Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Helgenomtrio-sekvensering som en standard rutinetest hos pasienter med sjeldne sykdommer - "GENOME FIRST APPROACH"

17. oktober 2022 oppdatert av: University Hospital Tuebingen
GENOME FIRST APPROACH-prosjektet vil inkludere pasienter (n = 450) og deres friske foreldre med uklar molekylær årsak til sykdommen, mistenkt genetisk årsak til sykdommen og de friske foreldrene til de berørte for trioanalyse (N totalt 1350).

Studieoversikt

Status

Status

Indikerer gjeldende rekrutteringsstatus eller utvidet tilgangsstatus.
Fullført

Forhold

Forhold

Sykdommen, lidelsen, syndromet, sykdommen eller skaden som studeres. På ClinicalTrials.gov kan tilstander også inkludere andre helserelaterte problemer, som levetid, livskvalitet og helserisiko.

Intervensjon / Behandling

Intervensjon / Behandling

En prosess eller handling som er fokus for en klinisk studie. Intervensjoner inkluderer legemidler, medisinsk utstyr, prosedyrer, vaksiner og andre produkter som enten er undersøkende eller allerede er tilgjengelige. Intervensjoner kan også inkludere ikke-invasive tilnærminger, som utdanning eller modifisering av kosthold og trening.

Detaljert beskrivelse

I prosjektet GENOME FIRST APPROACH (monosentrisk, prospektiv, åpen-label diagnostisk) vil pasienter med molekylært udiagnostiserte sykdommer diagnostisk analyseres ved Whole Genome Sequencing (WGS)-trio-analyse. Følgende spørsmål vil lede prosjektet:

Hoved:

• Effektivitet av WGS trioanalyse i ulike kliniske indikasjoner

Sekundær:

  • Systematisk benchmark WGS-analyse for å oppdage genetiske variasjoner sammenlignet med WES og single nucleotide polymorphism (SNP) array-analyse,
  • Utvid analysen fra kodende enkeltnukleotidvarianter (SNV-er) til regulatoriske mutasjoner, strukturelle varianter (SV-er) og regioner med lav kompleksitet,
  • Validere effekten av klinisk genomtrio-sekvensering i en rutinemessig diagnostisk setting,
  • Analyser om 42x dekning har potensial til å oppdage mosaikk som sykdomsfremkallende mekanisme,
  • Videreutvikle algoritmer for integrerende analyser av Trio-WGS-data med ribonukleinsyresekvensering (RNA-seq),
  • Identifisere de novo endringer og nye sykdomsmekanismer,
  • Få grunnleggende ny innsikt i sykdomsmekanismer og cellulær biologi,
  • Kombiner WGS med ytterligere Omics-metoder for å forbedre genetisk diagnostikk av fremtidige pasienter med sjeldne sykdommer, og
  • Utforsk samlede økonomiske kostnader og tid for å rapportere avgjørende data til pasientene med Trio-WGS-tilnærmingen sammenlignet med tradisjonelle flertrinns diagnostiske tilnærminger ved bruk av enkelt-gen, panel, heleksomsekvensering (WES) og kromosomal mikroarray (CMA) (SNP-array, array) -basert komparativ genomisk hybridisering (arrayCGH)) analyse.

I tillegg vil friske foreldre til forsøkspersonene inkluderes i prosjektet for å utføre foreldre-barn (trio) analyser.

Studietype

Studietype

Beskriver arten av en klinisk studie. Studietyper inkluderer intervensjonsstudier (også kalt kliniske studier), observasjonsstudier (inkludert pasientregistre) og utvidet tilgang.
Intervensjonell

Registrering (Faktiske)

Registrering

Antall deltakere i en klinisk studie. Den "forventede" påmeldingen er måltallet for deltakere som forskerne trenger for studien.
1350

Fase

Fase

Stadiet av en klinisk studie som studerer et medikament eller biologisk produkt, basert på definisjoner utviklet av U.S. Food and Drug Administration (FDA). Fasen er basert på studiens målsetting, antall deltakere og andre egenskaper. Det er fem faser: Tidlig fase 1 (tidligere oppført som fase 0), fase 1, fase 2, fase 3 og fase 4. Ikke relevant brukes til å beskrive studier uten FDA-definerte faser, inkludert utprøving av enheter eller atferdsintervensjoner.
  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Tyskland
      • Tübingen, Tyskland, 72076
        • University Hospital Tübingen

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Kvalifikasjonskriterier

Nøkkelkravene som personer som ønsker å delta i en klinisk studie må oppfylle eller egenskapene de må ha. Kvalifikasjonskriterier består av både inklusjonskriterier (som kreves for at en person skal delta i studien) og eksklusjonskriterier (som hindrer en person i å delta). Typer kvalifikasjonskriterier inkluderer om en studie godtar friske frivillige, har alders- eller aldersgruppekrav, eller er begrenset av kjønn.

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Uklar molekylær årsak til sykdommen
  • Mistanke om genetisk årsak til sykdommen
  • Friske foreldre til de berørte for trioanalyse Kohort 1: IQ < 70 med og uten misdannelser, syndromisk og ikke-syndromisk Kohort 2: Retinitis pigmentosa, achromatopsy, Bardet-Biedl syndrom, Usher syndrom, medfødt stasjonær nattblindhet, LCA, macula degenerasjon, stav-/kjegledystrofier, opticusatrofi Kohort 3: Sjeldne pediatriske solide kreftformer som melanom, karsinom i mage-tarmkanalen, svulster i spyttkjertelen og bukspyttkjertelsvulster hos barn.

Ekskluderingskriterier:

Kohort 1: Giftige årsaker (legemidler, infeksjoner) Kohort 2: pasienter med ikke-genetiske former for blindhet Kohort 3: kreft hos voksne, blodkreft

  • Mangler informert samtykke fra pasient/verge
  • Mangler prøver av begge foreldrene
  • Tidligere WES eller panelanalyse-

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Grunnvitenskap
  • Tildeling: Ikke-randomisert
  • Intervensjonsmodell: Parallell tildeling
  • Masking: Ingen (Open Label)

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm

Deltakergruppe / Arm

En gruppe eller undergruppe av deltakere i en klinisk studie som mottar en spesifikk intervensjon/behandling, eller ingen intervensjon, i henhold til studiens protokoll.
Intervensjon / Behandling

Intervensjon / Behandling

En prosess eller handling som er fokus for en klinisk studie. Intervensjoner inkluderer legemidler, medisinsk utstyr, prosedyrer, vaksiner og andre produkter som enten er undersøkende eller allerede er tilgjengelige. Intervensjoner kan også inkludere ikke-invasive tilnærminger, som utdanning eller modifisering av kosthold og trening.
Annen: Kohort 1: Utviklingshemming
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.
Annen: Kohort 2 Netthinnesykdommer
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.
Annen: Kohort 3: Sjeldne svulster i barndommen
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Primære resultatmål

I en klinisk studies protokoll er det planlagte utfallsmålet som er det viktigste for å evaluere effekten av en intervensjon/behandling. De fleste kliniske studier har ett primært utfallsmål, men noen har mer enn ett.
Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Full genomisk sekvensanalyse utført av Whole Genome Sequencing (WGS)
Tidsramme: Dag 1
Antall genomiske varianter i sykdoms- og helseforeldre av WGS (a Next-Generation Sequencing Technology, NGS)
Dag 1

Sekundære resultatmål

Sekundære resultatmål

I en klinisk studies protokoll, et planlagt utfallsmål som ikke er like viktig som det primære utfallsmålet for å evaluere effekten av en intervensjon, men som fortsatt er av interesse. De fleste kliniske studier har mer enn ett sekundært utfallsmål.
Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Genomsekvensering
Tidsramme: Dag 1
Verifikasjon av genetiske årsaker til uklare genetiske sykdommer ved klinisk genomsekvensering
Dag 1
De novo endringer
Tidsramme: Dag 1
Antall de novo endringer i genomet til den registrerte befolkningen
Dag 1

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Sponsor

Organisasjonen eller personen som initierer studien og som har myndighet og kontroll over studien.
University Hospital Tuebingen

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

Studiestart

Den faktiske datoen da den første deltakeren ble registrert i en klinisk studie. Den "forventede" studiestartdatoen er datoen som forskerne tror vil være studiestartdatoen.
1. oktober 2019

Primær fullføring (Faktiske)

Primær fullføring

Datoen da den siste deltakeren i en klinisk studie ble undersøkt eller mottok en intervensjon for å samle inn endelige data for det primære utfallsmålet. Hvorvidt den kliniske studien ble avsluttet i henhold til protokollen eller ble avsluttet, påvirker ikke denne datoen. For kliniske studier med mer enn ett primært utfallsmål med ulike fullføringsdatoer, refererer dette begrepet til datoen da datainnsamlingen er fullført for alle de primære utfallsmålene. Den "forventede" primære fullføringsdatoen er datoen som forskerne tror vil være den primære fullføringsdatoen for studien.
1. oktober 2022

Studiet fullført (Faktiske)

Studiet fullført

Datoen da den siste deltakeren i en klinisk studie ble undersøkt eller mottok en intervensjon/behandling for å samle inn endelige data for de primære utfallsmålene, sekundære utfallsmålene og uønskede hendelsene (det vil si siste deltakers siste besøk). Den "forventede" studiens fullføringsdato er datoen som forskerne tror vil være studiens fullføringsdato.
1. oktober 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

Først innsendt

Datoen da studiesponsoren eller etterforskeren først sendte inn en studiepost til ClinicalTrials.gov. Det er vanligvis en forsinkelse på noen dager mellom første innsendte dato og postens tilgjengelighet på ClinicalTrials.gov (den første postedatoen).
9. mai 2019

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

Datoen da studiesponsoren eller etterforskeren først sender inn en studiepost som er i samsvar med gjennomgangskriteriene for National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC). Sponsoren eller etterforskeren må kanskje revidere og sende inn en studiepost én eller flere ganger før NLMs kvalitetskontrollkriterier oppfylles. Det er sponsorens eller etterforskerens ansvar å sikre at studieposten er i samsvar med NLM QC-gjennomgangskriteriene.
16. mai 2019

Først lagt ut (Faktiske)

Først lagt ut

Datoen da studieposten først var tilgjengelig på ClinicalTrials.gov etter at National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC) gjennomgang har konkludert. Det er vanligvis en forsinkelse på noen dager mellom datoen studiesponsoren eller etterforskeren sendte inn studieposten og den første postedatoen.
17. mai 2019

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

Sist oppdatering lagt ut

Den siste datoen da endringer i en studiepost ble gjort tilgjengelig på ClinicalTrials.gov. Det kan være en forsinkelse mellom når endringene ble sendt til ClinicalTrials.gov av studiens sponsor eller etterforsker (datoen for siste innsending av oppdatering) og datoen for siste oppdatering.
18. oktober 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

Den siste datoen da studiesponsoren eller etterforskeren sendte inn endringer i en studiepost som er i samsvar med gjennomgangskriteriene for National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC). Det er sponsorens eller etterforskerens ansvar å sikre at studieposten er i samsvar med NLM QC-gjennomgangskriteriene.
17. oktober 2022

Sist bekreftet

Sist bekreftet

Den siste datoen da studiesponsoren eller etterforskeren bekreftet at informasjonen om en klinisk studie på ClinicalTrials.gov var nøyaktig og oppdatert. Hvis en studie med rekrutteringsstatus for rekruttering; ikke rekrutterer ennå; eller aktiv, ikke rekruttering har ikke blitt bekreftet de siste 2 årene, studiens rekrutteringsstatus vises som ukjent.
1. oktober 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

Andre studie-ID-numre

Identifikatorer eller ID-numre andre enn NCT-nummeret som er tildelt en klinisk studie av studiens sponsor, finansierere eller andre. Disse tallene kan inkludere unike identifikatorer fra andre prøveregistre og National Institutes of Health-stipendnumre.
  • WG-Trio01

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Innstillinger for informasjonskapsler

Vi bruker informasjonskapsler for å sikre at vi gir deg den beste opplevelsen på nettstedet vårt. For mer informasjon, les nøye vår Retningslinjer for personvern og informasjonskapsler. ...>>>Du kan når som helst endre preferansene dine eller trekke tilbake samtykket ditt ved å slette informasjonskapslene fra nettstedet ditt eller datamaskinen som beskrevet i policyen. Godta det og velg dine preferanser ved å krysse av i de tilhørende rutene i delen "Administrer innstillinger" nedenfor. Les nøye gjennom servicevilkårene før du fortsetter å bruke noen del av dette nettstedet.
«Administrer innstillinger