Brytpunktsanalys av de Novo uppenbarligen balanserade kromosomala translokationer

Psykomotorisk försening observeras hos cirka 3 % av den allmänna befolkningen och har olika orsaker: miljömässiga, genetiska (gen eller kromosom) eller okänd. Kromosomavvikelser har identifierats i 15 % av syndromisk psykomotorisk fördröjning (dvs. förknippas med ett annat symptom). Balanserade kromosomala translokationer observeras hos en av 1000 individer och endast 6 % av patienterna med de novo till synes balanserade translokationer har en onormal fenotyp (Warburton, 1991). Genomgång av litteraturen, rörande mikroarrayanalys av de novo uppenbarligen balanserade translokationer hos patienter med psykomotorisk fördröjning, avslöjar:* i 40 % av fallen: en abnormitet som inte identifierats på karyotypen, antingen vid translokationsbrytpunkterna eller på en annan plats på genom,* i 60 % av fallen: inga abnormiteter hittas med en upplösning på upp till 25kb (Schluth-Bolard et al., 2009). Den teknik som vanligtvis används för att klona en brytpunkt och identifiera en störd gen är en "vandring" på kromosomen. Denna teknik använder fluorescerande prober, såsom BACs eller PACs, placerade på derivatkromosomerna på båda sidor om brytpunkterna. Denna teknik är arbetskrävande, tidskrävande och dyr eftersom man måste sondera längs de derivativa kromosomerna, närmare och närmare brytpunkten, för att hitta sonden som överlappar brytpunkten. Utredarna föreslår en originell, innovativ och snabb teknik för att kartlägga kromosomtranslokationsbrytpunkter hos patienter med psykomotorisk fördröjning och inga abnormiteter vid mikroarrayanalys. Huvudsyftet är att utveckla en teknik för att identifiera nya gener genom att klona och kartlägga kromosomtranslokationsbrytpunkter. Dessa gener skulle då vara kandidater för att förklara patientens fenotyp. Studien omfattar en 24-månadersperiod och omfattar 10 patienter. Teknikens genomförbarhet, såväl som dess tillämpning på rutinmässig laboratoriediagnos, kommer att utvärderas. Studien godkändes av vår lokala bioetiska kommitté och respekterar den franska lagen om bioetik. Metod: Patienter väljs väl ut under personalmöten inklusive läkare och biologer. En initial mikroarrayanalys utförs väl för att identifiera en vinst eller förlust av genetiskt material. Prover för vilka ingen vinst eller förlust identifieras väl genomgår sedan flödescytometri för att isolera derivatkromosomerna. Varje derivatkromosombrunn hybridiseras sedan till en ny mikromatris, vilket avslöjar brytpunkten. Brytpunkterna kommer att bekräftas med FISH-teknik och molekylärbiologiska tekniker kommer att användas för att klona och sekvensera brytpunkterna. Databaser kan användas för att leta efter gener som finns i eller runt brytpunkterna. Obligatorisk information: Administrativa uppgifter (3 första bokstäver i efternamnet och 2 första bokstäver i förnamnet, födelsedatum, identifiering av föräldrar, informerat samtycke). Kliniska och biologiska data (fenotyp, karyotyp, andra genetiska studier). Förväntade resultat: Utveckling av snabb och billigare teknik för att klona translokationsbrytpunkter, Identifiering av gener som potentiellt är involverade i mental fördröjning och anomalier i embryonutveckling, Utvärdering av fördelningen av olika orsaker till syndromisk mental fördröjning (obalanserad translokation på mikroarray, ytterligare omarrangemang på mikroarray , genstörning eller oidentifierad orsak).