Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Helgenomtrio-sekvensering som en standard rutinetest hos pasienter med sjeldne sykdommer - "GENOME FIRST APPROACH"

17. oktober 2022 oppdatert av: University Hospital Tuebingen
GENOME FIRST APPROACH-prosjektet vil inkludere pasienter (n = 450) og deres friske foreldre med uklar molekylær årsak til sykdommen, mistenkt genetisk årsak til sykdommen og de friske foreldrene til de berørte for trioanalyse (N totalt 1350).

Studieoversikt

Status

Fullført

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

I prosjektet GENOME FIRST APPROACH (monosentrisk, prospektiv, åpen-label diagnostisk) vil pasienter med molekylært udiagnostiserte sykdommer diagnostisk analyseres ved Whole Genome Sequencing (WGS)-trio-analyse. Følgende spørsmål vil lede prosjektet:

Hoved:

• Effektivitet av WGS trioanalyse i ulike kliniske indikasjoner

Sekundær:

  • Systematisk benchmark WGS-analyse for å oppdage genetiske variasjoner sammenlignet med WES og single nucleotide polymorphism (SNP) array-analyse,
  • Utvid analysen fra kodende enkeltnukleotidvarianter (SNV-er) til regulatoriske mutasjoner, strukturelle varianter (SV-er) og regioner med lav kompleksitet,
  • Validere effekten av klinisk genomtrio-sekvensering i en rutinemessig diagnostisk setting,
  • Analyser om 42x dekning har potensial til å oppdage mosaikk som sykdomsfremkallende mekanisme,
  • Videreutvikle algoritmer for integrerende analyser av Trio-WGS-data med ribonukleinsyresekvensering (RNA-seq),
  • Identifisere de novo endringer og nye sykdomsmekanismer,
  • Få grunnleggende ny innsikt i sykdomsmekanismer og cellulær biologi,
  • Kombiner WGS med ytterligere Omics-metoder for å forbedre genetisk diagnostikk av fremtidige pasienter med sjeldne sykdommer, og
  • Utforsk samlede økonomiske kostnader og tid for å rapportere avgjørende data til pasientene med Trio-WGS-tilnærmingen sammenlignet med tradisjonelle flertrinns diagnostiske tilnærminger ved bruk av enkelt-gen, panel, heleksomsekvensering (WES) og kromosomal mikroarray (CMA) (SNP-array, array) -basert komparativ genomisk hybridisering (arrayCGH)) analyse.

I tillegg vil friske foreldre til forsøkspersonene inkluderes i prosjektet for å utføre foreldre-barn (trio) analyser.

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Faktiske)

1350

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Tyskland
      • Tübingen, Tyskland, 72076
        • University Hospital Tübingen

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Uklar molekylær årsak til sykdommen
  • Mistanke om genetisk årsak til sykdommen
  • Friske foreldre til de berørte for trioanalyse Kohort 1: IQ < 70 med og uten misdannelser, syndromisk og ikke-syndromisk Kohort 2: Retinitis pigmentosa, achromatopsy, Bardet-Biedl syndrom, Usher syndrom, medfødt stasjonær nattblindhet, LCA, macula degenerasjon, stav-/kjegledystrofier, opticusatrofi Kohort 3: Sjeldne pediatriske solide kreftformer som melanom, karsinom i mage-tarmkanalen, svulster i spyttkjertelen og bukspyttkjertelsvulster hos barn.

Ekskluderingskriterier:

Kohort 1: Giftige årsaker (legemidler, infeksjoner) Kohort 2: pasienter med ikke-genetiske former for blindhet Kohort 3: kreft hos voksne, blodkreft

  • Mangler informert samtykke fra pasient/verge
  • Mangler prøver av begge foreldrene
  • Tidligere WES eller panelanalyse-

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Grunnvitenskap
  • Tildeling: Ikke-randomisert
  • Intervensjonsmodell: Parallell tildeling
  • Masking: Ingen (Open Label)

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm
Intervensjon / Behandling
Annen: Kohort 1: Utviklingshemming
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.
Annen: Kohort 2 Netthinnesykdommer
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.
Annen: Kohort 3: Sjeldne svulster i barndommen
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtaking for genetisk diagnostikk.
Genetisk: WGS-Diagnostisk
Blodprøvetaking, skudd klinisk karakterisering, WGS-basert trio-sekvensering, NGS-analyse og annen omics-analyse (transkriptomikk, proteomikk, metabolomikk), funksjonelle cellebiologiske studier (for eksempel i fibroblastkulturer), RNA-sekv.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Full genomisk sekvensanalyse utført av Whole Genome Sequencing (WGS)
Tidsramme: Dag 1
Antall genomiske varianter i sykdoms- og helseforeldre av WGS (a Next-Generation Sequencing Technology, NGS)
Dag 1

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Genomsekvensering
Tidsramme: Dag 1
Verifikasjon av genetiske årsaker til uklare genetiske sykdommer ved klinisk genomsekvensering
Dag 1
De novo endringer
Tidsramme: Dag 1
Antall de novo endringer i genomet til den registrerte befolkningen
Dag 1

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

University Hospital Tuebingen

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

1. oktober 2019

Primær fullføring (Faktiske)

1. oktober 2022

Studiet fullført (Faktiske)

1. oktober 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

9. mai 2019

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

16. mai 2019

Først lagt ut (Faktiske)

17. mai 2019

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

18. oktober 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

17. oktober 2022

Sist bekreftet

1. oktober 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • WG-Trio01

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Sjeldne sykdommer

Kliniske studier på WGS-Diagnostisk

Søk i lignende forsøk

Sponsorer og samarbeidspartnere

Medisinsk tilstand

Legemiddelintervensjoner

CROs by country

CROs in Ghana

Forhold

Sjeldne sykdommer

Legemiddelintervensjoner

Kosttilskudd

Sponsor / samarbeidspartnere

Steder

Abonnere