Prosentandel av BRAFV600E-alleler og utfall ved skjoldbruskkarsinom (ABOUT)

BAKGRUNN Papillært skjoldbruskkarsinom (PTC) viser generelt en utmerket prognose med en 5-års overlevelse på over 95 %. Selv når PTC metastaserer til de regionale lymfeknuter, en hyppig forekomst, har den generelt en utmerket prognose. Imidlertid er det noen pasienter som presenterer med en aggressiv bakgrunn eller med spesifikke klinikopatologiske trekk som viser aggressiv utviklingsatferd. Flere klinikopatologiske trekk, nemlig patologisk subtype, alder, fjern- og lymfeknutemetastase, ekstrathyroidforlengelse og fullstendighet av reseksjon kan brukes til å forutsi prognose og har blitt tatt i bruk i stadiesystemer som AMES-, MACIS- og AJCC TNM-klassifikasjonene.

Den genetiske bakgrunnen er en kraftig prognostisk determinant bare når den brukes på noen genmutasjoner som TERT-promoter og p53-mutasjoner. Den prognostiske verdien av BRAFV600E, det hyppigste onkogenet ved PTC, er svak. Det korrelerer med større ekstensjon, lymfeknutemetastase og avansert stadium (III/IV). Dens korrelasjon med utfall i PTC har vært gjenstand for mange ikke alltid samsvarende studier. En stor multisenterstudie var nødvendig for å utvetydig demonstrere sammenhengen mellom BRAFV600E og kreftresidiv og dødelighet. Risikoen for PTC som huser BRAFV600E er fortsatt svak (residivfareforhold 2,66) og søk etter denne mutasjonen anbefales ikke i klinisk behandling av lavrisikopasienter med skjoldbruskkjertelkreft.

Ulike forskningsgrupper ga bevis på heterogeniteten til PTC som består av en blanding av tumorceller med villtype og BRAFV600E (5, 6). Betydningen av prosentandelen av BRAFV600E positive celler i svulsten ble demonstrert i 168 PTC. Analysen av BRAFV600E/BRAF villtype ratio ble utført ved pyrosekvensering og høyere ratio var positivt korrelert med pasientens alder, tumorvolum, lymfeknutemetastaser og med verste sykdomsutfall. Pasienter med svulster med BRAFV600E/BRAFvilltype-ratio ≥ 30 % viste en oddsrisiko for tumorresidiv på 5,1, mens den bare var 1,75 i BRAFV600E-positive svulster dersom allelforholdet ikke ble vurdert. Den kvalitative analysen BRAFV600E positiv versus negativ PTC kan forklare de uoverensstemmende korrelasjonene med klinikopatologiske egenskaper og utfall i forskjellige kohorter av pasienter med forskjellig forhold mellom BRAFV600E alleler, og til slutt kan den kvalitative analysen BRAF mutasjonsstatus redusere styrken av dens kliniske betydning og nytte.

Mens eksistensen av intratumorheterogenitet i PTC støttes av mange bevis, stilles det spørsmål ved dens utvidelse, biologiske betydning og kliniske nytte og må undersøkes videre.

Digital-dråpe PCR (ddPCR) er en analysemetode som nylig er utviklet, egnet for absolutt kvantifisering av mål-DNA i en DNA-blanding. Det er den mest nøyaktige metoden for å bestemme BRAFV600E/BRAFvildtype allelforholdet.

FORSKNINGENS MÅL

1. Bestem hvor hyppige subklonale BRAFV600E PTC er og for å bestemme gjennomsnitt og median BRAFV600E/BRAF villtype allelforhold i heterogene svulster;
2. Bestem forholdet mellom prosentandelen av BRAFV600E-alleler og klinisk-patologiske trekk;
3. Bestem forholdet mellom prosentandelen av BRAFV600E-alleler og utfallet hos PTC-pasienter (primært endepunkt)

STUDERE DESIGN

• En stor serie av PTC-formalinfikserte, parafininnstøpte (FFPE) vev med en klinisk oppfølging > 3 år vil bli analysert med ddPCR for å bestemme prosentandelen av BRAFV600E-alleler.
• Renheten til PTC-prøver og forholdet neoplastiske celler/forurensende celler vil bli vurdert ved a) analyse ved rt-PCR av ekspresjon av et panel av RNA spesifikt for lymforetikulære celler og stromaceller; b) mikroskopisk gjennomgang av tilstøtende vevssnitt.
• Statistisk analyse vil bli utført for å søke etter korrelasjoner mellom prosentandelen av BRAFV600E-alleler og a) patologiske egenskaper, TNM, stadieinndeling; b) tilbakefall og overlevelse