MAPEO DE LANDscape de epítopos y receptores de células T para cánceres seleccionados (LANDMARC)

La clonación de genes que codifican el receptor de células T (TCR), la identificación de antígenos asociados a tumores y la posterior caracterización del primer epítopo antigénico definido por células T restringido por HLA fueron hallazgos clave que ilustran el reconocimiento directo de las células cancerosas por parte de las células T. Estos descubrimientos proporcionaron una base mecánica para el trabajo subsiguiente que examina la naturaleza dinámica del reconocimiento y la eliminación de células neoplásicas dependientes de linfocitos. Además, las investigaciones preclínicas y clínicas ilustran un papel importante de la inmunidad antitumoral mediada por células T en la enfermedad humana y han caracterizado la complejidad de las respuestas inmunitarias asociadas al cáncer que no siempre son suficientes para la eliminación del tumor. Sin embargo, es importante destacar que la orientación terapéutica del sistema inmunitario ha demostrado el poder de los fármacos inmunomoduladores para restaurar las respuestas inmunitarias antitumorales para el tratamiento del cáncer.

La presencia de linfocitos en una variedad de cánceres humanos está bien documentada, y las células T aisladas de tumores que reconocen antígenos cancerosos pueden aprovecharse para un tratamiento eficaz. Las células T aisladas de los tumores de los pacientes pueden expandirse ex vivo y reinfundirse a los pacientes en un régimen de terapia celular denominado transferencia celular adoptiva (ACT). Esta terapia ACT se puede dirigir adicionalmente a antígenos tumorales específicos con la manipulación genética de células T para expresar TCR que reconoce epítopos de p-HLA conocidos con expresión dominante en células cancerosas. Sin embargo, el panorama del epítopo del péptido-HLA (p-HLA) de los antígenos asociados a tumores y su TCR afín no están bien descritos, y los que se han descrito se limitan principalmente al alelo dominante HLA-A*02:01 de clase I solamente. en poblaciones europeo-caucásicas. El propósito de este estudio es documentar aún más el panorama del epítopo del cáncer y proporcionar una caracterización integral de las especificidades de TCR en una variedad de neoplasias malignas, para una amplia variedad de alelos HLA de clase I y clase II. Además, nuestro objetivo es dilucidar no solo los repertorios de TCR importantes para la inmunidad antitumoral, sino también aclarar el papel que desempeñan las células presentadoras de antígenos en la configuración de estos repertorios de células T.

Los objetivos implican la identificación de epítopos de p-HLA del antígeno específico/asociado al cáncer y su TCR afín, y la subsiguiente caracterización estructural y funcional de estos TCR. Para cumplir con este objetivo, se analizarán células inmunes de linaje T, B y mieloide. La caracterización fenotípica de estos subconjuntos de células se realizará utilizando procedimientos inmunológicos estándar como inmunofluorescencia, inmunohistoquímica, ELISA, ELISpot, qRT-PCR, citometría analítica, CyTOF (citometría de tiempo de vuelo) y estimulación in vitro. Para relacionar las respuestas inmunitarias con la biología intrínseca de las células cancerosas, se secuenciará el ARN y el ADN para identificar el transcriptoma y las mutaciones de las células cancerosas, así como las secuencias únicas del receptor de células T. Los resultados de todos los análisis de laboratorio se combinarán con datos clínicos relevantes. Cualquier confirmación de diagnóstico, tipos de tejido y otros datos clínicos serán proporcionados por los patólogos del sitio de la enfermedad relevante en la UHN.

Una comprensión incompleta de las respuestas de las células T al cáncer impide el desarrollo de inmunoterapéuticos más efectivos. El descubrimiento utilizando especímenes de tumores de pacientes con cáncer aclarará cómo la complejidad del entorno del tumor da forma a la especificidad de las células T para inducir respuestas inmunitarias eficaces y facilitar el desarrollo de mejores terapias de modulación inmunitaria.