이탈리아 신생아 장바이러스 감염: 에코바이러스 11에 대한 바이러스학적 특성, 유전체 및 임상역학적 통찰 (Entero-Neo)

피코르나바이러스과(Picornaviridae family)에 속하는 엔테로바이러스속(Enterovirus genus)은 양성 편극 단일 가닥 RNA 바이러스로, 엔테로바이러스(Enterovirus, EV, 콕사키바이러스(Coxsackievirus), 에코바이러스(Echovirus), 폴리오바이러스(Poliovirus) 포함) A-J종과 라이노바이러스(Rhinovirus, RV) A-C종으로 분류되며, 200종 이상의 다른 유전자형이 보고되었습니다. 엔테로바이러스는 전 세계적으로 퍼져 있으며, 발열성, 위장관 및 발진성 질환의 흔한 원인으로, 일반적으로 자가 제한적이며 영아 및 소아 인구에서 널리 퍼져 있습니다. 그러나 이들은 가끔 수막뇌염, 척수염, 마비, 심근염, 패혈증, 중증 호흡기 증후군 및 급성 간염을 포함한 심각한 질병을 일으킬 수 있습니다. 이들은 호흡기 경로로 전파될 수 있으며, 온대 지역의 대부분의 사례는 여름과 초가을에 발생합니다. 엔테로바이러스는 높은 돌연변이율(교정 활동이 없는 RNA 의존성 RNA 중합효소의 존재로 인해)과 재조합 사건을 겪을 높은 확률에 의해 결정되는 빠른 진화가 특징입니다. 후자, 특히 형간 재조합은 엔테로바이러스의 진화 과정에서 중요한 역할을 하며, 더 높은 병원성 및/또는 유행 가능성을 가진 균주의 출현의 주요 원인으로 인식되었지만, 관련된 유전적 결정인자는 현재까지 알려지지 않았습니다. 2022년 7월부터 2023년 4월까지, 프랑스에서 중증 간부전과 신경학적 및 심근 침범을 동반한 신생아 에코바이러스 11(E-11) 감염 9건이 보고되었습니다; 이 중 7건은 치명적인 결과를 초래했습니다. 이러한 보고에 이어, 세계보건기구(WHO)는 경보를 발령했으며, 이는 빠르게 이탈리아, 스페인, 크로아티아 및 영국에서 추가 사례를 확인하는 데 이어졌습니다. EV 감염은 체계적인 감시 대상이 아니기 때문에, 이러한 감염과 관련된 실제 질병 부담에 대한 데이터가 부족합니다. 따라서 EV 감염은 과소평가되며, 더욱이 그들의 형별에 대한 데이터는 부족합니다—없는 경우도 있습니다—이는 일반적으로 임상 미생물학 진단 실험실에서 일상적으로 수행되지 않는 2차 분석을 수반하며, 거의 이용 가능하지 않고 체계적으로 수집되지 않으며, 유럽 수준에서도 마찬가지입니다. 따라서 이는 일반적으로 EV 감염의 영향과 특히 E-11의 영향을 추정하는 것을 불가능하게 하며, 가장 심각한 사례와 가장 중요한 전파 경로와 관련된 위험 요인도 추정할 수 없게 합니다. 또한, 감염에 대한 면역학적 및 염증 반응의 특성은 아직 정의되지 않았습니다. 이러한 요소들은, 이용 가능하다면, 신속한 실험실 확인과 질병 인식을 보장하기 위한 특정 사례 정의를 공식화할 수 있게 할 것입니다.프로젝트의 제안된 목표 범위 내에서 다음 활동을 수행함으로써, E-11에 초점을 맞춰 신생아의 엔테로바이러스 감염 확산과 영향에 대한 지식을 강화하기 위해: 국가적 적용 가능성이 있는 역학 및 유전체 감시 시스템의 설계 및 파일럿 구현(개념 증명); 분자 특성화 및 바이러스 병원성 특징 평가; 중증 EV 질병( E-11 포함)과 관련된 가능한 면역학적 표지자와 숙주 위험 요인 탐색.

구체적 목표

1. 신생아 병동 및 신생아 중환자실에서 EV에 의한 감염 존재를 확인하고 중증 감염 형태를 식별하기 위한 선별 활동 프로토콜을 구현하고 검증하며, 특히 E-11에 주의를 기울입니다.
2. 구체적 목표 1에 의해 수행된 활동 내에서 확인된 EV 균주를 특성화하며, 차세대 염기서열 분석(NGS) 접근법을 사용하여 전체 게놈 서열을 얻고 가능한 재조합 형태를 식별합니다. 획득한 서열을 주요 국제 데이터베이스에 저장된 서열과 비교하여 계통 발생 분석을 수행하고, 변종 균주 또는 게놈 내 특정 돌연변이로 추적 가능한 게놈을 정의합니다.