Charakterisierung des intratumoralen Mikrobioms beim Adenokarzinom des Magens: zu einer personalisierten Medizin (MICROGAS)

Das Adenokarzinom des Magens wird hauptsächlich mit einer Infektion mit Helicobacter pylori in Verbindung gebracht, und dieses Bakterium wird von der WHO als Karzinogen der Klasse 1 eingestuft. Eine Infektion mit diesem Bakterium allein reicht jedoch nicht aus, um ein Adenokarzinom des Magens zu entwickeln. Es ist heute anerkannt, dass Umweltfaktoren wie die Verdauungsmikrobiota die Karzinogenese beeinflussen. Verbesserte Sequenzierungstechniken haben gezeigt, dass einige Tumore intrazelluläre Bakterien enthalten und dass diese spezifisch für den Ursprung des Tumors sind. Eine Studie zur Beschreibung der Existenz von intratumoralen Bakterien wurde an 7 verschiedenen Tumorarten mit Ausnahme von Magenkrebs durchgeführt. Das Adenokarzinom des Magens ist eine Krebserkrankung mit schlechter Prognose. Die Behandlung, die hauptsächlich auf einer Operation in Kombination mit konventioneller Chemotherapie basiert, ist mit einer 5-Jahres-Überlebensrate von weniger als 20 % nicht sehr effektiv. Außer bei Her2+-Fällen gibt es keine spezifische Behandlung. Daher ist es jetzt unerlässlich, gezielte und wirksame Behandlungen zu entwickeln.

Das Ziel dieses Projekts ist es zu definieren, ob intratumorale Bakterien bei Magenkrebs existieren.

Um dies zu erreichen, werden Tumore und angrenzende gesunde Schleimhäute von Patienten mit Magenkrebs gesammelt und im Labor INSERM U1312 analysiert. Das biologische Untersuchungsmaterial besteht nur aus Resten von Biopsien von Magentumoren und angrenzendem gesundem Gewebe, die im Pathologielabor nicht benötigt werden, von Patienten, die sich im Rahmen ihrer Krebsbehandlung einer Gastrektomie unterziehen. Zwei Blutröhrchen zur Isolierung möglicher zirkulierender Tumorzellen auch gesammelt werden. Aus diesen Materialien wird das Vorhandensein von intratumoralen Bakterien durch Immunhistochemie bestimmt, die auf Komponenten der Bakterienwand abzielt, durch RNAscope®, das auf 16S-ribosomale RNA (16S-rRNA) abzielt, und durch quantitative Echtzeit-PCR, die auf 16S-rDNA abzielt. Die Charakterisierung der intratumoralen Mikrobiota erfolgt durch Sequenzierung des 16S-rDNA-Gens. Das gesammelte Blut wird auf das Vorhandensein von CSCs getestet, und wenn CSCs nachgewiesen werden, wird die Mikrobiota unter Verwendung der gleichen oben beschriebenen Techniken getestet und charakterisiert.

Der primäre Endpunkt wird der Nachweis einer intratumoralen Mikrobiota und deren taxonomische Beschreibung sein.