Analýza zlomových bodů de Novo zjevně vyvážených chromozomálních translokací

Psychomotorické zpoždění je pozorováno u přibližně 3 % běžné populace a má různé příčiny: environmentální, genetické (gen nebo chromozom) nebo neznámé. Chromozomální abnormality byly identifikovány u 15 % syndromického psychomotorického zpoždění (tj. spojené s jiným příznakem). Vyvážené chromozomální translokace jsou pozorovány u jednoho z 1000 jedinců a pouze 6 % pacientů s de novo zjevně vyváženými translokacemi má abnormální fenotyp (Warburton, 1991). Přehled literatury týkající se mikročipové analýzy de novo zjevně vyvážených translokací u pacientů s psychomotorickým zpožděním odhaluje:* ve 40 % případů: abnormalitu neidentifikovanou na karyotypu, ať už v hraničních bodech translokací, ani na jiném místě na karyotypu genom,* v 60 % případů: nebyly nalezeny žádné abnormality s rozlišením do 25 kb (Schluth-Bolard et al., 2009). Technika obecně používaná ke klonování bodu zlomu a identifikaci narušeného genu je „procházka“ po chromozomu. Tato technika využívá fluorescenční sondy, jako jsou BAC nebo PAC, umístěné na odvozených chromozomech na obou stranách hraničních bodů. Tato technika je pracná, časově náročná a drahá, protože je nutné sondovat podél odvozených chromozomů, blíže a blíže k bodu zlomu, aby se nalezla sonda překrývající bod zlomu. Vyšetřovatelé navrhují originální, inovativní a rychlou techniku ​​mapování zlomových bodů translokace chromozomů u pacientů s psychomotorickým zpožděním a bez abnormalit na mikročipové analýze. Hlavním cílem je vyvinout techniku ​​pro identifikaci nových genů klonováním a mapováním zlomových bodů translokace chromozomů. Tyto geny by pak byly kandidáty na vysvětlení fenotypu pacienta. Studie pokrývá období 24 měsíců a zahrnuje 10 pacientů. Bude vyhodnocena proveditelnost techniky a také její aplikace pro rutinní laboratorní diagnostiku. Studie byla schválena naší místní bioetickou komisí a respektuje francouzské zákony o bioetice. Metodika: Pacienti by měli být vybíráni na poradách personálu včetně lékařů a biologů. Provede se počáteční mikročipová analýza, aby se identifikoval zisk nebo ztráta genetického materiálu. Vzorky, u kterých není dobře identifikován žádný zisk nebo ztráta, pak podstoupí průtokovou cytometrii, aby se izolovaly odvozené chromozomy. Každý derivační chromozom se poté hybridizuje s novým mikročipem, čímž se odhalí bod zlomu. Body zlomu budou potvrzeny technikou FISH a techniky molekulární biologie se dobře použijí pro klonování a sekvenování bodů přerušení. Databáze se dobře používají ke kontrole genů umístěných v bodech přerušení nebo kolem nich. Požadované údaje: Administrativní údaje (3 první písmena příjmení a 2 první písmena jména, datum narození, identifikace rodičů, informovaný souhlas). Klinická a biologická data (fenotyp, karyotyp, jiné genetické studie). Očekávané výsledky: Vývoj rychlé a méně nákladné techniky pro klonování zlomů translokace, Identifikace genů potenciálně zapojených do mentálního zpoždění a anomálií vývoje embrya, Hodnocení distribuce různých příčin syndromického mentálního zpoždění (nevyvážená translokace na microarray, dodatečné přeuspořádání na microarray , narušení genu nebo neidentifikovaná příčina).