LANDscape MApping van epitopen en T-celreceptoren voor geselecteerde kankers (LANDMARC)

Het klonen van genen die coderen voor de T-celreceptor (TCR), de identificatie van tumor-geassocieerde antigenen en de daaropvolgende karakterisering van het eerste HLA-beperkte T-cel-gedefinieerde antigene epitoop, waren belangrijke bevindingen die de directe herkenning van kankercellen door T-cellen illustreerden. Deze ontdekkingen vormden een mechanistische basis voor het daaropvolgende onderzoek naar de dynamische aard van lymfocytafhankelijke herkenning en eliminatie van neoplastische cellen. Bovendien illustreren preklinische en klinische onderzoeken een belangrijke rol voor door T-cellen gemedieerde antitumorimmuniteit bij ziekten bij de mens, en hebben ze de complexiteit van met kanker geassocieerde immuunresponsen gekenmerkt die niet altijd voldoende zijn voor de eliminatie van tumoren. Belangrijk is echter dat therapeutische gerichtheid op het immuunsysteem de kracht van immunomodulerende geneesmiddelen heeft aangetoond voor het herstel van antitumorale immuunresponsen voor de behandeling van kanker.

De aanwezigheid van lymfocyten in verschillende vormen van kanker bij de mens is goed gedocumenteerd, en T-cellen geïsoleerd uit tumoren die kankerantigenen herkennen, kunnen worden gebruikt voor een effectieve behandeling. T-cellen die zijn geïsoleerd uit tumoren van patiënten kunnen ex vivo worden geëxpandeerd en opnieuw worden ingebracht in patiënten in een regime van cellulaire therapie dat adoptieve celoverdracht (ACT) wordt genoemd. Deze ACT-therapie kan verder worden gericht op specifieke tumorantigenen met de genetische manipulatie van T-cellen om TCR tot expressie te brengen, waarbij bekende p-HLA-epitopen met dominante expressie op kankercellen worden herkend. Het peptide-HLA (p-HLA)-epitooplandschap van tumor-geassocieerde antigenen en hun verwante TCR zijn echter niet goed beschreven, en degenen die zijn beschreven zijn voornamelijk beperkt tot het klasse I HLA-A*02:01 allel alleen dominant in Europees-blanke populaties. Het doel van deze studie is om het kankerepitooplandschap verder te documenteren en een uitgebreide karakterisering te bieden van TCR-specificiteiten in een reeks maligniteiten, voor een grote verscheidenheid aan klasse I en klasse II HLA-allelen. Bovendien willen we niet alleen TCR-repertoires ophelderen die belangrijk zijn voor antitumorimmuniteit, maar ook de rol die antigeenpresenterende cellen spelen bij het vormgeven van deze T-celrepertoires verder verduidelijken.

De doelstellingen omvatten de identificatie van kanker-geassocieerde/specifieke antigeen p-HLA-epitopen en hun verwante TCR, en de daaropvolgende structurele en functionele karakterisering van deze TCR. Om dit doel te bereiken, zullen immuuncellen van T-, B- en myeloïde afstamming geanalyseerd worden. Fenotypische karakterisering van deze celsubsets zal worden uitgevoerd met behulp van standaard immunologische procedures zoals immunofluorescentie, immunohistochemie, ELISA, ELISpot, qRT-PCR, analytische cytometrie, CyTOF (cytometry time of flight) en in vitro stimulatie. Om immuunresponsen te relateren aan de intrinsieke biologie van kankercellen, zullen RNA en DNA worden gesequenced om kankerceltranscriptoom en -mutaties te identificeren, evenals unieke sequenties van T-celreceptoren. De resultaten van alle laboratoriumanalyses zullen worden gecombineerd met relevante klinische gegevens. Elke bevestiging van de diagnose, weefseltypes en andere klinische gegevens zal worden verstrekt zoals beschikbaar bij de pathologen van de relevante ziektelocatie bij UHN.

Een onvolledig begrip van T-celreacties op kanker belemmert de ontwikkeling van effectievere immunotherapeutica. Ontdekkingen met behulp van tumorspecimens van kankerpatiënten zullen duidelijk maken hoe de complexiteit van de tumoromgeving T-celspecificiteit vormt om effectieve immuunresponsen te induceren en onze ontwikkeling van betere immuunmodulerende therapieën te vergemakkelijken.