BRAFV600E-alleelien prosenttiosuus ja tulos kilpirauhaskarsinoomassa (ABOUT)

TAUSTA Papillaarisen kilpirauhassyövän (PTC) ennuste on yleensä erinomainen, ja viiden vuoden eloonjäämisaste on yli 95 %. Jopa silloin, kun PTC metastasoituu alueellisiin imusolmukkeisiin, joka on usein esiintyvä, sillä on yleensä erinomainen ennuste. Joillakin potilailla on kuitenkin aggressiivinen tausta tai kliiniset patologiset piirteet, jotka osoittavat aggressiivista kehityskäyttäytymistä. Useita kliinisopatologisia piirteitä, nimittäin patologian alatyyppiä, ikää, etäis- ja imusolmukkeiden etäpesäkkeitä, kilpirauhasen ulkopuolista laajenemista ja resektion täydellisyyttä, voidaan käyttää ennustamaan ennustetta, ja ne on otettu käyttöön vaiheistusjärjestelmissä, kuten AMES-, MACIS- ja AJCC TNM -luokitukset.

Geneettinen tausta on voimakas prognostinen determinantti vain, kun sitä sovelletaan joihinkin geenimutaatioihin, kuten TERT-promoottoriin ja p53-mutaatioihin. PTC:ssä yleisimmän onkogeenin BRAFV600E:n ennustearvo on heikko. Se korreloi laajemman laajenemisen, imusolmukkeiden etäpesäkkeiden ja pitkälle edenneen vaiheen (III/IV) kanssa. Sen korrelaatio PTC:n tulokseen on ollut monien, ei aina yhtäpitävien tutkimusten kohteena. Laaja monikeskustutkimus oli tarpeen osoittaakseen yksiselitteisesti BRAFV600E:n ja syövän uusiutumisen ja kuolleisuuden välisen yhteyden. BRAFV600E:n sisältävän PTC:n riski on edelleen heikko (recidiivisten riskisuhde 2,66), eikä tämän mutaation etsimistä suositella kilpirauhassyöpää sairastavien matalariskisten potilaiden kliinisessä hoidossa.

Eri tutkimusryhmät toimittivat todisteita PTC:n heterogeenisyydestä, joka koostuu kasvainsolujen sekoituksesta villityypin ja BRAFV600E:n kanssa (5, 6). BRAFV600E-positiivisten solujen prosenttiosuuden merkitys kasvaimessa osoitettiin 168 PTC:ssä. BRAFV600E/BRAF-villityyppisen suhteen analyysi suoritettiin pyrosekvensoinnilla ja korkeampi suhde korreloi positiivisesti potilaan iän, kasvaimen tilavuuden, imusolmukkeiden etäpesäkkeiden ja pahimman sairauden lopputuloksen kanssa. Potilailla, joilla oli kasvaimia, joiden BRAFV600E/BRAF-villityypin suhde oli ≥ 30 %, kasvaimen uusiutumisen riski oli 5,1, kun taas BRAFV600E-positiivisissa kasvaimissa se oli vain 1,75, jos alleelisuhdetta ei otettu huomioon. Kvalitatiivinen analyysi BRAFV600E positiivinen vs. negatiivinen PTC voi selittää ristiriitaiset korrelaatiot kliinisten patologisten ominaisuuksien ja tulosten kanssa eri potilasryhmissä, joilla on erilainen BRAFV600E-alleelisuhde, ja viime kädessä kvalitatiivinen analyysi BRAF:n mutaatiostatus voi vähentää sen kliinistä merkitystä ja hyödyllisyyttä.

Vaikka monet todisteet tukevat kasvaimensisäisen heterogeenisyyden olemassaoloa PTC:ssä, sen laajuus, biologinen merkitys ja kliininen käyttökelpoisuus ovat kyseenalaisia ​​ja niitä on tutkittava lisää.

Digitaalinen pisara-PCR (ddPCR) on äskettäin kehitetty analyyttinen menetelmä, joka soveltuu kohde-DNA:n absoluuttiseen kvantifiointiin DNA-seoksessa. Se on tarkin menetelmä määrittää BRAFV600E/BRAFvillityypin alleelisuhde.

TUTKIMUKSEN TAVOITE

1. Määritä, kuinka usein subklonaalisia BRAFV600E PTC:itä esiintyy, ja määritä keskimääräinen ja mediaani BRAFV600E/BRAFvillityypin alleelisuhde heterogeenisissä kasvaimissa;
2. Määritä BRAFV600E-alleelien prosenttiosuuden ja kliiniset patologisten piirteiden välinen suhde;
3. Määritä suhde BRAFV600E-alleelien prosenttiosuuden ja tuloksen välillä PTC-potilailla (ensisijainen päätepiste)

OPINTUSUUNNITTELU

• Suuri sarja PTC-formaliiniin kiinnitettyjä, parafiiniin upotettuja (FFPE) kudoksia, joiden kliininen seuranta on yli 3 vuotta, analysoidaan ddPCR:llä BRAFV600E-alleelien prosenttiosuuden määrittämiseksi.
• PTC-näytteiden puhtaus ja neoplastisten solujen ja kontaminoivien solujen suhde arvioidaan a) lymforetikulaarisille soluille ja stroomasoluille spesifisen RNA-paneelin ilmentymisen analysoinnilla rt-PCR:llä; b) viereisten kudosleikkeiden mikroskooppinen tarkastelu.
• Tilastollinen analyysi suoritetaan korrelaatioiden etsimiseksi BRAFV600E-alleelien prosenttiosuuden ja a) patologisten ominaisuuksien, TNM:n, stagingin välillä; b) uusiutuminen ja selviytyminen