Brudpunktsanalyse af de Novo tilsyneladende afbalancerede kromosomale translokationer

Psykomotorisk forsinkelse observeres hos cirka 3 % af den generelle befolkning og har forskellige årsager: miljømæssige, genetiske (gen eller kromosom) eller ukendt. Kromosomale abnormiteter er blevet identificeret i 15 % af syndromisk psykomotorisk forsinkelse (dvs. forbundet med et andet symptom). Balancerede kromosomale translokationer observeres hos én ud af hver 1000 individer, og kun 6% af patienterne med de novo tilsyneladende balancerede translokationer har en unormal fænotype (Warburton, 1991). Gennemgang af litteraturen vedrørende mikroarray-analysen af ​​de novo tilsyneladende balancerede translokationer hos patienter med psykomotorisk forsinkelse afslører:* i 40 % af tilfældene: en abnormitet, der ikke er identificeret på karyotypen, enten ved translokationsbrudpunkterne eller et andet sted på genom,* i 60 % af tilfældene: der findes ingen abnormiteter med en opløsning på op til 25kb (Schluth-Bolard et al., 2009). Den teknik, der generelt bruges til at klone et brudpunkt og identificere et forstyrret gen, er en "vandring" på kromosomet. Denne teknik bruger fluorescerende prober, såsom BAC'er eller PAC'er, placeret på de afledte kromosomer på begge sider af brudpunkterne. Denne teknik er arbejdskrævende, tidskrævende og dyr, fordi man skal sondere langs de afledte kromosomer, tættere og tættere på brudpunktet, for at finde sonden, der overlapper brudpunktet. Efterforskerne foreslår en original, innovativ og hurtig teknik til at kortlægge kromosomtranslokationsbrudpunkter hos patienter med psykomotorisk forsinkelse og ingen abnormiteter på mikroarray-analyse. Hovedformålet er at udvikle en teknik til at identificere nye gener ved at klone og kortlægge kromosomtranslokationsbrudpunkter. Disse gener vil så være kandidater til at forklare patientens fænotype. Undersøgelsen dækker en 24 måneders periode og omfatter 10 patienter. Teknikkens gennemførlighed såvel som dens anvendelse til rutinemæssig laboratoriediagnose vil blive evalueret. Undersøgelsen blev godkendt af vores lokale bioetiske komité og respekterer fransk lov om bioetik. Metode: Patienter skal udvælges under personalemøder, herunder klinikere og biologer. En indledende mikroarray-analyse skal udføres for at identificere en gevinst eller tab af genetisk materiale. Prøver, for hvilke ingen gevinst eller tab er identificeret godt, gennemgår derefter flowcytometri for at isolere de afledte kromosomer. Hver afledt kromosombrønd hybridiseres derefter til en ny mikroarray, hvorved brudpunktet afsløres. Brydepunkterne vil blive bekræftet ved hjælp af FISH-teknik, og molekylærbiologiske teknikker vil blive anvendt til at klone og sekventere brudpunkterne. Databaser kan godt bruges til at tjekke for gener placeret i eller omkring brudpunkterne. Nødvendige oplysninger: Administrative data (3 første bogstaver i efternavnet og 2 første bogstaver i fornavnet, fødselsdato, identifikation af forældre, informeret samtykke). Kliniske og biologiske data (fænotype, karyotype, andre genetiske undersøgelser). Forventede resultater: Udvikling af hurtig og billigere teknik til at klone translokationsbrudpunkter, Identifikation af gener, der potentielt er involveret i mental forsinkelse og anomalier i embryoudvikling, Evaluering af fordelingen af ​​forskellige årsager til syndromisk mental forsinkelse (ubalanceret translokation på mikroarray, yderligere omarrangering på mikroarray , genforstyrrelse eller uidentificeret årsag).