Mapeamento paisagístico de epítopos e receptores de células T para cânceres selecionados (LANDMARC)

A clonagem de genes que codificam o receptor de células T (TCR), a identificação de antígenos associados a tumores e a subsequente caracterização do primeiro epítopo antigênico definido por células T restritas a HLA, foram descobertas importantes que ilustram o reconhecimento direto de células cancerígenas por células T. Essas descobertas forneceram uma base mecanicista para o trabalho que se seguiu, examinando a natureza dinâmica do reconhecimento dependente de linfócitos e da eliminação de células neoplásicas. Além disso, investigações pré-clínicas e clínicas ilustram um papel importante para a imunidade antitumoral mediada por células T em doenças humanas e caracterizaram a complexidade das respostas imunes associadas ao câncer que nem sempre são suficientes para a eliminação do tumor. No entanto, é importante ressaltar que o direcionamento terapêutico do sistema imunológico demonstrou o poder das drogas imunomoduladoras para a restauração das respostas imunes antitumorais para o tratamento do câncer.

A presença de linfócitos em uma variedade de cânceres humanos está bem documentada, e as células T isoladas de tumores que reconhecem antígenos de câncer podem ser aproveitadas para um tratamento eficaz. As células T isoladas de tumores de pacientes podem ser expandidas ex vivo e reinfundidas em pacientes em um regime de terapia celular denominado transferência celular adotiva (ACT). Esta terapia ACT pode ainda ser direcionada para antígenos tumorais específicos com a manipulação genética de células T para expressar TCR reconhecendo epítopos p-HLA conhecidos com expressão dominante em células cancerígenas. No entanto, a paisagem de epítopos de peptídeo-HLA (p-HLA) de antígenos associados a tumores e seu TCR cognato não são bem descritos, e aqueles que foram descritos são principalmente limitados apenas ao alelo dominante classe I HLA-A*02:01 em populações europeu-caucasianas. O objetivo deste estudo é documentar ainda mais a paisagem do epítopo do câncer e fornecer uma caracterização abrangente das especificidades do TCR em uma variedade de malignidades, para uma ampla variedade de alelos HLA de classe I e classe II. Além disso, pretendemos elucidar não apenas os repertórios de TCR importantes para a imunidade antitumoral, mas também esclarecer o papel que as células apresentadoras de antígeno desempenham na formação desses repertórios de células T.

Os objetivos envolvem a identificação de epítopos do antígeno p-HLA associados/específicos ao câncer e seus TCRs cognatos, e a subsequente caracterização estrutural e funcional desses TCRs. Para atingir este objetivo, serão analisadas células imunes das linhagens T, B e mielóide. A caracterização fenotípica desses subconjuntos celulares será realizada por meio de procedimentos imunológicos padronizados, como imunofluorescência, imuno-histoquímica, ELISA, ELISpot, qRT-PCR, citometria analítica, CyTOF (cytometry time of flight) e estimulação in vitro. Para relacionar as respostas imunes à biologia intrínseca das células cancerígenas, o RNA e o DNA serão sequenciados para identificar o transcriptoma e as mutações das células cancerígenas, bem como as sequências exclusivas dos receptores das células T. Os resultados de todas as análises laboratoriais serão combinados com dados clínicos relevantes. Qualquer confirmação de diagnóstico, tipos de tecidos e outros dados clínicos serão fornecidos pelos patologistas do local da doença relevante na UHN.

Uma compreensão incompleta das respostas das células T ao câncer impede o desenvolvimento de imunoterapêuticos mais eficazes. A descoberta usando espécimes tumorais de pacientes com câncer esclarecerá como a complexidade do ambiente tumoral molda a especificidade das células T para induzir respostas imunes eficazes e facilitar nosso desenvolvimento de melhores terapias de modulação imunológica.