- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT06095076
Evoluce kožní mikroflóry u pacientů na JIP s CVC (ICMc) (ICMc)
Prospektivní deskriptivní studie kožní mikrobioty pacientů na JIP s centrálním žilním katétrem (ICMc)
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Centrální žilní katetry (CVC) jsou nezbytné až u 60 % pacientů na JIP, což představuje riziko infekcí souvisejících s katetrem s vysokou morbiditou a mortalitou. Kolonizace katetru pocházející převážně z kůže je konstantní, ale infekce nikoliv. Je známo, že dysbióza je spojena s patologickými stavy a infekcí, například postantibiotickými průjmy C. difficile nebo atopickou dermatitidou, u kterých jsou vzplanutí spojeny s dysbiózou a převahou S. aureus. Kožní dysbióza by mohla být chybějícím článkem mezi kolonizací katetru a infekcí. Naší hypotézou je, že pod vlivem více faktorů JIP (stres, podávání antibiotik, lokální dysinfekční postupy) se u pacientů na JIP s centrálním žilním katétrem objevuje kožní dybióza.
Všichni dospělí pacienti na JIP s indikací pro umístění CVC budou zahrnuti po dobu 6 měsíců. Výtěr kůže bude proveden v místě zavedení CVC před umístěním CVC (základní hodnota) a poté každé 3 dny (nebo při výměně obvazu), když je CVC na místě, a poté při propuštění z JIP. Bakteriální metagenomika využívající extrakci bakteriální DNA, 16S PCR amplifikace a sekvenování Nanopore umožní popis kožní mikroflóry a hodnocení diverzity pomocí Shannonova indexu. Vývoj alfa-diverzity bude hodnocen pomocí analýzy dat časových řad: srovnání Shannonova indexu v různých časových bodech s výchozím Shanonnovým indexem (před umístěním CVC). Bude provedena standardní mikrobiologická kultivace kožních stěrů. Budou shromažďovány obecné charakteristiky pacientů a informace týkající se infekce CVC a léčby.
Tato studie nebude mít žádný vliv na léčbu pacientů.
Kategorie 3 Neintervenční výzkum lidské osoby (RIPH 3)
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Ariane ROUJANSKY
- Telefonní číslo: +594594395354
- E-mail: ariane.roujansky@ch-cayenne.fr
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Hatem KALLEL
- Telefonní číslo: +594594395354
- E-mail: hatem.kallel@ch-cayenne.fr
Studijní místa
-
-
Guyane Française
-
Cayenne, Guyane Française, Francouzská Guyana, 97306
- Nábor
- Centre Hospitalier de Cayenne
-
Kontakt:
- Ariane ROUJANSKY, Dr
- Telefonní číslo: 53 54 +594 594 39 53 54
- E-mail: ariane.roujansky@ch-cayenne.fr
-
Kontakt:
- Hatem KALLEL, PhD
- E-mail: hatem.kallel@ch-cayenne.fr
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Dospělí hospitalizovaní na JIP v Cayenne Hospital Center, u kterých je indikována instalace CVC
Kritéria vyloučení:
- Pacient mladší 18 let
- Pacient nebo důvěryhodná osoba nebo rodina nebo příbuzný vznášející námitky proti účasti ve studii (odmítnutí)
- Pacient pod soudní ochranou nebo v jiném ochranném režimu (opatrovnictví nebo opatrovnictví)
- Pacient s kožními lézemi (infekce, popálenina) v blízkosti místa kožního zavedení CVC
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Evoluce alfa-diverzity
Časové okno: Základní linie
|
Porovnání Shannonova indexu v různých časových bodech s výchozím Shannonovým indexem (před zavedením centrálního žilního katétru po opuštění služby intenzivní péče).
Čím vyšší je Shannonův index, tím větší je diverzita.
|
Základní linie
|
|
Evoluce alfa-diverzity
Časové okno: Den 3
|
Porovnání Shannonova indexu v různých časových bodech s výchozím Shannonovým indexem (před zavedením centrálního žilního katétru po opuštění služby intenzivní péče).
Čím vyšší je Shannonův index, tím větší je diverzita.
|
Den 3
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Kožní výtěry Metagenomics
Časové okno: Základní linie
|
Metagenomika: Alfa a beta-diverzita kožních výtěrů
|
Základní linie
|
|
Kolonizace kůže
Časové okno: Základní linie
|
Kolonizace kůže: pozitivní standardní kultura kožních stěrů
|
Základní linie
|
|
Kolonizace související s katétrem
Časové okno: Základní linie
|
Kolonizace související s katétrem: standardní pozitivita kultivace centrální linie
|
Základní linie
|
|
Metagenomika centrálního žilního katétru
Časové okno: Základní linie
|
Metagenomika: alfa a beta-diverzita centrálního žilního katetru při odstranění
|
Základní linie
|
|
Infekce související s katétrem
Časové okno: Základní linie
|
Klinické příznaky a hemokultura a/nebo pozitivní katetrizační kultivace
|
Základní linie
|
|
Kožní výtěry Metagenomics
Časové okno: Den 3
|
Porovnání Shannonova indexu v různých časových bodech s výchozím Shannonovým indexem (před zavedením centrálního žilního katétru po opuštění služby intenzivní péče).
Čím vyšší je Shannonův index, tím větší je diverzita.
|
Den 3
|
|
Kolonizace kůže
Časové okno: Den 3
|
Kolonizace kůže: pozitivní standardní kultura kožních stěrů
|
Den 3
|
|
Kolonizace související s katétrem
Časové okno: Den 3
|
Kolonizace související s katétrem: standardní pozitivita kultivace centrální linie
|
Den 3
|
|
Metagenomika centrálního žilního katétru
Časové okno: Den 3
|
Metagenomika: alfa a beta-diverzita centrálního žilního katetru při odstranění
|
Den 3
|
|
Infekce související s katétrem
Časové okno: Den 3
|
Klinické příznaky a hemokultura a/nebo pozitivní katetrizační kultivace
|
Den 3
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Ariane ROUJANSKY, Centre Hospitalier de Cayenne
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Aagaard K, Petrosino J, Keitel W, Watson M, Katancik J, Garcia N, Patel S, Cutting M, Madden T, Hamilton H, Harris E, Gevers D, Simone G, McInnes P, Versalovic J. The Human Microbiome Project strategy for comprehensive sampling of the human microbiome and why it matters. FASEB J. 2013 Mar;27(3):1012-22. doi: 10.1096/fj.12-220806. Epub 2012 Nov 19.
- Chien AL, Tsai J, Leung S, Mongodin EF, Nelson AM, Kang S, Garza LA. Association of Systemic Antibiotic Treatment of Acne With Skin Microbiota Characteristics. JAMA Dermatol. 2019 Apr 1;155(4):425-434. doi: 10.1001/jamadermatol.2018.5221.
- Safdar N, Maki DG. The pathogenesis of catheter-related bloodstream infection with noncuffed short-term central venous catheters. Intensive Care Med. 2004 Jan;30(1):62-7. doi: 10.1007/s00134-003-2045-z. Epub 2003 Nov 26.
- Grice EA, Segre JA. The skin microbiome. Nat Rev Microbiol. 2011 Apr;9(4):244-53. doi: 10.1038/nrmicro2537. Erratum In: Nat Rev Microbiol. 2011 Aug;9(8):626.
- Sender R, Fuchs S, Milo R. Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body. PLoS Biol. 2016 Aug 19;14(8):e1002533. doi: 10.1371/journal.pbio.1002533. eCollection 2016 Aug.
- Meylan P, Lang C, Mermoud S, Johannsen A, Norrenberg S, Hohl D, Vial Y, Prod'hom G, Greub G, Kypriotou M, Christen-Zaech S. Skin Colonization by Staphylococcus aureus Precedes the Clinical Diagnosis of Atopic Dermatitis in Infancy. J Invest Dermatol. 2017 Dec;137(12):2497-2504. doi: 10.1016/j.jid.2017.07.834. Epub 2017 Aug 24.
- Raad I, Costerton W, Sabharwal U, Sacilowski M, Anaissie E, Bodey GP. Ultrastructural analysis of indwelling vascular catheters: a quantitative relationship between luminal colonization and duration of placement. J Infect Dis. 1993 Aug;168(2):400-7. doi: 10.1093/infdis/168.2.400.
- Kong HH, Oh J, Deming C, Conlan S, Grice EA, Beatson MA, Nomicos E, Polley EC, Komarow HD; NISC Comparative Sequence Program; Murray PR, Turner ML, Segre JA. Temporal shifts in the skin microbiome associated with disease flares and treatment in children with atopic dermatitis. Genome Res. 2012 May;22(5):850-9. doi: 10.1101/gr.131029.111. Epub 2012 Feb 6.
- Chen HS, Wang FD, Lin M, Lin YC, Huang LJ, Liu CY. Risk factors for central venous catheter-related infections in general surgery. J Microbiol Immunol Infect. 2006 Jun;39(3):231-6.
- Timsit JF. [Updating of the 12th consensus conference of the Societe de Reanimation de langue francaise (SRLF): catheter related infections in the intensive care unit]. Ann Fr Anesth Reanim. 2005 Mar;24(3):315-22. doi: 10.1016/j.annfar.2004.12.022. French.
- Grice EA, Kong HH, Conlan S, Deming CB, Davis J, Young AC; NISC Comparative Sequencing Program; Bouffard GG, Blakesley RW, Murray PR, Green ED, Turner ML, Segre JA. Topographical and temporal diversity of the human skin microbiome. Science. 2009 May 29;324(5931):1190-2. doi: 10.1126/science.1171700.
- Tacconelli E, Smith G, Hieke K, Lafuma A, Bastide P. Epidemiology, medical outcomes and costs of catheter-related bloodstream infections in intensive care units of four European countries: literature- and registry-based estimates. J Hosp Infect. 2009 Jun;72(2):97-103. doi: 10.1016/j.jhin.2008.12.012. Epub 2009 Feb 25.
- Soufir L, Timsit JF, Mahe C, Carlet J, Regnier B, Chevret S. Attributable morbidity and mortality of catheter-related septicemia in critically ill patients: a matched, risk-adjusted, cohort study. Infect Control Hosp Epidemiol. 1999 Jun;20(6):396-401. doi: 10.1086/501639.
- Christensen GD, Simpson WA, Bisno AL, Beachey EH. Adherence of slime-producing strains of Staphylococcus epidermidis to smooth surfaces. Infect Immun. 1982 Jul;37(1):318-26. doi: 10.1128/iai.37.1.318-326.1982.
- Darouiche RO. Device-associated infections: a macroproblem that starts with microadherence. Clin Infect Dis. 2001 Nov 1;33(9):1567-72. doi: 10.1086/323130. Epub 2001 Sep 26.
- Byrd AL, Belkaid Y, Segre JA. The human skin microbiome. Nat Rev Microbiol. 2018 Mar;16(3):143-155. doi: 10.1038/nrmicro.2017.157. Epub 2018 Jan 15.
- Coates M, Lee MJ, Norton D, MacLeod AS. The Skin and Intestinal Microbiota and Their Specific Innate Immune Systems. Front Immunol. 2019 Dec 17;10:2950. doi: 10.3389/fimmu.2019.02950. eCollection 2019.
- Nakatsuji T, Chen TH, Narala S, Chun KA, Two AM, Yun T, Shafiq F, Kotol PF, Bouslimani A, Melnik AV, Latif H, Kim JN, Lockhart A, Artis K, David G, Taylor P, Streib J, Dorrestein PC, Grier A, Gill SR, Zengler K, Hata TR, Leung DY, Gallo RL. Antimicrobials from human skin commensal bacteria protect against Staphylococcus aureus and are deficient in atopic dermatitis. Sci Transl Med. 2017 Feb 22;9(378):eaah4680. doi: 10.1126/scitranslmed.aah4680.
- Chen CH, Tu CC, Kuo HY, Zeng RF, Yu CS, Lu HH, Liou ML. Dynamic change of surface microbiota with different environmental cleaning methods between two wards in a hospital. Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Jan;101(2):771-781. doi: 10.1007/s00253-016-7846-4. Epub 2016 Oct 22.
- Seekatz AM, Young VB. Clostridium difficile and the microbiota. J Clin Invest. 2014 Oct;124(10):4182-9. doi: 10.1172/JCI72336. Epub 2014 Jul 18.
- Sommer F, Anderson JM, Bharti R, Raes J, Rosenstiel P. The resilience of the intestinal microbiota influences health and disease. Nat Rev Microbiol. 2017 Oct;15(10):630-638. doi: 10.1038/nrmicro.2017.58. Epub 2017 Jun 19.
- Hooks KB, O'Malley MA. Dysbiosis and Its Discontents. mBio. 2017 Oct 10;8(5):e01492-17. doi: 10.1128/mBio.01492-17.
- McBride ME, Duncan WC, Knox JM. The environment and the microbial ecology of human skin. Appl Environ Microbiol. 1977 Mar;33(3):603-8. doi: 10.1128/aem.33.3.603-608.1977.
- Cusco A, Catozzi C, Vines J, Sanchez A, Francino O. Microbiota profiling with long amplicons using Nanopore sequencing: full-length 16S rRNA gene and the 16S-ITS-23S of the rrn operon. F1000Res. 2018 Nov 6;7:1755. doi: 10.12688/f1000research.16817.2. eCollection 2018.
- Haegeman B, Hamelin J, Moriarty J, Neal P, Dushoff J, Weitz JS. Robust estimation of microbial diversity in theory and in practice. ISME J. 2013 Jun;7(6):1092-101. doi: 10.1038/ismej.2013.10. Epub 2013 Feb 14.
- Kim BR, Shin J, Guevarra R, Lee JH, Kim DW, Seol KH, Lee JH, Kim HB, Isaacson R. Deciphering Diversity Indices for a Better Understanding of Microbial Communities. J Microbiol Biotechnol. 2017 Dec 28;27(12):2089-2093. doi: 10.4014/jmb.1709.09027.
- Rozas M, Brillet F, Callewaert C, Paetzold B. MinION Nanopore Sequencing of Skin Microbiome 16S and 16S-23S rRNA Gene Amplicons. Front Cell Infect Microbiol. 2022 Jan 5;11:806476. doi: 10.3389/fcimb.2021.806476. eCollection 2021.
- Matsuo Y, Komiya S, Yasumizu Y, Yasuoka Y, Mizushima K, Takagi T, Kryukov K, Fukuda A, Morimoto Y, Naito Y, Okada H, Bono H, Nakagawa S, Hirota K. Full-length 16S rRNA gene amplicon analysis of human gut microbiota using MinION nanopore sequencing confers species-level resolution. BMC Microbiol. 2021 Jan 26;21(1):35. doi: 10.1186/s12866-021-02094-5.
- NCBI Resource Coordinators. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D7-19. doi: 10.1093/nar/gkv1290. Epub 2015 Nov 28.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 2023_006
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Stěr z kůže
-
University of New MexicoDokončenoVariabilita srdeční frekvence | Předčasně narozené dítěSpojené státy
-
Istanbul University - Cerrahpasa (IUC)DokončenoBolest | Venipunkce | DotekKrocan
-
Children's Hospital of Fudan UniversityDokončeno
-
Northwestern UniversityDokončeno
-
Kerecis Ltd.Zápis na pozvánkuChirurgická rána | Diabetický vřed na nohou | Žilní bércový vřed | Dekubity | Rány | Vyztužení měkkých tkáníSpojené státy
-
Massachusetts General HospitalDokončenoKožní léze | Pigmentované léze | Pigmentovaná kožní léze | Pigmentované krtkySpojené státy
-
The Cleveland ClinicStaženo
-
Pusan National University Yangsan HospitalDokončeno
-
Sakarya UniversityDokončenoDěti | Ovládnutí bolesti | PředškolníTurecko (Türkiye)
-
Mayo ClinicNáborGastrostomieSpojené státy