Karakterisering van het intratumorale microbioom bij adenocarcinoom van de maag: naar een gepersonaliseerde geneeskunde (MICROGAS)

Maagcarcinoom is voornamelijk gekoppeld aan Helicobacter pylori-infectie en deze bacterie is door de WHO geclassificeerd als een kankerverwekkende stof van klasse 1. Infectie met deze bacterie alleen is echter niet voldoende voor het ontstaan ​​van adenocarcinoom van de maag. Het wordt nu erkend dat omgevingsfactoren zoals de spijsverteringsmicrobiota carcinogenese beïnvloeden. Verbeterde sequentietechnieken hebben aangetoond dat sommige tumoren intracellulaire bacteriën bevatten en dat deze specifiek zijn voor de oorsprong van de tumor. Een studie die het bestaan ​​van intratumorale bacteriën beschrijft, werd uitgevoerd op 7 verschillende tumortypes, uitgezonderd maagkanker. Adenocarcinoom van de maag is een vorm van kanker met een slechte prognose, de behandeling, voornamelijk gebaseerd op chirurgie in combinatie met conventionele chemotherapie, is niet erg effectief met een 5-jaarsoverleving van minder dan 20%. Behalve voor Her2+ gevallen is er geen specifieke behandeling. Daarom is het nu essentieel om gerichte en effectieve behandelingen te ontwikkelen.

Het doel van dit project is om te bepalen of intratumorale bacteriën voorkomen in maagkanker.

Om dit te bereiken zullen tumoren en aangrenzend gezond slijmvlies van patiënten met maagkanker worden verzameld en geanalyseerd in INSERM U1312 laboratorium. Het bestudeerde biologische materiaal bestaat alleen uit restanten van biopsieën van maagtumoren en aangrenzende gezonde weefsels, die niet nodig zijn in het pathologielaboratorium, van patiënten die gastrectomie ondergaan als onderdeel van hun kankerbehandeling Twee bloedbuisjes voor de isolatie van mogelijk circulerende tumorcellen zullen ook worden verzameld. Van deze materialen zal de aanwezigheid van intratumorale bacteriën worden bepaald door middel van immunohistochemie gericht op componenten van de bacteriewand, door RNAscope® gericht op 16S ribosomaal RNA (16S rRNA) en door middel van real-time kwantitatieve PCR gericht op 16S rDNA. Karakterisering van de intratumorale microbiota zal worden uitgevoerd door sequentiebepaling van het 16S rDNA-gen. Het verzamelde bloed zal worden getest op de aanwezigheid van CSC's en, als CSC's worden gedetecteerd, zal de microbiota worden getest en gekarakteriseerd met behulp van dezelfde technieken als hierboven beschreven.

Het primaire eindpunt zal het bewijs zijn van een intratumorale microbiota en de taxonomische beschrijving ervan.