Анализ точек разрыва явно сбалансированных хромосомных транслокаций de Novo

Психомоторная задержка наблюдается примерно у 3% населения в целом и имеет различные причины: экологические, генетические (генные или хромосомные) или неизвестные. Хромосомные аномалии выявлены в 15% случаев синдромальной задержки психомоторного развития (т. связан с другим симптомом). Сбалансированные хромосомные транслокации наблюдаются у одного из каждых 1000 человек, и только 6% пациентов с очевидно сбалансированными транслокациями de novo имеют аномальный фенотип (Warburton, 1991). Обзор литературы, посвященный микрочиповому анализу очевидно сбалансированных транслокаций de novo у пациентов с задержкой психомоторного развития, выявил:* в 40% случаев: аномалию, не определяемую в кариотипе, либо в точках транслокации, либо в другом месте на геном* в 60% случаев: при разрешении до 25 т.п.н. аномалий не обнаружено (Schluth-Bolard et al., 2009). Техника, обычно используемая для клонирования точки разрыва и идентификации нарушенного гена, представляет собой «прогулку» по хромосоме. В этом методе используются флуоресцентные зонды, такие как BAC или PAC, расположенные на производных хромосомах по обе стороны от точек разрыва. Этот метод является трудоемким, длительным и дорогим, потому что нужно исследовать производные хромосомы, все ближе и ближе к точке разрыва, чтобы найти зонд, перекрывающий точку разрыва. Исследователи предлагают оригинальный, инновационный и быстрый метод картирования точек разрыва хромосомной транслокации у пациентов с задержкой психомоторного развития и отсутствием аномалий при анализе микрочипов. Основная цель состоит в том, чтобы разработать метод идентификации новых генов путем клонирования и картирования точек разрыва хромосомных транслокаций. Затем эти гены могут быть кандидатами для объяснения фенотипа пациента. Исследование охватывает 24-месячный период и включает 10 пациентов. Будут оцениваться осуществимость метода, а также его применение в рутинной лабораторной диагностике. Исследование было одобрено нашим местным комитетом по биоэтике и соблюдает французский закон о биоэтике. Методология: Пациенты должны быть отобраны на собраниях персонала, включая клиницистов и биологов. Для выявления увеличения или потери генетического материала необходимо провести первоначальный анализ микрочипов. Образцы, для которых хорошо не выявлено прибавления или потери, затем подвергают проточной цитометрии для выделения производных хромосом. Каждая производная хромосома затем гибридизуется с новым микрочипом, таким образом выявляя точку разрыва. Точки разрыва будут подтверждены с помощью метода FISH, а методы молекулярной биологии будут хорошо применяться для клонирования и определения последовательности точек разрыва. Базы данных хорошо использовать для проверки генов, расположенных в точках останова или вокруг них. Необходимая информация: административные данные (3 первые буквы фамилии и 2 первые буквы имени, дата рождения, идентификация родителей, информированное согласие). Клинические и биологические данные (фенотип, кариотип, другие генетические исследования). Ожидаемые результаты: Разработка быстрого и менее дорогого метода клонирования точек разрыва транслокации, Идентификация генов, потенциально участвующих в задержке умственного развития и аномалиях развития эмбриона, Оценка распределения различных причин синдромальной задержки умственного развития (несбалансированная транслокация на микрочипе, дополнительная перестройка на микрочипе , нарушение гена или неустановленная причина).