De Novon ilmeisesti tasapainotettujen kromosomitranslokaatioiden raja-arvoanalyysi

Psykomotorista viivettä havaitaan noin 3 %:lla väestöstä, ja siihen on useita syitä: ympäristöön liittyviä, geneettisiä (geeni tai kromosomi) tai tuntemattomia syitä. Kromosomipoikkeavuuksia on havaittu 15 %:ssa syndroomista psykomotorista viivettä (esim. liittyy toiseen oireeseen). Tasapainoisia kromosomaalisia translokaatioita havaitaan jokaisesta 1000 yksilöstä, ja vain 6 %:lla potilaista, joilla on ilmeisesti tasapainoiset de novo -translokaatiot, on epänormaali fenotyyppi (Warburton, 1991). Kirjallisuuden tarkastelu, joka koskee de novo ilmeisen tasapainoisten translokaatioiden mikrosiruanalyysiä potilailla, joilla on psykomotorinen viive, paljastaa:* 40 %:ssa tapauksista: poikkeavuuden, jota ei ole tunnistettu karyotyypissä joko translokaation katkaisupisteissä tai muussa paikassa genomi* 60 %:ssa tapauksista: poikkeavuuksia ei havaita 25 kb:n resoluutiolla (Schluth-Bolard et al., 2009). Tekniikka, jota yleensä käytetään katkaisupisteen kloonaamiseen ja katkenneen geenin tunnistamiseen, on "kävely" kromosomissa. Tämä tekniikka käyttää fluoresoivia koettimia, kuten BAC- tai PAC-koettimia, jotka sijaitsevat johdannaiskromosomeissa katkaisupisteiden molemmilla puolilla. Tämä tekniikka on työvoimavaltainen, aikaa vievä ja kallis, koska täytyy tutkia johdannaiskromosomeja pitkin, lähemmäs ja lähemmäksi katkaisukohtaa, jotta voidaan löytää katkaisupisteen päällekkäinen koetin. Tutkijat ehdottavat alkuperäistä, innovatiivista ja nopeaa tekniikkaa kromosomien translokaation rajapisteiden kartoittamiseksi potilailla, joilla on psykomotorinen viive ja joilla ei ole poikkeavuuksia mikrosiruanalyysissä. Päätavoitteena on kehittää tekniikka uusien geenien tunnistamiseksi kloonaamalla ja kartoittamalla kromosomien translokaation raja-arvoja. Nämä geenit voisivat sitten selittää potilaan fenotyypin. Tutkimus kattaa 24 kuukauden ajanjakson ja sisältää 10 potilasta. Tekniikan toteutettavuus sekä sen soveltaminen rutiininomaiseen laboratoriodiagnostiikkaan arvioidaan. Tutkimuksen hyväksyi paikallinen bioetiikkakomiteamme, ja se kunnioittaa Ranskan bioetiikkalakia. Metodologia: Potilaat valitaan hyvin henkilökunnan kokouksissa, mukaan lukien lääkärit ja biologit. Alustava mikrosiruanalyysi on suoritettava hyvin geneettisen materiaalin lisääntymisen tai häviämisen tunnistamiseksi. Näytteille, joiden vahvistusta tai häviötä ei tunnisteta hyvin, suoritetaan sitten virtaussytometria johdannaiskromosomien eristämiseksi. Jokainen johdannaiskromosomikuoppa hybridisoidaan sitten uuteen mikrosiruun, mikä paljastaa murtopisteen. Katkaisupisteet vahvistetaan FISH-tekniikalla ja molekyylibiologian tekniikoita voidaan soveltaa hyvin murtopisteiden kloonaamiseen ja sekvensointiin. Tietokantoja voidaan hyvin käyttää katkaisupisteissä tai niiden ympäristössä olevien geenien tarkistamiseen. Vaaditut tiedot: Hallinnolliset tiedot (3 sukunimen ensimmäistä kirjainta ja 2 etunimen ensimmäistä kirjainta, syntymäaika, vanhempien tunnistetiedot, tietoinen suostumus). Kliiniset ja biologiset tiedot (fenotyyppi, karyotyyppi, muut geneettiset tutkimukset). Odotetut tulokset: Nopean ja halvemman tekniikan kehittäminen translokaation murtopisteiden kloonaamiseen, henkiseen viivästymiseen ja alkionkehityksen poikkeavuuksiin mahdollisesti liittyvien geenien tunnistaminen, Syndrooman henkisen viiveen eri syiden jakautumisen arviointi (epätasapainoinen translokaatio mikrosirussa, lisäjärjestely mikrosirussa geenihäiriö tai tuntematon syy).