Caratterizzazione del microbioma intratumorale nell'adenocarcinoma gastrico: verso una medicina personalizzata (MICROGAS)

L'adenocarcinoma gastrico è principalmente legato all'infezione da Helicobacter pylori e questo batterio è classificato come cancerogeno di classe 1 dall'OMS. Tuttavia, l'infezione da questo batterio da sola non è sufficiente per lo sviluppo dell'adenocarcinoma gastrico. È ormai riconosciuto che fattori ambientali come il microbiota digestivo influenzano la carcinogenesi. Tecniche di sequenziamento migliorate hanno dimostrato che alcuni tumori contengono batteri intracellulari e che questi sono specifici dell'origine del tumore. È stato condotto uno studio che descrive l'esistenza di batteri intratumorali su 7 diversi tipi di tumore escluso il cancro gastrico. L'adenocarcinoma gastrico è un tumore a prognosi sfavorevole, il trattamento, basato principalmente sulla chirurgia combinata con la chemioterapia convenzionale, è poco efficace con un tasso di sopravvivenza a 5 anni inferiore al 20%. Fatta eccezione per i casi Her2+, non esiste un trattamento specifico. È quindi ora essenziale sviluppare trattamenti mirati ed efficaci.

L'obiettivo di questo progetto è definire se esistono batteri intratumorali nel cancro gastrico.

Per raggiungere questo obiettivo, i tumori e la mucosa sana adiacente da pazienti con cancro gastrico saranno raccolti e analizzati nel laboratorio INSERM U1312. Il materiale biologico studiato è costituito solo da resti di biopsie di tumori gastrici e tessuti sani adiacenti, che non sono necessari nel laboratorio di patologia, da pazienti sottoposti a gastrectomia come parte della loro gestione del cancro Due provette per il sangue per l'isolamento di possibili cellule tumorali circolanti anche essere raccolti. Da questi materiali, la presenza di batteri intratumorali sarà determinata mediante immunoistochimica mirata ai componenti della parete batterica, mediante RNAscope® mirata all'RNA ribosomiale 16S (16S rRNA) e mediante PCR quantitativa in tempo reale mirata al 16S rDNA. La caratterizzazione del microbiota intratumorale sarà eseguita mediante sequenziamento del gene 16S rDNA. Il sangue raccolto sarà testato per la presenza di CSC e, se vengono rilevate CSC, il microbiota sarà testato e caratterizzato utilizzando le stesse tecniche sopra descritte.

L'endpoint primario sarà l'evidenza di un microbiota intratumorale e la sua descrizione tassonomica.