Karakterisering af det intratumorale mikrobiom i gastrisk adenokarcinom: til en personlig medicin (MICROGAS)

Gastrisk adenocarcinom er hovedsageligt forbundet med Helicobacter pylori-infektion, og denne bakterie er klassificeret som et klasse 1 carcinogen af ​​WHO. Imidlertid er infektion med denne bakterie alene ikke tilstrækkelig til udvikling af gastrisk adenocarcinom. Det er nu anerkendt, at miljøfaktorer såsom fordøjelsesmikrobiotaen påvirker kræftfremkaldende tilstand. Forbedrede sekventeringsteknikker har vist, at nogle tumorer indeholder intracellulære bakterier, og at disse er specifikke for tumorens oprindelse. En undersøgelse, der beskrev eksistensen af ​​intratumorale bakterier, blev udført på 7 forskellige tumortyper ekskl. mavekræft. Gastrisk adenocarcinom er en kræftsygdom med dårlig prognose, behandling, der hovedsageligt er baseret på kirurgi kombineret med konventionel kemoterapi, er ikke særlig effektiv med en 5-års overlevelsesrate på mindre end 20%. Bortset fra Her2+ tilfælde er der ingen specifik behandling. Det er derfor nu vigtigt at udvikle målrettede og effektive behandlinger.

Formålet med dette projekt er at definere, om der findes intratumorale bakterier i mavekræft.

For at opnå dette vil tumorer og tilstødende sund slimhinde fra patienter med mavekræft blive indsamlet og analyseret i INSERM U1312 laboratoriet. Det biologiske materiale, der undersøges, består kun af rester af biopsier af gastriske tumorer og tilstødende sunde væv, som ikke er nødvendige i patologilaboratoriet, fra patienter, der gennemgår gastrectomy som led i deres kræftbehandling. To blodrør til isolering af mulige cirkulerende tumorceller vil også indsamles. Fra disse materialer vil tilstedeværelsen af ​​intratumorale bakterier blive bestemt ved immunhistokemi målrettet komponenter af bakterievæggen, ved RNAscope® målrettet 16S ribosomalt RNA (16S rRNA) og ved real-time kvantitativ PCR målrettet mod 16S rDNA. Karakterisering af den intratumorale mikrobiota vil blive udført ved at sekventere 16S rDNA-genet. Det opsamlede blod vil blive testet for tilstedeværelsen af ​​CSC'er, og hvis CSC'er påvises, vil mikrobiotaen blive testet og karakteriseret ved hjælp af de samme teknikker beskrevet ovenfor.

Det primære endepunkt vil være beviset på en intratumoral mikrobiota og dens taksonomiske beskrivelse.