Breekpuntanalyse van de Novo schijnbaar evenwichtige chromosomale translocaties

Psychomotorische vertraging wordt waargenomen bij ongeveer 3% van de algemene bevolking en heeft verschillende oorzaken: omgevingsfactoren, genetische (gen of chromosoom) of onbekende oorzaken. Chromosomale afwijkingen zijn geïdentificeerd bij 15% van de syndromale psychomotorische achterstand (dwz. geassocieerd met een ander symptoom). Evenwichtige chromosomale translocaties worden waargenomen bij één op de 1000 individuen en slechts 6% van de patiënten met de novo ogenschijnlijk gebalanceerde translocaties hebben een abnormaal fenotype (Warburton, 1991). Literatuuronderzoek, betreffende de microarray-analyse van de novo ogenschijnlijk gebalanceerde translocaties bij patiënten met psychomotorische achterstand, onthult:* in 40% van de gevallen: een afwijking die niet is geïdentificeerd op het karyotype, hetzij op de translocatiebreekpunten, hetzij op een andere locatie op de genoom,* in 60% van de gevallen: er worden geen afwijkingen gevonden met een resolutie tot 25 kb (Schluth-Bolard et al., 2009). De techniek die over het algemeen wordt gebruikt om een ​​breekpunt te klonen en een verstoord gen te identificeren, is een "wandeling" op het chromosoom. Deze techniek maakt gebruik van fluorescerende sondes, zoals BAC's of PAC's, die zich op de afgeleide chromosomen aan beide zijden van de breekpunten bevinden. Deze techniek is arbeidsintensief, tijdrovend en duur omdat men langs de afgeleide chromosomen moet tasten, steeds dichter bij het breekpunt, om de sonde te vinden die het breekpunt overlapt. De onderzoekers stellen een originele, innovatieve en snelle techniek voor om chromosoomtranslocatiebreekpunten in kaart te brengen bij patiënten met een psychomotorische achterstand en geen afwijkingen op microarray-analyse. Het hoofddoel is het ontwikkelen van een techniek om nieuwe genen te identificeren door chromosoomtranslocatiebreekpunten te klonen en in kaart te brengen. Deze genen zouden dan kandidaat zijn om het fenotype van de patiënt te verklaren. De studie beslaat een periode van 24 maanden en omvat 10 patiënten. De haalbaarheid van de techniek, evenals de toepassing ervan op routinematige laboratoriumdiagnose, zal worden geëvalueerd. De studie werd goedgekeurd door onze lokale bio-ethische commissie en respecteert de Franse bio-ethische wet. Methodologie: Patiënten worden geselecteerd tijdens personeelsvergaderingen, waaronder clinici en biologen. Er kan een eerste microarray-analyse worden uitgevoerd om winst of verlies van genetisch materiaal te identificeren. Monsters waarvoor geen winst of verlies is geïdentificeerd, ondergaan vervolgens flowcytometrie om de afgeleide chromosomen te isoleren. Elk afgeleid chromosoom kan vervolgens worden gehybridiseerd tot een nieuwe microarray, waardoor het breekpunt wordt onthuld. De breekpunten zullen worden bevestigd door de FISH-techniek en moleculaire biologische technieken kunnen goed worden toegepast om de breekpunten te klonen en te sequensen. Databases kunnen goed worden gebruikt om te controleren op genen die zich in of rond de breekpunten bevinden. Benodigde informatie: Administratieve gegevens (3 eerste letters van de achternaam en 2 eerste letters van de voornaam, geboortedatum, identificatie ouders, geïnformeerde toestemming). Klinische en biologische gegevens (fenotype, karyotype, andere genetische studies). Verwachte resultaten: Ontwikkeling van een snelle en goedkopere techniek om translocatie-breekpunten te klonen, Identificatie van genen die mogelijk betrokken zijn bij mentale vertraging en anomalieën van embryo-ontwikkeling, Evaluatie van de verdeling van verschillende oorzaken van syndromale mentale vertraging (ongebalanceerde translocatie op microarray, aanvullende herschikking op microarray , genverstoring of onbekende oorzaak).