Landskabskortlægning af epitoper og T-cellereceptorer for udvalgte kræftformer (LANDMARC)

Kloningen af ​​gener, der koder for T-cellereceptoren (TCR), identifikationen af ​​tumorassocierede antigener og den efterfølgende karakterisering af den første HLA-begrænsede T-celle-definerede antigene epitop, var nøglefund, der illustrerer direkte genkendelse af cancerceller af T-celler. Disse opdagelser gav et mekanistisk grundlag for efterfølgende arbejde med at undersøge den dynamiske natur af lymfocytafhængig genkendelse og eliminering af neoplastiske celler. Ydermere illustrerer prækliniske og kliniske undersøgelser en vigtig rolle for T-cellemedieret antitumorimmunitet i human sygdom og har karakteriseret kompleksiteten af ​​cancerassocierede immunresponser, som ikke altid er tilstrækkelige til tumoreliminering. Det er dog vigtigt, at terapeutisk målretning af immunsystemet har vist styrken af ​​immunmodulerende lægemidler til genoprettelse af antitumorimmunresponser til cancerbehandling.

Tilstedeværelsen af ​​lymfocytter i en række humane kræftformer er veldokumenteret, og T-celler isoleret fra tumorer, der genkender cancerantigener, kan udnyttes til effektiv behandling. T-celler, der er isoleret fra patienttumorer, kan ekspanderes ex vivo og reinfunderes tilbage i patienter i et cellulært terapiregime kaldet adoptiv celleoverførsel (ACT). Denne ACT-terapi kan yderligere rettes mod specifikke tumorantigener med genetisk manipulation af T-celler til at udtrykke TCR, der genkender kendte p-HLA-epitoper med dominerende ekspression på cancerceller. Imidlertid er peptid-HLA (p-HLA)-epitoplandskabet af tumorassocierede antigener og deres beslægtede TCR ikke godt beskrevet, og de, der er blevet beskrevet, er primært begrænset til den klasse I HLA-A*02:01-alleldominerende kun i europæisk-kaukasiske befolkninger. Formålet med denne undersøgelse er yderligere at dokumentere cancerepitoplandskabet og give en omfattende karakterisering af TCR-specificiteter i en række maligniteter for en lang række klasse I og klasse II HLA-alleller. Derudover sigter vi mod at belyse ikke kun TCR-repertoirer, der er vigtige for antitumor-immunitet, men yderligere at afklare den rolle, antigenpræsenterende celler spiller i udformningen af ​​disse T-celle-repertoirer.

Målene involverer identifikation af cancer-associerede/specifikke antigen p-HLA epitoper og deres beslægtede TCR, og den efterfølgende strukturelle og funktionelle karakterisering af disse TCR. For at opfylde dette mål vil immunceller af T, B og myeloid afstamning blive analyseret. Fænotypisk karakterisering af disse celleundersæt vil blive udført ved hjælp af standard immunologiske procedurer såsom immunfluorescens, immunhistokemi, ELISA, ELISpot, qRT-PCR, analytisk cytometri, CyTOF (cytometri time of flight) og in vitro stimulering. For at relatere immunresponser til kræftcellernes indre biologi, vil RNA og DNA blive sekventeret for at identificere cancercelle-transkriptomer og -mutationer, såvel som T-celle-receptor unikke sekvenser. Resultater fra alle laboratorieanalyser vil blive kombineret med relevante kliniske data. Enhver bekræftelse af diagnose, vævstyper og andre kliniske data vil blive givet fra patologerne på det relevante sygdomssted på UHN.

En ufuldstændig forståelse af T-celleresponser på cancer hæmmer udviklingen af ​​mere effektive immunterapier. Opdagelse ved hjælp af tumorprøver fra cancerpatienter vil afklare, hvordan kompleksiteten af ​​tumormiljøet former T-cellespecificitet for at inducere effektive immunresponser og lette vores udvikling af bedre immunmodulerende terapier.