Molekylær epidemiologi av rotavirusdiaré blant spedbarn og små barn som går på Maua Methodist Hospital, Kenya (Rotavirus)

Rotavirus er den vanligste årsaken til alvorlig infantil diarésykdom hos spedbarn og små barn under fem år over hele verden. Det er assosiert med høye tilfeller av sykelighet og dødelighet, og det er anslått at opptil 600 000 dødsfall blant små barn forekommer årlig i de mindre utviklede landene og omtrent 150 000-200 000 dødsfall forekommer i Afrika alene. I Kenya har det meste av rotavirusovervåkingsarbeidet blitt utført i Nairobi (en urban setting). Andre deler, for eksempel østlige Kenya, er begrensede data tilgjengelig, og derfor er forekomsten og byrden av rotavirussykdom undervurdert. Vi antar derfor at utbredelsen av rotavirus er høy i Meru, Maua (en landlig setting), og derfor utformet vi en studie for å evaluere dette.

Dette er en prospektiv studie for å fastslå, rotavirussykdomsbyrden og epidemiologien hos spedbarn og barn med alvorlig diaré innlagt på tre sentinel sykehus i den østlige delen av Kenya (Maua Methodist sykehus) vil bli utført i perioden januar 2009 til desember 2010.

Avføringsprøver vil bli samlet inn fra spedbarn og barn innlagt med akutt diaré og screenet først for tilstedeværelse av humant serotype A rotavirusantigen ved bruk av kommersielt tilgjengelig enzymkoblet immunosorbentanalysesett (ELISA).

De positive prøvene vil bli evaluert ved natriumdodecylpolyakrylamidgelelektroforese (SDS-PAGE) for å bestemme elektroferotypene og genotypes ved bruk av revers transkriptasepolymerasekjedereaksjon (RT-PCR) på VP7- og VP4-genene.

Disse dataene/resultatene generert fra dette prosjektet vil legge til viktig informasjon om rotavirusstammene som sirkulerer i den østlige delen av Kenya.