Moleculair genetische epidemiologie van drie hartafwijkingen -SCOR bij pediatrische hart- en vaatziekten

ACHTERGROND:

Aangeboren hartafwijkingen (CHD's) worden verondersteld het gevolg te zijn van genetische en omgevingsfactoren die de embryogenese van het hart verstoren. Omdat families met meerdere leden met atriumseptumdefecten (ASS) en atrioventriculaire kanaaldefecten (AVCD's) in eerdere studies zijn beschreven en het paramembraneuze ventriculaire septum gedeeltelijk wordt voltooid door de vorming van de atrioventriculaire kussens, beschrijft dit project een genetisch- epidemiologische studie van ASS, paramembraneuze ventriculaire septumdefecten (VSD's) en AVCD's

ONTWERP VERHAAL:

De studie is een van de vele subprojecten binnen een Specialized Centre of Research (SCOR) in pediatrische cardiovasculaire aandoeningen. Drie groepen proefpersonen, elk met chirurgisch of echocardiografisch bevestigde diagnoses van ASD's, VSD's of AVCD's, zijn geïdentificeerd voor onderzoek aan de University of Iowa Hospitals and Clinics en aan het Wolfson Children's Hospital in Jacksonville, Florida. Een vierde groep oudere proefpersonen met ASS en hun nageslacht zal in Iowa worden bestudeerd vanwege het hoge aantal herhalingen van hartaandoeningen bij de nakomelingen van proefpersonen met ASS. De strategie doet een beroep op de moleculair genetische capaciteiten die beschikbaar zijn aan de Universiteit van Iowa om genoombrede zoekopdrachten uit te voeren naar genetische loci die betrokken zijn bij deze defecten. Er zijn verschillende kandidaat-regio's geïdentificeerd voor ASS, VSD's en AVCD's. Daarnaast bieden drie algemeen erkende syndromen aanvullende kandidaat-regio's: het syndroom van Down, het Holt-Oram-syndroom en het 8p-syndroom. Trio's van door ouders getroffen kinderen zullen worden gegenotypeerd op dicht bij elkaar gelegen markers binnen deze regio's en koppelingsonevenwichtsanalyse zal worden gebruikt om deze kandidaat-intervallen te verkleinen of uit te sluiten. Een genoombrede associatiestudie van de trio's zal een spaarzame techniek gebruiken waarbij DNA van gevallen met hetzelfde CHD-fenotype wordt samengevoegd en vergeleken met het samengevoegde DNA van hun ouders. Er zullen loci worden geïdentificeerd waar de allelfrequentieverdelingen bij de getroffen kinderen en hun ouders significant verschillen. Wanneer dergelijke loci worden geïdentificeerd, zal een fijnere lokalisatie van het chromosomale gebied worden uitgevoerd met behulp van een set met hoge dichtheid van korte achter elkaar herhaalde polymorfe markers die elk van de kandidaat-intervallen overspannen.

De voltooiingsdatum van het onderzoek die in dit document wordt vermeld, is verkregen uit de "Einddatum" die is ingevoerd in het protocolregistratie- en resultatensysteem (PRS)-record.