Antibiotyping og prevalens av virulente genotyper blant Helicobacter Pylori og deres innvirkning på respons på terapi
- Påvisning av primær antimikrobiell følsomhet og resistens av Helicobacter Pylori-infeksjon.
- Påvisning av resistens- og virulensgener for Helicobacter Pylori-infeksjon.
- Vurdering av H pylori karsinogenitetsgen.
- Evaluering av utfall og effekt av antibiotikakur vil bli brukt i vår forskning.
- Evaluering av effekten av andre faktorer som kosthold (fett og krydret måltid), medisiner som NSAIDs bruker, antibiotika uansett årsak på respons av H pylori på antibiotikakur.
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
- Genetisk: påvisning av vakuolerende cytotoksin A (Vac A) og cytotoksinassosiert gen A (Cag A) virulente H.Pylori-genotyper ved polymerasekjedereaksjonsamplifikasjon (PCR) i gastriske biopsier:
- Diagnostisk test: Kultur og følsomhet av endoskopiske gastriske biopsier:
- Annen: Histopatologisk undersøkelse endoskopiske gastriske biopsier:
- Fremgangsmåte: Øvre endoskopi
- Legemiddel: empiriske H.pylori-regimer
- Diagnostisk test: H.Pylori Ag i avføring
Detaljert beskrivelse
Helicobacter pylori (H. pylori)-infeksjon er en av de vanligste infeksjonene hos mennesker, og rammer mer enn halvparten av verdens befolkning. Nye infeksjoner antas å oppstå som en konsekvens av direkte menneske-til-menneske overføring eller miljøforurensning.
Forekomsten av infeksjonen varierer mye i landlige utviklingsområder (mer enn 80 %) sammenlignet med byutviklede (mindre enn 40 %), som en konsekvens av ulike sosioøkonomiske og hygieniske forhold.
Den vertikale modusen er smittespredning fra ascendent til etterkommer innenfor samme familie, mens horisontal overføring innebærer kontakt med individer utenfor familien eller miljøforurensning.
De fleste individer er infisert av Helicobacter pylori i tidlig barndom; i utviklingsland. Vellykket utryddelse er viktig for å forhindre utvikling av antibiotikaresistens, samt for å redusere antall behandlinger og prosedyrer. Dermed kan nasjonale/regionale antibiotikaresistensdata brukes til å veilede behandlingsregimer for H pylori-infeksjon.
Flere kliniske faktorer assosiert med økt forekomst av antibiotikaresistent H. pylori, inkludert historie med tidligere antibiotikaeksponering, økende alder, kvinnelig kjønn, etnisitet/rase, omfang av alkoholbruk og ikke-ulcus dyspepsi.
Den primære antibiotikaresistensen til H. pylori øker over hele verden. Den totale resistensraten ble funnet å være 4,55 % for amoxicillin; 27,22 % for klaritromycin; 39,66 % for metronidazol; og 22,48 % for levofloxacin.
Derfor er medikamentfølsomhetsresultatet av disse antibiotika nødvendig for å velge riktig medikament for vellykket utryddelse av infeksjonen.
Helicobacter pylori viser spesifikke geografiske distribusjoner som er relatert til kliniske utfall. Til tross for den høye infeksjonsraten for H. pylori over hele verden, må den genetiske epidemiologiske overvåkingen av H. pylori fortsatt forbedres.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Asyut, Egypt
- Nariman Zaghloul Bekhiet
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Alle pasienter er over 18 år med symptomatisk H pylori-infeksjon pasienter diagnostisert med positiv H pylori Ag i avføring (naiv behandling).
Ekskluderingskriterier:
- Pasienter som ikke er kvalifisert for endoskopi.
- Pasientene er under 18 år
- Pasientens avslag
- historie med bruk av antibiotika eller protonpumpehemmere i løpet av forrige måned.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Behandling
- Tildeling: N/A
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / Arm |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Annen: En gruppe naive H.Pylori-infeksjoner vil sendes inn for øvre endoskopi.
Øvre endoskopi vil bli utført under fullstendig septisk tilstand og flere gastriske biopsier fra corpus og antrum vil bli tatt for:
|
Ekstraksjon av DNA, ved bruk av Wizard® Genomic DNA Purification Kit (Promega-USA), vil bli utført etter produsentens instruksjoner.
For påvisning av vakuolerende cytotoksin A og cytotoksinassosiert gen A-gen, vil polymerasekjedereaksjonamplifikasjon utføres med en 9 minutters innledende denaturering ved 94˚C, etterfulgt av 35 sykluser på 1 minutt ved 94˚C, 45 sekunder ved 60˚ C, og 45 sekunder ved 72˚C.
Endelig forlengelse vil bli utført i 5 minutter ved 72˚C.
For påvisning av vakuolerende cytotoksin A (S1/S2, m1, m2), vil PCR bli utført med en 9 minutters innledende denaturering ved 94˚C, etterfulgt av 35 sykluser på 1 minutt ved 94˚C, 45 sekunder ved 56˚C , og 45 sekunder ved 72˚C.
Endelig forlengelse vil bli utført i 5 minutter ved 72˚C.
Amplifisert DNA vil bli analysert ved agarosegelelektroforese.
En positiv prøve vil gi bånd ved DNA-fragment 138-bp for cytotoksin-assosiert gen A, ved 259/286-bp for vakuolering av cytotoksin A s1/s2, og 290-bp og 352-bp for henholdsvis m1 og m2
Under endoskopi vil tre biopsier bli tatt fra antrum og/eller corpus av og vil bli undersøkt med hurtig ureasetest også kjent som Campylobacter-lignende organismetest (Kimberly-Clark, USA).
Dyrking av bakterien på Columbia-agar pluss 5-7 % defibrinert heste- eller saueblod og selektivt Dent-tilskudd under mikroaerofile tilstander ved 37 grader Celsius i 3-5 dager.
Histologiske snitt fra antrum- og kroppsregionene vil bli farget med Giemsa-farge.
Giemsa-fargearbeidsløsning ble fremstilt som følger: 40 ml Giemsa-stamløsning med 60 ml destillert vann.
Giemsa stamløsning vil bli tilberedt som følger: Giemsa pulver 4 g, glyserol 250 ml og metanol 250 ml.
Histologiske snitt vil bli undersøkt av en gastrointestinal patolog for å standardisere klassifiseringen av gastritt.
Histopatologisk klassifisering vil bli registrert som følgende (akutt gastritt, mild-moderat-alvorlig kronisk gastritt, kjertelatrofi eller intestinal metaplasi).
det vil bli gjort tålmodig før oppstart av empirisk terapi og multiple antrum- og/eller corpusbiopsier vil bli tatt.
Pasienten vil faste i minst 8 timer. Øvre og funn vil bli registrert i rapporten som tilstedeværelse av gastroøsofageal reflukssykdom, diffus eller lokalisert gastrisk og/eller duodenal rødhet, slimhinnehevelse, atrofi av slimhinne, nodularitet, intestinal metaplasi, erosjoner eller sår .
Start empiriske antibiotikakurer for pasient trippelterapi ((levofloksacin 400 mg én gang, amoksicillin 1000 mg to ganger i 2 uker) og (protonpumpehemmer to ganger i 1 måned)).
Følg opp etter 2 uker etter avsluttet kur med Stool Ag i avføring
Enhver symptomatisk pasient er over 18 år med H pylori-infeksjon pasienter diagnostisert med positiv H pylori Ag i avføring vil bli inkludert. vurdering av laboratorierespons, 2 uker etter avsluttet empirisk terapi. |
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
påvisning av antibiotikakultur før behandling og sensitivitetstest
Tidsramme: opptil 12 måneder
|
Under endoskopi vil det bli tatt tre biopsier fra antrum og/eller corpus av mage, Biopsier vil bli undersøkt for identifikasjon av H. pylori ved hurtig ureasetest også kjent som Campylobacter-lignende organismetest (Kimberly-Clark, USA).
Dyrking av bakterien på Columbia-agar (Oxoid-UK) pluss 5-7 % defibrinert heste- eller saueblod og selektivt Dent-tilskudd (Oxoid-UK) under mikroaerofile tilstander ved 37 grader Celsius i 3-5 dager.
Så etterforskerne vil oppdage prevalens og typer antibiotika H.Pylori-resistens i biopsier.
|
opptil 12 måneder
|
|
påvisning av vakuolerende cytotoksin A og cytotoksinassosiert gen A virulente Helicobacter Pylori genotyper ved polymerasekjedereaksjonsforsterkning (PCR)
Tidsramme: opptil 12 måneder
|
Ekstraksjon av DNA, ved bruk av Wizard® Genomic DNA Purification Kit (Promega-USA), vil bli utført etter produsentens instruksjoner.
For påvisning av vakuolerende cytotoksin A og cytotoksinassosiert gen A-gen, vil polymerasekjedereaksjonamplifikasjon utføres med en 9 minutters innledende denaturering ved 94˚C, etterfulgt av 35 sykluser på 1 minutt ved 94˚C, 45 sekunder ved 60˚ C, og 45 sekunder ved 72˚C.
Endelig forlengelse vil bli utført i 5 minutter ved 72˚C.
For påvisning av vakuolerende cytotoksin A (S1/S2, m1, m2), vil PCR bli utført med en 9 minutters innledende denaturering ved 94˚C, etterfulgt av 35 sykluser på 1 minutt ved 94˚C, 45 sekunder ved 56˚C , og 45 sekunder ved 72˚C.
Endelig forlengelse vil bli utført i 5 minutter ved 72˚C.
Amplifisert DNA vil bli analysert ved agarosegelelektroforese.
En positiv prøve vil gi bånd ved DNA-fragment 138-bp for cytotoksin-assosiert gen A, ved 259/286-bp for vakuolering av cytotoksin A s1/s2, og 290-bp og 352-bp for henholdsvis m1 og m2.
|
opptil 12 måneder
|
|
Relasjon mellom histopatologisk undersøkelse (gastrittklassifisering) til klinisk presentasjon og til resistens.
Tidsramme: opptil 12 måneder
|
Histopatologisk undersøkelse av endoskopiske biopsier og påviser akutt eller kronisk betennelse indusert av H.pylori-bakterier.
|
opptil 12 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Påvisning av kosthold og legemidlers effekt på respons på behandling
Tidsramme: opptil 12 måneder
|
Oppdag diettinntak (fett og krydret måltid), narkotikabruk (som NSAIDs, antibiotika, protonpumpehemmere i forrige måned) ved spørreskjema.
|
opptil 12 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Liu Y, Wang S, Yang F, Chi W, Ding L, Liu T, Zhu F, Ji D, Zhou J, Fang Y, Zhang J, Xiang P, Zhang Y, Zhao H. Antimicrobial resistance patterns and genetic elements associated with the antibiotic resistance of Helicobacter pylori strains from Shanghai. Gut Pathog. 2022 Mar 30;14(1):14. doi: 10.1186/s13099-022-00488-y.
- Deng L, He XY, Tang B, Xiang Y, Yue JJ. An improved quantitative real-time polymerase chain reaction technology for Helicobacter pylori detection in stomach tissue and its application value in clinical precision testing. BMC Biotechnol. 2020 Jun 22;20(1):33. doi: 10.1186/s12896-020-00624-z.
- Pokhrel N, Khanal B, Rai K, Subedi M, Bhattarai NR. Application of PCR and Microscopy to Detect Helicobacter pylori in Gastric Biopsy Specimen among Acid Peptic Disorders at Tertiary Care Centre in Eastern Nepal. Can J Infect Dis Med Microbiol. 2019 Feb 5;2019:3695307. doi: 10.1155/2019/3695307. eCollection 2019.
Hjelpsomme linker
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
- Infeksjoner
- Diagnostiske teknikker og prosedyrer
- Diagnose
- Kirurgiske prosedyrer, operativ
- Minimalt invasive kirurgiske inngrep
- Diagnostiske teknikker, kirurgisk
- Endoskopi, gastrointestinal
- Endoskopi, fordøyelsessystem
- Diagnostiske teknikker, fordøyelsessystem
- Endoskopi
- Fordøyelsessystem kirurgiske inngrep
- Fordøyelsessystem Fysiologiske fenomener
- Fordøyelsessystem og orale fysiologiske fenomener
- Avføring
- Gastroskopi
Andre studie-ID-numre
- APVGHP
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .