CVC(ICMc)가 있는 중환자실 환자의 피부 미생물군 진화 (ICMc)
2023년 10월 20일 업데이트: Centre Hospitalier de Cayenne
중심정맥카테터(ICMc)를 사용하는 중환자실 환자의 피부 미생물군에 대한 전향적 기술 연구
중환자실(ICU) 환자는 중요한 질병률을 지닌 카테터 관련 감염에 노출됩니다.
카테터 집락화는 일정하지만 감염은 그렇지 않습니다.
피부 세균불균형이 누락된 고리일 수 있습니다.
우리의 연구는 메타게놈학을 통해 중심정맥 카테터를 장착한 중환자실 환자의 피부 미생물군의 진화를 평가하는 것을 목표로 합니다.
우리의 주요 목표는 Shannon 다양성 지수(박테리아 메타유전체학에 사용되는 다양성 지수)의 환자 내 변화에 의해 정량화된 알파 다양성의 진화를 평가하는 것입니다.
연구 개요
상세 설명
중심정맥 카테터(CVC)는 중환자실 환자의 최대 60%에게 필요하며, 이는 높은 이환율과 사망률을 지닌 카테터 관련 감염의 위험을 나타냅니다. 대부분 피부에서 발생하는 카테터 집락화는 일정하지만 감염은 그렇지 않습니다. 세균불균형은 병리학적 상태 및 감염, 예를 들어 항생제 투여 후 C. difficile 설사 또는 아토피성 피부염과 관련이 있는 것으로 알려져 있으며, 이 경우 발적은 세균불균형 및 S. aureus 우세와 관련됩니다. 피부 세균불균형은 카테터 집락화와 감염 사이의 누락된 연결고리일 수 있습니다. 우리의 가설은 여러 ICU 요인(스트레스, 항생제 투여, 국소 감염 절차)의 영향으로 중심 정맥 카테터를 사용하는 ICU 환자에게 피부 불균형이 나타난다는 것입니다.
CVC 배치 적응증이 있는 모든 성인 ICU 환자는 6개월 동안 포함됩니다. CVC 배치(기준선) 전 CVC 삽입 부위에서 피부 면봉 채취를 수행한 다음 CVC가 제자리에 있는 동안 3일마다(또는 드레싱을 변경할 때), 그 다음 ICU 퇴원 시 수행합니다. 박테리아 DNA 추출, 16S PCR 증폭 및 Nanopore 시퀀싱을 사용한 박테리아 메타유전체학을 통해 피부 미생물군에 대한 설명과 Shannon 지수를 통한 다양성 평가가 가능해집니다. 알파 다양성의 진화는 시계열 데이터 분석을 통해 평가됩니다. 즉, 다양한 시점의 Shannon 지수를 기준 Shanonn 지수(CVC 배치 전)와 비교합니다. 피부 면봉 채취의 표준 미생물 배양이 수행됩니다. CVC 감염 및 치료와 관련된 일반적인 환자 특성 및 정보가 수집됩니다.
이 연구는 환자 관리에 아무런 영향을 미치지 않습니다.
카테고리 3 비개입 인간 연구(RIPH 3)
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
120
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 연락처
- 이름: Ariane ROUJANSKY
- 전화번호: +594594395354
- 이메일: ariane.roujansky@ch-cayenne.fr
연구 연락처 백업
- 이름: Hatem KALLEL
- 전화번호: +594594395354
- 이메일: hatem.kallel@ch-cayenne.fr
연구 장소
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-
Guyane Française
-
Cayenne, Guyane Française, 프랑스령 기아나, 97306
- 모병
- Centre Hospitalier de Cayenne
-
연락하다:
- Ariane ROUJANSKY, Dr
- 전화번호: 53 54 +594 594 39 53 54
- 이메일: ariane.roujansky@ch-cayenne.fr
-
연락하다:
- Hatem KALLEL, PhD
- 이메일: hatem.kallel@ch-cayenne.fr
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
예
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
CVC 설치가 표시된 카이엔 병원 센터의 ICU에 입원한 성인
설명
포함 기준:
- CVC 설치가 필요한 카이엔 병원 센터의 ICU에 입원한 성인
제외 기준:
- 18세 미만 환자
- 연구 참여에 반대하는 환자 또는 신뢰하는 사람, 가족 또는 친척(거절)
- 사법적 보호 또는 기타 보호 체제(후견인 또는 큐레이터) 하에 있는 환자
- CVC의 피부 삽입 부위 근처에 피부 병변(감염, 화상)이 있는 환자
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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알파 다양성의 진화
기간: 기준선
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다양한 시점의 Shannon 지수를 기준선 Shannon 지수(집중 치료 서비스를 떠나 중앙 정맥 카테터 배치 전)와 비교합니다.
Shannon 지수가 높을수록 다양성이 커집니다.
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기준선
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알파 다양성의 진화
기간: 3일차
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다양한 시점의 Shannon 지수를 기준선 Shannon 지수(집중 치료 서비스를 떠나 중앙 정맥 카테터 배치 전)와 비교합니다.
Shannon 지수가 높을수록 다양성이 커집니다.
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3일차
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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피부 면봉 Metagenomics
기간: 기준선
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Metagenomics: 피부 면봉의 알파 및 베타 다양성
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기준선
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피부 식민지화
기간: 기준선
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피부 집락화: 피부 면봉의 양성 표준 배양
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기준선
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카테터 관련 집락화
기간: 기준선
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카테터 관련 집락화: 표준 중심선 배양 양성
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기준선
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중심정맥 카테터의 메타유전자학
기간: 기준선
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Metagenomics: 제거 시 중심정맥 카테터의 알파 및 베타 다양성
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기준선
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카테터 관련 감염
기간: 기준선
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임상 징후 및 혈액 배양 및/또는 양성 카테터 배양
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기준선
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피부 면봉 Metagenomics
기간: 3일차
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다양한 시점의 Shannon 지수를 기준선 Shannon 지수(집중 치료 서비스를 떠나 중앙 정맥 카테터 배치 전)와 비교합니다.
Shannon 지수가 높을수록 다양성이 커집니다.
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3일차
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피부 식민지화
기간: 3일차
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피부 집락화: 피부 면봉의 양성 표준 배양
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3일차
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카테터 관련 집락화
기간: 3일차
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카테터 관련 집락화: 표준 중심선 배양 양성
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3일차
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중심정맥 카테터의 메타유전자학
기간: 3일차
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Metagenomics: 제거 시 중심정맥 카테터의 알파 및 베타 다양성
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3일차
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카테터 관련 감염
기간: 3일차
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임상 징후 및 혈액 배양 및/또는 양성 카테터 배양
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3일차
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
협력자
수사관
- 수석 연구원: Ariane ROUJANSKY, Centre Hospitalier de Cayenne
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Aagaard K, Petrosino J, Keitel W, Watson M, Katancik J, Garcia N, Patel S, Cutting M, Madden T, Hamilton H, Harris E, Gevers D, Simone G, McInnes P, Versalovic J. The Human Microbiome Project strategy for comprehensive sampling of the human microbiome and why it matters. FASEB J. 2013 Mar;27(3):1012-22. doi: 10.1096/fj.12-220806. Epub 2012 Nov 19.
- Chien AL, Tsai J, Leung S, Mongodin EF, Nelson AM, Kang S, Garza LA. Association of Systemic Antibiotic Treatment of Acne With Skin Microbiota Characteristics. JAMA Dermatol. 2019 Apr 1;155(4):425-434. doi: 10.1001/jamadermatol.2018.5221.
- Safdar N, Maki DG. The pathogenesis of catheter-related bloodstream infection with noncuffed short-term central venous catheters. Intensive Care Med. 2004 Jan;30(1):62-7. doi: 10.1007/s00134-003-2045-z. Epub 2003 Nov 26.
- Grice EA, Segre JA. The skin microbiome. Nat Rev Microbiol. 2011 Apr;9(4):244-53. doi: 10.1038/nrmicro2537. Erratum In: Nat Rev Microbiol. 2011 Aug;9(8):626.
- Sender R, Fuchs S, Milo R. Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body. PLoS Biol. 2016 Aug 19;14(8):e1002533. doi: 10.1371/journal.pbio.1002533. eCollection 2016 Aug.
- Meylan P, Lang C, Mermoud S, Johannsen A, Norrenberg S, Hohl D, Vial Y, Prod'hom G, Greub G, Kypriotou M, Christen-Zaech S. Skin Colonization by Staphylococcus aureus Precedes the Clinical Diagnosis of Atopic Dermatitis in Infancy. J Invest Dermatol. 2017 Dec;137(12):2497-2504. doi: 10.1016/j.jid.2017.07.834. Epub 2017 Aug 24.
- Raad I, Costerton W, Sabharwal U, Sacilowski M, Anaissie E, Bodey GP. Ultrastructural analysis of indwelling vascular catheters: a quantitative relationship between luminal colonization and duration of placement. J Infect Dis. 1993 Aug;168(2):400-7. doi: 10.1093/infdis/168.2.400.
- Kong HH, Oh J, Deming C, Conlan S, Grice EA, Beatson MA, Nomicos E, Polley EC, Komarow HD; NISC Comparative Sequence Program; Murray PR, Turner ML, Segre JA. Temporal shifts in the skin microbiome associated with disease flares and treatment in children with atopic dermatitis. Genome Res. 2012 May;22(5):850-9. doi: 10.1101/gr.131029.111. Epub 2012 Feb 6.
- Chen HS, Wang FD, Lin M, Lin YC, Huang LJ, Liu CY. Risk factors for central venous catheter-related infections in general surgery. J Microbiol Immunol Infect. 2006 Jun;39(3):231-6.
- Timsit JF. [Updating of the 12th consensus conference of the Societe de Reanimation de langue francaise (SRLF): catheter related infections in the intensive care unit]. Ann Fr Anesth Reanim. 2005 Mar;24(3):315-22. doi: 10.1016/j.annfar.2004.12.022. French.
- Grice EA, Kong HH, Conlan S, Deming CB, Davis J, Young AC; NISC Comparative Sequencing Program; Bouffard GG, Blakesley RW, Murray PR, Green ED, Turner ML, Segre JA. Topographical and temporal diversity of the human skin microbiome. Science. 2009 May 29;324(5931):1190-2. doi: 10.1126/science.1171700.
- Tacconelli E, Smith G, Hieke K, Lafuma A, Bastide P. Epidemiology, medical outcomes and costs of catheter-related bloodstream infections in intensive care units of four European countries: literature- and registry-based estimates. J Hosp Infect. 2009 Jun;72(2):97-103. doi: 10.1016/j.jhin.2008.12.012. Epub 2009 Feb 25.
- Soufir L, Timsit JF, Mahe C, Carlet J, Regnier B, Chevret S. Attributable morbidity and mortality of catheter-related septicemia in critically ill patients: a matched, risk-adjusted, cohort study. Infect Control Hosp Epidemiol. 1999 Jun;20(6):396-401. doi: 10.1086/501639.
- Christensen GD, Simpson WA, Bisno AL, Beachey EH. Adherence of slime-producing strains of Staphylococcus epidermidis to smooth surfaces. Infect Immun. 1982 Jul;37(1):318-26. doi: 10.1128/iai.37.1.318-326.1982.
- Darouiche RO. Device-associated infections: a macroproblem that starts with microadherence. Clin Infect Dis. 2001 Nov 1;33(9):1567-72. doi: 10.1086/323130. Epub 2001 Sep 26.
- Byrd AL, Belkaid Y, Segre JA. The human skin microbiome. Nat Rev Microbiol. 2018 Mar;16(3):143-155. doi: 10.1038/nrmicro.2017.157. Epub 2018 Jan 15.
- Coates M, Lee MJ, Norton D, MacLeod AS. The Skin and Intestinal Microbiota and Their Specific Innate Immune Systems. Front Immunol. 2019 Dec 17;10:2950. doi: 10.3389/fimmu.2019.02950. eCollection 2019.
- Nakatsuji T, Chen TH, Narala S, Chun KA, Two AM, Yun T, Shafiq F, Kotol PF, Bouslimani A, Melnik AV, Latif H, Kim JN, Lockhart A, Artis K, David G, Taylor P, Streib J, Dorrestein PC, Grier A, Gill SR, Zengler K, Hata TR, Leung DY, Gallo RL. Antimicrobials from human skin commensal bacteria protect against Staphylococcus aureus and are deficient in atopic dermatitis. Sci Transl Med. 2017 Feb 22;9(378):eaah4680. doi: 10.1126/scitranslmed.aah4680.
- Chen CH, Tu CC, Kuo HY, Zeng RF, Yu CS, Lu HH, Liou ML. Dynamic change of surface microbiota with different environmental cleaning methods between two wards in a hospital. Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Jan;101(2):771-781. doi: 10.1007/s00253-016-7846-4. Epub 2016 Oct 22.
- Seekatz AM, Young VB. Clostridium difficile and the microbiota. J Clin Invest. 2014 Oct;124(10):4182-9. doi: 10.1172/JCI72336. Epub 2014 Jul 18.
- Sommer F, Anderson JM, Bharti R, Raes J, Rosenstiel P. The resilience of the intestinal microbiota influences health and disease. Nat Rev Microbiol. 2017 Oct;15(10):630-638. doi: 10.1038/nrmicro.2017.58. Epub 2017 Jun 19.
- Hooks KB, O'Malley MA. Dysbiosis and Its Discontents. mBio. 2017 Oct 10;8(5):e01492-17. doi: 10.1128/mBio.01492-17.
- McBride ME, Duncan WC, Knox JM. The environment and the microbial ecology of human skin. Appl Environ Microbiol. 1977 Mar;33(3):603-8. doi: 10.1128/aem.33.3.603-608.1977.
- Cusco A, Catozzi C, Vines J, Sanchez A, Francino O. Microbiota profiling with long amplicons using Nanopore sequencing: full-length 16S rRNA gene and the 16S-ITS-23S of the rrn operon. F1000Res. 2018 Nov 6;7:1755. doi: 10.12688/f1000research.16817.2. eCollection 2018.
- Haegeman B, Hamelin J, Moriarty J, Neal P, Dushoff J, Weitz JS. Robust estimation of microbial diversity in theory and in practice. ISME J. 2013 Jun;7(6):1092-101. doi: 10.1038/ismej.2013.10. Epub 2013 Feb 14.
- Kim BR, Shin J, Guevarra R, Lee JH, Kim DW, Seol KH, Lee JH, Kim HB, Isaacson R. Deciphering Diversity Indices for a Better Understanding of Microbial Communities. J Microbiol Biotechnol. 2017 Dec 28;27(12):2089-2093. doi: 10.4014/jmb.1709.09027.
- Rozas M, Brillet F, Callewaert C, Paetzold B. MinION Nanopore Sequencing of Skin Microbiome 16S and 16S-23S rRNA Gene Amplicons. Front Cell Infect Microbiol. 2022 Jan 5;11:806476. doi: 10.3389/fcimb.2021.806476. eCollection 2021.
- Matsuo Y, Komiya S, Yasumizu Y, Yasuoka Y, Mizushima K, Takagi T, Kryukov K, Fukuda A, Morimoto Y, Naito Y, Okada H, Bono H, Nakagawa S, Hirota K. Full-length 16S rRNA gene amplicon analysis of human gut microbiota using MinION nanopore sequencing confers species-level resolution. BMC Microbiol. 2021 Jan 26;21(1):35. doi: 10.1186/s12866-021-02094-5.
- NCBI Resource Coordinators. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D7-19. doi: 10.1093/nar/gkv1290. Epub 2015 Nov 28.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2023년 6월 2일
기본 완료 (추정된)
2023년 12월 2일
연구 완료 (추정된)
2024년 6월 2일
연구 등록 날짜
최초 제출
2023년 6월 20일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2023년 10월 20일
처음 게시됨 (실제)
2023년 10월 23일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2023년 10월 23일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2023년 10월 20일
마지막으로 확인됨
2023년 5월 1일
추가 정보
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