Biomarkørstudie av kjemoterapiresistens og resultater i prøver fra eldre pasienter med akutt myeloid leukemi

MÅL:

• Avgrens spekteret av genetiske og epigenetiske lesjoner som forekommer hos eldre pasienter med akutt myeloid leukemi (AML).
• Bestem de biologiske funksjonene som forstyrres av disse lesjonene.
• Identifiser og valider lesjoner eller veier som er mest assosiert med kjemosensitiv og kjemo-refraktær sykdom, og med uønsket utfall hos eldre AML.
• Identifiser potensielle klassifikatorer og biomarkørlesjoner som vi deretter kan evaluere prospektivt i E2906-studien som er i ferd med å begynne påmelding.

OVERSIGT: DNA og RNA ekstrahert fra celleprøver analyseres for genetisk og epigenetisk uttrykk ved hjelp av Agilent SureSelect-sekvensering, Illumina HiSeq2000-plattformkoding og -sekvensering, DNA-metylering og mikroarray-analyser. Resultatene er deretter assosiert med pasientenes totale overlevelse, progresjonsfrie overlevelse og fullstendige responsrate. Resultatene er også analysert for å vurdere den prognostiske relevansen av kjente mutasjoner og epigenetiske endringer som har vist seg å ha en innvirkning på total overlevelse og respons på terapi hos yngre pasienter med akutt myeloid leukemi (AML) i E1900 inkludert, men ikke begrenset til, FLT3, DNMT3A , IDH1, IDH2, TET2, ASXL1, WT1 og MLL, og 15-gen DNA-metyleringsklassifisering, og med nye tilbakevendende mutasjoner identifisert av andre AML-profileringsarbeid.