Badanie biomarkerów oporności na chemioterapię i wyników w próbkach od starszych pacjentów z ostrą białaczką szpikową

CELE:

• Nakreśl spektrum zmian genetycznych i epigenetycznych występujących u pacjentów w podeszłym wieku z ostrą białaczką szpikową (AML).
• Określ funkcje biologiczne zaburzone przez te uszkodzenia.
• Zidentyfikuj i zweryfikuj zmiany lub szlaki, które są najbardziej związane z chorobą chemiowrażliwą i chemiooporną oraz z niepożądanymi wynikami w AML w podeszłym wieku.
• Zidentyfikuj potencjalne klasyfikatory i zmiany biomarkerów, które możemy następnie ocenić prospektywnie w badaniu E2906, które ma się rozpocząć.

ZARYS: DNA i RNA ekstrahowane z próbek komórek są analizowane pod kątem ekspresji genetycznej i epigenetycznej za pomocą sekwencjonowania Agilent SureSelect, kodowania i sekwencjonowania platformy Illumina HiSeq2000, metylacji DNA i testów mikromacierzy. Wyniki są następnie powiązane z całkowitym przeżyciem pacjentów, przeżyciem wolnym od progresji i odsetkiem całkowitych odpowiedzi. Wyniki są również analizowane, oceniając znaczenie prognostyczne znanych mutacji i zmian epigenetycznych, które, jak wykazano, mają wpływ na całkowite przeżycie i odpowiedź na leczenie u młodszych pacjentów z ostrą białaczką szpikową (AML) w E1900, w tym między innymi FLT3, DNMT3A , IDH1, IDH2, TET2, ASXL1, WT1 i MLL oraz 15-genowy klasyfikator metylacji DNA, a także z nowymi powtarzającymi się mutacjami zidentyfikowanymi przez inne wysiłki profilowania AML.