B1 돌연변이는 TGFb 억제제(luspatercept)에 대한 적혈구계 반응의 확률 증가와 관련이 있고, d) TET2 돌연변이는 HMA에 대한 반응과 관련이 있을 수 있습니다.

이러한 결과에도 불구하고 임상에서 그러한 돌연변이 검사를 즉시 채택하는 것에 대해 주의가 필요합니다. 첫째, 돌연변이 상태에 관계없이 MDS로의 전환이 드물기 때문에 주어진 개인의 돌연변이 존재는 예측력이 제한적입니다. 또한 명백한 MDS 환자에서 유전적 이상은 특정 치료와 관련된 생존에 대한 전체 위험의 일부만을 설명하며, 이는 많은 비율이 여전히 임상 및 비돌연변이 요인과 관련되어 있음을 의미합니다. 유전자-유전자 상호작용 및 유전자형-표현형 상관관계를 연구하기 위한 새로운 방법과 대규모 환자 집단에 대한 종합적인 분석은 각 게놈 이상이 임상 결과 및 치료에 대한 반응에 미치는 독립적인 영향을 정확하게 추정하기 위해 보증됩니다.

이미 사용 가능한 대량의 염기서열 데이터와 임상 정보를 결합함으로써 저자는 AI가 더 나은 MDS 생물학 및 분류를 이해하고 현재 사용 가능한 도구의 예후/예측 능력을 향상하며 보다 표적화된 방식으로 치료를 적용할 수 있을 것이라는 가설을 세웁니다. EU 전역에서 맞춤형 의료 프로그램의 구현을 촉진합니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

13284

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

      • Milano, 이탈리아
        • Istituto Clinico Humanitas

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

MDS의 영향을 받는 환자. 임상 및 게놈 정보를 사용할 수 있는 13284명의 환자

설명

포함 기준:

  • WHO 기준 > 18세에 따른 MDS의 영향을 받는 환자
  • 임상 및 혈액학적 정보의 가용성
  • 표적 돌연변이 스크리닝에 대한 정보의 가용성

제외 기준:

  • 위의 어느 것도

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
GENOMED4ALL - MDS 환자
MDS 환자 13,284명의 표적 돌연변이 스크리닝(MDS 관련 유전자 60개를 포함하는 NGS) 정보

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
MDS 분류 개선
기간: 학업 수료까지 평균 2년
임상 및 혈액학적 정보와 게놈 특징을 통합하여 MDS의 분류를 개선합니다. 이 문제를 해결하기 위해 특정 유전자형을 정의하기 위해 다양한 통계 학습 방법(Dirichlet 프로세스(DP), 베이지안 네트워크(BN)) 및 기계 학습(딥 러닝 물리학 정보 신경망, 제한된 회귀 및 심층 모델)을 비교합니다. 표현형 상관 관계 및 새로운 질병 분류를 개발합니다.
학업 수료까지 평균 2년
MDS 환자의 전체 생존 확률 예측(진단과 사망 사이의 개월 수 또는 후속 조치 종료)
기간: 학업 수료까지 평균 2년

전체 생존(OS)은 진단과 사망(모든 원인의 결과) 또는 추적 종료(검열된 관찰) 사이의 시간(월 단위로 표시됨)으로 정의됩니다.

새로운 예후 점수는 다음과 같은 특징을 포함하여 정의됩니다. 성별(남성 또는 여성); 호중구 수(호중구 수*10^6/L), 혈소판 수(혈소판 수 10^6/L), 헤모글로빈 농도(g/dl), 세포 유전학(IPPS-R 기준에 따라 층화됨, Blood 2012 120: 2454 -2465), 골수 모세포의 백분율 및 유전자 돌연변이의 존재(존재 대 부재).

예측 정확도를 측정하기 위해 다양한 통계적 방법이 사용됩니다(일치 색인, C-지수로 측정): Cox 비례 위험 방법, 무작위 생존 숲, 신경망, CIRI(연속 개별화 위험 지수), 시계열 분석 및 확률론적 마르코프 모델링 궤적 예측

학업 수료까지 평균 2년
MDS 환자의 백혈병 없는 생존 가능성 예측(진단에서 급성 백혈병으로의 진행 또는 추적 종료까지의 개월 수)
기간: 학업 수료까지 평균 2년

백혈병은 진단과 급성 백혈병으로의 진행 또는 추적 종료 사이의 시간(월 단위로 표시)으로 정의됩니다.

새로운 예후 점수는 다음과 같은 특징을 포함하여 정의됩니다. 성별(남성 또는 여성); 호중구 수(호중구 수*10^6/L), 혈소판 수(혈소판 수 10^6/L), 헤모글로빈 농도(g/dl), 세포 유전학(IPPS-R 기준에 따라 층화됨, Blood 2012 120: 2454 -2465), 골수 모세포의 백분율 및 유전자 돌연변이의 존재(존재 대 부재).

예측 정확도를 측정하기 위해 다양한 통계적 방법이 사용됩니다(일치 색인, C-지수로 측정): Cox 비례 위험 방법, 무작위 생존 숲, 신경망, CIRI(연속 개별화 위험 지수), 시계열 분석 및 확률론적 마르코프 모델링 궤적 예측

학업 수료까지 평균 2년

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

수사관

  • 수석 연구원: Federico Alvarez, UNIVERSIDAD POLITECNICA DE MADRID SPAIN
  • 수석 연구원: Lucia Comnes, DATAWIZARD SRL ITALY
  • 수석 연구원: Mar Manu Pereira, FUNDACIO HOSPITAL UNIVERSITARI VALL D'HEBRON - INSTITUT DE RECERCA SPAIN
  • 수석 연구원: Pierre Fenaux, ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS FRANCE
  • 수석 연구원: Torsten Haferlach, MLL MUNCHNER LEUKAMIELABOR GMBH GERMANY
  • 수석 연구원: Maria Diez Campelo, Instituto de investigacion biomedica de Salamanca, IBSAL SPAIN
  • 수석 연구원: Uwe Platzbecker, UNIVERSITAET LEIPZIG GERMANY
  • 수석 연구원: Gastone Castellani, ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA DI BOLOGNA ITALY
  • 수석 연구원: Andres Krogh, KOBENHAVNS UNIVERSITET DENMARK
  • 수석 연구원: Babita Singh, FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA SPAIN
  • 수석 연구원: Piero Fariselli, UNIVERSITA DEGLI STUDI DI TORINO ITALY
  • 수석 연구원: Kostantinos Marias, IDRYMA TECHNOLOGIAS KAI EREVNAS GREECE
  • 수석 연구원: Mar Mañu Pereira, European Reference Network on Rare Hematological Diseases (ERN-EuroBloodNet)

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

일반 간행물

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2021년 3월 15일

기본 완료 (예상)

2022년 12월 15일

연구 완료 (예상)

2024년 12월 31일

연구 등록 날짜

최초 제출

2021년 5월 5일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2021년 5월 12일

처음 게시됨 (실제)

2021년 5월 17일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2022년 9월 9일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2022년 9월 6일

마지막으로 확인됨

2022년 9월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

구독하다