Bruddpunktanalyse av de Novo tilsynelatende balanserte kromosomale translokasjoner

Psykomotorisk forsinkelse observeres hos omtrent 3 % av den generelle befolkningen og har ulike årsaker: miljømessige, genetiske (gen eller kromosom) eller ukjente. Kromosomavvik har blitt identifisert i 15 % av syndromisk psykomotorisk forsinkelse (dvs. assosiert med et annet symptom). Balanserte kromosomale translokasjoner er observert hos én av 1000 individer, og bare 6 % av pasientene med de novo tilsynelatende balanserte translokasjoner har en unormal fenotype (Warburton, 1991). Gjennomgang av litteraturen, angående mikroarray-analyse av de novo tilsynelatende balanserte translokasjoner hos pasienter med psykomotorisk forsinkelse, avslører:* i 40 % av tilfellene: en abnormitet som ikke er identifisert på karyotypen, enten ved translokasjonsbruddpunkter eller på et annet sted på genom,* i 60 % av tilfellene: ingen abnormiteter er funnet med en oppløsning på opptil 25kb (Schluth-Bolard et al., 2009). Teknikken som vanligvis brukes til å klone et bruddpunkt og identifisere et forstyrret gen, er en "vandring" på kromosomet. Denne teknikken bruker fluorescerende prober, for eksempel BAC eller PAC, plassert på derivatkromosomene på begge sider av bruddpunktene. Denne teknikken er arbeidskrevende, tidkrevende og kostbar fordi man må sondere langs de derivative kromosomene, nærmere og nærmere bruddpunktet, for å finne sonden som overlapper bruddpunktet. Etterforskerne foreslår en original, innovativ og rask teknikk for å kartlegge kromosomtranslokasjonsbruddpunkter hos pasienter med psykomotorisk forsinkelse og ingen abnormiteter på mikroarray-analyse. Hovedmålet er å utvikle en teknikk for å identifisere nye gener ved å klone og kartlegge kromosomtranslokasjonsbruddpunkter. Disse genene vil da være kandidater til å forklare fenotypen til pasienten. Studien dekker en 24 måneders periode og inkluderer 10 pasienter. Gjennomførbarheten av teknikken, så vel som dens anvendelse på rutinemessig laboratoriediagnose, vil bli evaluert. Studien ble godkjent av vår lokale bioetikkkomité og respekterer fransk lov om bioetikk. Metode: Pasienter bør velges ut under personalmøter, inkludert klinikere og biologer. En innledende mikroarray-analyse skal utføres for å identifisere en gevinst eller tap av genetisk materiale. Prøver som ingen gevinst eller tap er identifisert for, gjennomgår deretter flowcytometri for å isolere derivatkromosomene. Hver derivatkromosombrønn hybridiseres deretter til en ny mikroarray, og avslører dermed bruddpunktet. Bruddpunktene vil bli bekreftet med FISH-teknikk, og molekylærbiologiske teknikker kan godt brukes for å klone og sekvensere bruddpunktene. Databaser kan godt brukes til å se etter gener som ligger i eller rundt bruddpunktene. Nødvendig informasjon: Administrative data (3 første bokstaver i etternavnet og 2 første bokstaver i fornavnet, fødselsdato, identifikasjon av foreldre, informert samtykke). Kliniske og biologiske data (fenotype, karyotype, andre genetiske studier). Forventede resultater: Utvikling av rask og rimeligere teknikk for å klone translokasjonsbruddpunkter, Identifikasjon av gener som potensielt er involvert i mental forsinkelse og anomalier i embryoutvikling, Evaluering av fordelingen av ulike årsaker til syndromisk mental forsinkelse (ubalansert translokasjon på mikroarray, ytterligere omorganisering på mikroarray , genforstyrrelse eller uidentifisert årsak).