Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Methode van genetische analyse in Genodermatosen (GENODERM)

11 april 2019 bijgewerkt door: Queen Fabiola Children's University Hospital

Ontwikkeling van een genetische analysemethode door mendeliomen en genomen bij de diagnose van genodermatose en zeldzame genetische ziekten met huidexpressie

Het doel van de studie is het ontwikkelen van een methode voor genetische diagnose in twee fasen, door mendelioom en vervolgens door genoom en transcriptoom op fibroblastcultuur, bij genodermatose en zeldzame ziekten met cutane expressie bij het kind.

Studie Overzicht

Toestand

Onbekend

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Interventionele multicenter prospectieve studie. Patiënten worden onderzocht door een dermatoloog om de verschillende huidlaesies te beschrijven en te identificeren. Samenwerking met het team van genetici: klinisch onderzoek voor relevante gevallen. Patiëntendossiers worden geraadpleegd. Relevante medische informatie, biologische onderzoeken en andere aanvullende onderzoeken worden bestudeerd.

Er wordt een bloedmonster (10 ml in EDTA-buisje) afgenomen bij de patiënt en zijn/haar ouders om DNA op te slaan voor mediome en genoom.

Een schriftelijke toestemming van de ouders en het kind (indien geschikt voor de leeftijd) zal worden verkregen en een studie-informatieblad zal worden ondertekend. Ze zullen ook het gebruikelijke genetische toestemmingsverzoek ondertekenen voor mendeliome, genoom en transcriptoom op kweek van fibroblasten.

Een 4 mm punch huidbiopsie (gezond of beschadigd afhankelijk van fenotype en indicatie) wordt uitgevoerd volgens de standaardtechniek.

De fibroblastcultuur zal routinematig worden uitgevoerd door het Genetisch Centrum Transcriptome zal worden uitgevoerd volgens de processen die zijn opgezet in het Genetisch Centrum Mendeliome-analyse

  • Maakt de analyse van 4000 genen voor zeldzame ziekten mogelijk
  • Wordt uitgevoerd volgens routinematige analyses van het genetica lab
  • Gebruikt de Highlander-tools (web)
  • Gebruik van de novo-filters, autosomaal recessief, heterozygoot samengesteld, X-gekoppeld, sterke variant (LOF en canonieke splitsingsplaatsen)
  • Gebruik van zeldzamere filters: exomische of gendeletie, splicing (+/- 12 basenparen rond exons)
  • In onverklaarbare ernstige gevallen wordt een genoom aangevuld met de 10Xgenomics-methode en een transcriptoom van fibroblasten gerealiseerd. Deze dubbele strategie maakt het mogelijk om een ​​genoom van hoge interpretatieve kwaliteit te krijgen. Genoomanalyse volgens de 10Xgenomics-methode (https://www.10xgenomics.com )
  • Met deze methode kunnen we haplotypes deconvoleren en kunnen we 16.000 andere complementaire genen analyseren en nauwkeurig gedefinieerde structurele varianten verkrijgen.
  • Het transcriptoom zal de genomische effecten op genexpressie beter beoordelen.
  • Het genoom en transcriptoom zullen ook de aanwezigheid van diepe intronmutaties en hun effect op splicing beoordelen, en zullen een duurzame hulpbron zijn voor andere langetermijnprojecten (analyse van niet-coderende regio's, microRNA's, enz.)

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Verwacht)

100

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • België
      • Brussels, België, 1020
        • Werving
        • Hôpital Universitaire Des Enfants Rein Fabiola
        • Contact:
        • Hoofdonderzoeker:
          • Deborah Salik, MD

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

Niet ouder dan 14 jaar (Kind, Volwassen)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Kinderen van 0 tot 18 jaar
  • Aanwezigheid van dermatologische symptomen die duiden op genodermatose
  • Aanwezigheid van systemische symptomen bij een niet-gediagnosticeerde patiënt geassocieerd met dermatologische manifestaties die wijzen op een meer zeldzame genetische aandoening met cutane expressie

Uitsluitingscriteria:

  • Mozaïek
  • Neurofibromatose, alle soorten
  • Tubereuze sclerose
  • Ichthyosis vulgaris
  • Verdenking van somatische stoornissen (gigantische naevus)

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Diagnostisch
  • Toewijzing: NVT
  • Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
  • Masker: Geen (open label)

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Experimenteel: Patiënten met genodermatose
Kinderen tussen 0 en 18 jaar met de aanwezigheid van dermatologische symptomen die wijzen op genodermatose of de aanwezigheid van systemische symptomen bij een niet-gediagnosticeerde patiënt geassocieerd met dermatologische manifestaties die wijzen op een zeldzamere genetische aandoening met cutane expressie
Genetisch: Genetische diagnostiek door mendeliome of genoom
Voor gevallen die niet worden verklaard door een mendeliomen: genoom en transcriptoom op fibroblastkweek

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Genetische diagnostiek door mendeliome
Tijdsspanne: Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Percentage patiënten bij wie een genetische diagnose is gesteld met behulp van de mendeliome-methode. American College of Medical Genetics en Genomics. Diagnostische varianten worden geclassificeerd als "pathogene" of "waarschijnlijk pathogene" varianten.
Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Genetische diagnostiek per genoom
Tijdsspanne: Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Aandeel patiënten bij wie een genetische diagnose is gesteld met behulp van de genoommethode. American College of Medical Genetics en Genomics. Diagnostische varianten worden geclassificeerd als "pathogene" of "waarschijnlijk pathogene" varianten.
Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Genetische diagnostiek door fibroblasttranscriptoom
Tijdsspanne: Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Percentage patiënten bij wie een genetische diagnose is gesteld met behulp van de fibroblast-transcriptoommethode. American College of Medical Genetics en Genomics. Diagnostische varianten worden geclassificeerd als "pathogene" of "waarschijnlijk pathogene" varianten.
Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Relevantie van dermatologische symptomen
Tijdsspanne: Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose
Correlatie tussen dermatologische tekenen en symptomen en een genetische diagnose vastgesteld door de mendelioma-, genoom- en transcriptoommethode
Ten tijde van de klinische diagnose van genodermatose

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Queen Fabiola Children's University Hospital

Medewerkers

Center of Human Genetics - ULB in Brussels
Interuniversity Institute of Bioinformatics in Brussels

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Deborah Salik, MD, Hôpital Universitaire Des Enfants Rein Fabiola

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

27 november 2018

Primaire voltooiing (Verwacht)

1 november 2021

Studie voltooiing (Verwacht)

1 november 2021

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

11 maart 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

11 maart 2019

Eerst geplaatst (Werkelijk)

13 maart 2019

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

16 april 2019

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

11 april 2019

Laatst geverifieerd

1 maart 2019

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • P2018/Dermato/Genodermatose

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren