Antibiotypering en prevalentie van virulente genotypen bij Helicobacter pylori en hun impact op de respons op therapie
- Detectie van primaire antimicrobiële gevoeligheid en resistentie van Helicobacter Pylori-infectie.
- Detectie van resistentie- en virulentiegenen van Helicobacter Pylori-infectie.
- Beoordeling van H pylori carcinogeniciteitsgen.
- Evaluatie van het resultaat en de werkzaamheid van het antibioticaregime zal in ons onderzoek worden gebruikt.
- Evaluatie van het effect van andere factoren zoals dieet (vette en gekruide maaltijd), medicijnen zoals NSAID's, antibiotica voor welke oorzaak dan ook op reactie van H pylori op antibioticaregime.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
- Genetisch: detectie van vacuolerende cytotoxine A (Vac A) en cytotoxine-geassocieerd gen A (Cag A) virulente H.Pylori genotypen door polymerase kettingreactie amplificatie (PCR) in maagbiopten:
- Diagnostische toets: Cultuur en gevoeligheid van endoscopische maagbiopten:
- Ander: Histopathologisch onderzoek endoscopische maagbiopten:
- Procedure: Bovenste endoscopie
- Geneesmiddel: empirische H.pylori-regimes
- Diagnostische toets: H.Pylori Ag in ontlasting
Gedetailleerde beschrijving
Helicobacter pylori (H. pylori) is een van de meest voorkomende infecties bij mensen en treft meer dan de helft van de wereldbevolking. Aangenomen wordt dat nieuwe infecties optreden als gevolg van directe overdracht van mens op mens of milieuverontreiniging.
De prevalentie van de infectie varieert sterk in ontwikkelingsgebieden op het platteland (meer dan 80%) in vergelijking met ontwikkelde stedelijke gebieden (minder dan 40%), als gevolg van verschillende sociaaleconomische en hygiënische omstandigheden.
De verticale modus is de verspreiding van infectie van ascendant naar afstammeling binnen dezelfde familie, terwijl horizontale overdracht betrekking heeft op contact met personen buiten de familie of op milieuverontreiniging.
De meeste individuen worden tijdens de vroege kinderjaren door Helicobacter pylori geïnfecteerd; in ontwikkelingslanden. Succesvolle uitroeiing is belangrijk om de ontwikkeling van antibioticaresistentie te voorkomen en om het aantal behandelingen en procedures te verminderen. Nationale/regionale gegevens over antibioticaresistentie kunnen dus worden gebruikt als leidraad voor behandelingsregimes voor H pylori-infectie.
Verschillende klinische factoren die verband houden met verhoogde percentages van antibioticaresistente H. pylori, waaronder een geschiedenis van eerdere blootstelling aan antibiotica, toenemende leeftijd, vrouwelijk geslacht, etniciteit/ras, mate van alcoholgebruik en dyspepsie zonder zweren.
De primaire antibioticaresistentie van H. pylori neemt wereldwijd toe. Het totale resistentiepercentage bleek 4,55% te zijn voor amoxicilline; 27,22% voor claritromycine; 39,66% voor metronidazol; en 22,48% voor levofloxacine.
Daarom is het resultaat van de gevoeligheid voor geneesmiddelen van deze antibiotica noodzakelijk om het juiste geneesmiddel te selecteren voor de succesvolle uitroeiing van de infectie.
Helicobacter pylori vertoont specifieke geografische distributies die verband houden met klinische uitkomsten. Ondanks het hoge infectiepercentage van H. pylori over de hele wereld, moet de genetische epidemiologische surveillance van H. pylori nog worden verbeterd.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Asyut, Egypte
- Nariman Zaghloul Bekhiet
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Elke patiënt ouder dan 18 jaar met symptomatische H pylori-infectie patiënten gediagnosticeerd door positieve H pylori Ag in ontlasting (naïeve behandeling).
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten die niet in aanmerking komen voor endoscopie.
- Patiënten zijn jonger dan 18 jaar
- Weigering van de patiënt
- voorgeschiedenis van gebruik van antibiotica of protonpompremmers in de afgelopen maand.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Behandeling
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: Een groep van naïeve H.Pylori-infecties zal worden ingediend voor endoscopie van het bovenste deel.
Bovenste endoscopie zal worden uitgevoerd onder volledige septische toestand en er zullen meerdere maagbiopten van corpus en antrum worden genomen voor:
|
Extractie van DNA, met behulp van Wizard® Genomic DNA Purification Kit (Promega-USA), wordt uitgevoerd volgens de instructies van de fabrikant.
Voor detectie van vacuolerend cytotoxine A en cytotoxine-geassocieerd gen A-gen, zal polymerasekettingreactieamplificatie worden uitgevoerd met een initiële denaturatie van 9 minuten bij 94°C, gevolgd door 35 cycli van 1 minuut bij 94°C, 45 seconden bij 60°C. C, en 45 seconden bij 72˚C.
De laatste verlenging wordt uitgevoerd gedurende 5 minuten bij 72˚C.
Voor detectie van vacuolerend cytotoxine A (S1/S2, m1, m2) wordt PCR uitgevoerd met een initiële denaturatie van 9 minuten bij 94˚C, gevolgd door 35 cycli van 1 minuut bij 94˚C, 45 seconden bij 56˚C , en 45 seconden bij 72˚C.
De laatste verlenging wordt uitgevoerd gedurende 5 minuten bij 72˚C.
Geamplificeerd DNA zal worden geanalyseerd door middel van agarosegelelektroforese.
Een positief monster geeft banden bij DNA-fragment 138 bp voor cytotoxine-geassocieerd gen A, bij 259/286 bp voor vacuolerende cytotoxine A s1/s2 en respectievelijk 290 bp en 352 bp voor m1 en m2
Tijdens de endoscopie worden drie biopsieën genomen uit het antrum en/of het corpus van en onderzocht door middel van een snelle ureasetest, ook bekend als Campylobacter-like organisme-test (Kimberly-Clark, VS).
Cultuur van de bacterie op Columbia-agar plus 5-7% gedefibrineerd paarden- of schapenbloed en selectief Dent-supplement onder micro-aerofiele omstandigheden bij 37 graden Celsius gedurende 3-5 dagen.
Histologische secties van de antrum- en lichaamsregio's worden gekleurd met Giemsa-kleuring.
De Giemsa-kleurwerkoplossing werd als volgt bereid: 40 ml Giemsa-voorraadoplossing met 60 ml gedestilleerd water.
De voorraadoplossing van Giemsa wordt als volgt bereid: Giemsa-poeder 4 g, glycerol 250 ml en methanol 250 ml.
Histologische secties zullen worden onderzocht door een gastro-intestinale patholoog om de classificatie van gastritis te standaardiseren.
De histopathologische classificatie wordt als volgt geregistreerd (acute gastritis, milde tot matige tot ernstige chronische gastritis, klieratrofie of darmmetaplasie).
het zal patiënt worden gedaan voordat met empirische therapie wordt begonnen en er zullen meerdere antrum- en/of corpusbiopten worden genomen.
Patiënt zal ten minste 8 uur nuchter zijn. Bovenste en bevindingen zullen in het rapport worden opgenomen als aanwezigheid van gastro-oesofageale refluxziekte, diffuse of gelokaliseerde maag- en/of duodenale roodheid, slijmvlieszwelling, atrofie van slijmvlies, nodulariteit, darmmetaplasie, erosies of zweren .
Start empirische antibioticaregimes patiënt drievoudige therapie ((levofloxacine 400 mg eenmaal, amoxicilline 1000 mg tweemaal gedurende 2 weken) en (protonpompremmer tweemaal gedurende 1 maand)).
Follow-up na 2 weken na het beëindigen van het regime door Stool Ag in de ontlasting
Elke symptomatische patiënt ouder dan 18 jaar met een H pylori-infectie, patiënten met de diagnose positieve H pylori Ag in de ontlasting zullen worden opgenomen. beoordeling van de laboratoriumrespons, 2 weken na het beëindigen van de empirische therapie. |
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
detectie van voorbehandeling antibioticakweek en gevoeligheidstest
Tijdsspanne: tot 12 maanden
|
Tijdens de endoscopie worden drie biopsieën genomen uit het antrum en/of het corpus van de maag. Biopsieën worden onderzocht op identificatie van H. pylori door middel van een snelle ureasetest, ook wel bekend als de Campylobacter-like organisme-test (Kimberly-Clark, VS).
Cultuur van de bacterie op Columbia-agar (Oxoid-UK) plus 5-7% gedefibrineerd paarden- of schapenbloed en selectief Dent-supplement (Oxoid-UK) onder micro-aerofiele omstandigheden bij 37 graden Celsius gedurende 3-5 dagen.
Dus de onderzoekers zullen de prevalentie en soorten antibioticum H.Pylori-resistentie in biopsieën detecteren.
|
tot 12 maanden
|
|
detectie van vacuolerende cytotoxine A en cytotoxine-geassocieerde gen A virulente Helicobacter Pylori genotypen door polymerase kettingreactie amplificatie (PCR)
Tijdsspanne: tot 12 maanden
|
Extractie van DNA, met behulp van Wizard® Genomic DNA Purification Kit (Promega-USA), wordt uitgevoerd volgens de instructies van de fabrikant.
Voor detectie van vacuolerend cytotoxine A en cytotoxine-geassocieerd gen A-gen, zal polymerasekettingreactieamplificatie worden uitgevoerd met een initiële denaturatie van 9 minuten bij 94°C, gevolgd door 35 cycli van 1 minuut bij 94°C, 45 seconden bij 60°C. C, en 45 seconden bij 72˚C.
De laatste verlenging wordt uitgevoerd gedurende 5 minuten bij 72˚C.
Voor detectie van vacuolerend cytotoxine A (S1/S2, m1, m2) wordt PCR uitgevoerd met een initiële denaturatie van 9 minuten bij 94˚C, gevolgd door 35 cycli van 1 minuut bij 94˚C, 45 seconden bij 56˚C , en 45 seconden bij 72˚C.
De laatste verlenging wordt uitgevoerd gedurende 5 minuten bij 72˚C.
Geamplificeerd DNA zal worden geanalyseerd door middel van agarosegelelektroforese.
Een positief monster geeft banden bij DNA-fragment 138 bp voor cytotoxine-geassocieerd gen A, bij 259/286 bp voor vacuolerende cytotoxine A s1/s2 en respectievelijk 290 bp en 352 bp voor m1 en m2.
|
tot 12 maanden
|
|
Relatie van histopathologisch onderzoek (gastritisclassificatie) tot klinische presentatie en tot resistentie.
Tijdsspanne: tot 12 maanden
|
Histopathologisch onderzoek van endoscopische biopsieën en het detecteren van acute of chronische ontsteking veroorzaakt door H.pylori-bacteriën.
|
tot 12 maanden
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Detectie van het effect van voeding en medicijnen op de respons op de behandeling
Tijdsspanne: tot 12 maanden
|
Detecteer dieetinname (vette en pittige maaltijd), drugsgebruik (zoals NSAID's, antibiotica, protonpompremmers in de afgelopen maand) door middel van vragenlijst.
|
tot 12 maanden
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Liu Y, Wang S, Yang F, Chi W, Ding L, Liu T, Zhu F, Ji D, Zhou J, Fang Y, Zhang J, Xiang P, Zhang Y, Zhao H. Antimicrobial resistance patterns and genetic elements associated with the antibiotic resistance of Helicobacter pylori strains from Shanghai. Gut Pathog. 2022 Mar 30;14(1):14. doi: 10.1186/s13099-022-00488-y.
- Deng L, He XY, Tang B, Xiang Y, Yue JJ. An improved quantitative real-time polymerase chain reaction technology for Helicobacter pylori detection in stomach tissue and its application value in clinical precision testing. BMC Biotechnol. 2020 Jun 22;20(1):33. doi: 10.1186/s12896-020-00624-z.
- Pokhrel N, Khanal B, Rai K, Subedi M, Bhattarai NR. Application of PCR and Microscopy to Detect Helicobacter pylori in Gastric Biopsy Specimen among Acid Peptic Disorders at Tertiary Care Centre in Eastern Nepal. Can J Infect Dis Med Microbiol. 2019 Feb 5;2019:3695307. doi: 10.1155/2019/3695307. eCollection 2019.
Nuttige links
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
- Infecties
- Diagnostische technieken en procedures
- Diagnose
- Chirurgische procedures, operatief
- Minimaal invasieve chirurgische procedures
- Diagnostische technieken, chirurgisch
- Endoscopie, gastro -intestinaal
- Endoscopie, spijsverteringssysteem
- Diagnostische technieken, spijsverteringssysteem
- Endoscopie
- Chirurgische procedures van het spijsverteringssysteem
- Spijsverteringssysteem fysiologische fenomenen
- Spijsverteringssysteem en orale fysiologische fenomenen
- Ontlasting
- Gastroscopie
Andere studie-ID-nummers
- APVGHP
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
product vervaardigd in en geëxporteerd uit de V.S.
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .